MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_007516	GA	3	6	2421129	2421134	50 %	0 %	50 %	0 %	78214109
46002	NC_007516	AGC	2	6	2421195	2421200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46003	NC_007516	GCA	2	6	2421205	2421210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46004	NC_007516	TTCC	2	8	2421260	2421267	0 %	50 %	0 %	50 %	78214109
46005	NC_007516	CAG	2	6	2421344	2421349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46006	NC_007516	GGT	2	6	2421395	2421400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214109
46007	NC_007516	C	6	6	2421424	2421429	0 %	0 %	0 %	100 %	78214109
46008	NC_007516	CAG	2	6	2421477	2421482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46009	NC_007516	GCT	2	6	2421492	2421497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46010	NC_007516	GCT	2	6	2421520	2421525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46011	NC_007516	CTG	2	6	2421539	2421544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46012	NC_007516	GCA	2	6	2421615	2421620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46013	NC_007516	GCT	2	6	2421643	2421648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46014	NC_007516	TGGC	2	8	2421660	2421667	0 %	25 %	50 %	25 %	78214109
46015	NC_007516	CCG	2	6	2421678	2421683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214109
46016	NC_007516	TGG	2	6	2421688	2421693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214109
46017	NC_007516	GCA	2	6	2421706	2421711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46018	NC_007516	GCA	2	6	2421892	2421897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46019	NC_007516	CGA	2	6	2421902	2421907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46020	NC_007516	GAA	2	6	2421927	2421932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214109
46021	NC_007516	TCG	2	6	2421972	2421977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214109
46022	NC_007516	CG	3	6	2421976	2421981	0 %	0 %	50 %	50 %	78214109
46023	NC_007516	TGT	2	6	2422040	2422045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214110
46024	NC_007516	CAC	2	6	2422156	2422161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214110
46025	NC_007516	CTG	2	6	2422163	2422168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214110
46026	NC_007516	GGA	2	6	2422183	2422188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214110
46027	NC_007516	GCC	2	6	2422194	2422199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214110
46028	NC_007516	AC	3	6	2422221	2422226	50 %	0 %	0 %	50 %	78214110
46029	NC_007516	TGG	3	9	2422254	2422262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214110
46030	NC_007516	CCGT	2	8	2422359	2422366	0 %	25 %	25 %	50 %	78214110
46031	NC_007516	ACC	2	6	2422411	2422416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214110
46032	NC_007516	GGT	2	6	2422471	2422476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214110
46033	NC_007516	GATC	2	8	2422547	2422554	25 %	25 %	25 %	25 %	78214110
46034	NC_007516	TC	3	6	2422595	2422600	0 %	50 %	0 %	50 %	78214110
46035	NC_007516	TGTT	2	8	2422635	2422642	0 %	75 %	25 %	0 %	78214110
46036	NC_007516	CTG	2	6	2422649	2422654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214110
46037	NC_007516	CTGG	2	8	2422721	2422728	0 %	25 %	50 %	25 %	78214110
46038	NC_007516	CCG	2	6	2422743	2422748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214110
46039	NC_007516	CTG	2	6	2422799	2422804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214110
46040	NC_007516	TG	3	6	2422970	2422975	0 %	50 %	50 %	0 %	78214110
46041	NC_007516	CGG	2	6	2423015	2423020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214110
46042	NC_007516	GAA	2	6	2423093	2423098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214110
46043	NC_007516	CTG	2	6	2423123	2423128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214110
46044	NC_007516	GCA	2	6	2423231	2423236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214110
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46048	NC_007516	GT	3	6	2423786	2423791	0 %	50 %	50 %	0 %	78214111
46049	NC_007516	GA	3	6	2423854	2423859	50 %	0 %	50 %	0 %	78214111
46050	NC_007516	GGT	2	6	2423861	2423866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214111
46051	NC_007516	T	6	6	2423881	2423886	0 %	100 %	0 %	0 %	78214111
46052	NC_007516	GC	3	6	2423907	2423912	0 %	0 %	50 %	50 %	78214111
46053	NC_007516	TGC	2	6	2423947	2423952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214111
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46057	NC_007516	CGG	2	6	2424162	2424167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214112
46058	NC_007516	CGC	2	6	2424219	2424224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214112
46059	NC_007516	GAAC	2	8	2424266	2424273	50 %	0 %	25 %	25 %	78214112
46060	NC_007516	GCC	2	6	2424332	2424337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214112
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46067	NC_007516	GCA	2	6	2424950	2424955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214113
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46070	NC_007516	GGC	2	6	2425093	2425098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214113
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46090	NC_007516	CAG	2	6	2426224	2426229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214114
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46099	NC_007516	TCG	2	6	2426779	2426784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214115
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46101	NC_007516	GGT	2	6	2426859	2426864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214115
46102	NC_007516	GT	3	6	2426917	2426922	0 %	50 %	50 %	0 %	78214115
46103	NC_007516	CGC	2	6	2427071	2427076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214115
46104	NC_007516	GCTG	2	8	2427101	2427108	0 %	25 %	50 %	25 %	78214115
46105	NC_007516	CCA	2	6	2427823	2427828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214116
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46107	NC_007516	CGG	2	6	2427912	2427917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214116
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46115	NC_007516	TGA	2	6	2428294	2428299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214117
46116	NC_007516	GAT	2	6	2428328	2428333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214117
46117	NC_007516	TCA	2	6	2428359	2428364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214117
46118	NC_007516	AGC	2	6	2428371	2428376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214117
46119	NC_007516	GCT	3	9	2428411	2428419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214117
46120	NC_007516	ACC	2	6	2428424	2428429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214117
46121	NC_007516	CAC	3	9	2428438	2428446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214117
46122	NC_007516	CCA	2	6	2428521	2428526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214117
46123	NC_007516	AAT	2	6	2428577	2428582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78214117
46124	NC_007516	GTT	2	6	2428636	2428641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214117
46125	NC_007516	CAAT	2	8	2428696	2428703	50 %	25 %	0 %	25 %	78214117
46126	NC_007516	TGG	2	6	2428864	2428869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214117
46127	NC_007516	TCA	3	9	2428920	2428928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214118
46128	NC_007516	CCT	2	6	2428972	2428977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214118
46129	NC_007516	TGA	2	6	2429007	2429012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214118
46130	NC_007516	CAA	2	6	2429068	2429073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214118
46131	NC_007516	TTC	2	6	2429123	2429128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214118
46132	NC_007516	AAT	2	6	2429162	2429167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78214118
46133	NC_007516	GAG	2	6	2429321	2429326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214118
46134	NC_007516	GAG	2	6	2429398	2429403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214118
46135	NC_007516	AG	3	6	2429447	2429452	50 %	0 %	50 %	0 %	78214118
46136	NC_007516	CGA	2	6	2429455	2429460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214118
46137	NC_007516	GGAC	2	8	2429496	2429503	25 %	0 %	50 %	25 %	78214118
46138	NC_007516	GTT	2	6	2429529	2429534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214118
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46144	NC_007516	TACCTC	2	12	2429960	2429971	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	78214119
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46146	NC_007516	TCA	3	9	2430148	2430156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214119
46147	NC_007516	GCAAA	2	10	2430204	2430213	60 %	0 %	20 %	20 %	78214119
46148	NC_007516	GTG	2	6	2430298	2430303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214119
46149	NC_007516	CTG	2	6	2430339	2430344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214119
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46219	NC_007516	GCG	2	6	2434042	2434047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214122
46220	NC_007516	CCA	2	6	2434059	2434064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214122
46221	NC_007516	TGC	2	6	2434113	2434118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214122
46222	NC_007516	TCA	2	6	2434119	2434124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214122
46223	NC_007516	CAC	2	6	2434184	2434189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214123
46224	NC_007516	GCT	2	6	2434199	2434204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214123
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46227	NC_007516	GCA	2	6	2434265	2434270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214123
46228	NC_007516	GC	3	6	2434274	2434279	0 %	0 %	50 %	50 %	78214123
46229	NC_007516	GGGA	2	8	2434280	2434287	25 %	0 %	75 %	0 %	78214123
46230	NC_007516	GCA	2	6	2434295	2434300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214123
46231	NC_007516	AGC	2	6	2434386	2434391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214123
46232	NC_007516	CCAGGC	2	12	2434392	2434403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78214123
46233	NC_007516	GCA	2	6	2434463	2434468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214123
46234	NC_007516	GCT	2	6	2434487	2434492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214123
46235	NC_007516	GATC	2	8	2434541	2434548	25 %	25 %	25 %	25 %	78214123
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46239	NC_007516	ACCGC	2	10	2434631	2434640	20 %	0 %	20 %	60 %	78214123
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46347	NC_007516	CCA	2	6	2440149	2440154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214132
46348	NC_007516	GC	3	6	2440250	2440255	0 %	0 %	50 %	50 %	78214132
46349	NC_007516	CCG	2	6	2440314	2440319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214132
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46351	NC_007516	CAT	2	6	2440378	2440383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214132
46352	NC_007516	GGC	3	9	2440386	2440394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214132
46353	NC_007516	AC	3	6	2440446	2440451	50 %	0 %	0 %	50 %	78214132
46354	NC_007516	CAT	2	6	2440452	2440457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214132
46355	NC_007516	CCA	2	6	2440458	2440463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214132
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46357	NC_007516	TGA	2	6	2440493	2440498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214132
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46360	NC_007516	ATC	2	6	2440594	2440599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214132
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46367	NC_007516	GCC	2	6	2440917	2440922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214133
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46450	NC_007516	TGG	2	6	2444967	2444972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214135
46451	NC_007516	CGC	2	6	2445133	2445138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214135
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46464	NC_007516	CAC	2	6	2445971	2445976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214136
46465	NC_007516	GCCGC	2	10	2445982	2445991	0 %	0 %	40 %	60 %	78214136
46466	NC_007516	TCC	2	6	2446044	2446049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214136
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