MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_007516	GTG	2	6	2321170	2321175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214020
44002	NC_007516	CGG	2	6	2321182	2321187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214020
44003	NC_007516	GCAAA	2	10	2321266	2321275	60 %	0 %	20 %	20 %	78214020
44004	NC_007516	CTG	3	9	2321339	2321347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214020
44005	NC_007516	GAGC	2	8	2321418	2321425	25 %	0 %	50 %	25 %	78214020
44006	NC_007516	CAC	2	6	2321483	2321488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214020
44007	NC_007516	TCG	2	6	2321490	2321495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214020
44008	NC_007516	AGA	2	6	2321619	2321624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214020
44009	NC_007516	GCT	2	6	2321632	2321637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214020
44010	NC_007516	AAG	2	6	2321659	2321664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214020
44011	NC_007516	GCT	3	9	2321982	2321990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44012	NC_007516	GTG	2	6	2322106	2322111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214021
44013	NC_007516	CGA	2	6	2322123	2322128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44014	NC_007516	AGG	2	6	2322208	2322213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214021
44015	NC_007516	CCG	2	6	2322257	2322262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214021
44016	NC_007516	CTG	2	6	2322274	2322279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44017	NC_007516	CAG	2	6	2322291	2322296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44018	NC_007516	GAC	2	6	2322307	2322312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44019	NC_007516	GCA	2	6	2322316	2322321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44020	NC_007516	TCCAGA	2	12	2322477	2322488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78214021
44021	NC_007516	TCG	2	6	2322498	2322503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44022	NC_007516	TCC	2	6	2322547	2322552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214021
44023	NC_007516	CGA	2	6	2322609	2322614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44024	NC_007516	CCT	2	6	2322646	2322651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214021
44025	NC_007516	GCG	2	6	2322719	2322724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214021
44026	NC_007516	CAG	2	6	2322758	2322763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44027	NC_007516	TCCA	2	8	2322779	2322786	25 %	25 %	0 %	50 %	78214021
44028	NC_007516	TCT	2	6	2322791	2322796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214021
44029	NC_007516	CAG	2	6	2323007	2323012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44030	NC_007516	CCT	2	6	2323038	2323043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214021
44031	NC_007516	TC	4	8	2323161	2323168	0 %	50 %	0 %	50 %	78214021
44032	NC_007516	CCAG	2	8	2323194	2323201	25 %	0 %	25 %	50 %	78214021
44033	NC_007516	AAG	2	6	2323202	2323207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214021
44034	NC_007516	CTG	2	6	2323216	2323221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44035	NC_007516	GATG	2	8	2323233	2323240	25 %	25 %	50 %	0 %	78214021
44036	NC_007516	TAG	2	6	2323241	2323246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214021
44037	NC_007516	TGA	2	6	2323250	2323255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214021
44038	NC_007516	GGT	2	6	2323350	2323355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214021
44039	NC_007516	GGA	2	6	2323375	2323380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214021
44040	NC_007516	A	6	6	2323436	2323441	100 %	0 %	0 %	0 %	78214021
44041	NC_007516	AGC	2	6	2323444	2323449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44042	NC_007516	CAG	2	6	2323489	2323494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44043	NC_007516	CGC	2	6	2323500	2323505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214021
44044	NC_007516	TC	3	6	2323523	2323528	0 %	50 %	0 %	50 %	78214021
44045	NC_007516	GTG	3	9	2323552	2323560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214021
44046	NC_007516	GCT	2	6	2323595	2323600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44047	NC_007516	CAGC	2	8	2323643	2323650	25 %	0 %	25 %	50 %	78214021
44048	NC_007516	TGA	2	6	2323691	2323696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214021
44049	NC_007516	TGC	2	6	2323698	2323703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214021
44050	NC_007516	GTT	2	6	2323880	2323885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214022
44051	NC_007516	GCG	2	6	2323899	2323904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214022
44052	NC_007516	GCA	2	6	2323917	2323922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44053	NC_007516	CAA	2	6	2323940	2323945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
44054	NC_007516	ATC	2	6	2323962	2323967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214022
44055	NC_007516	CAA	2	6	2323992	2323997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
44056	NC_007516	TGA	2	6	2324009	2324014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214022
44057	NC_007516	GCA	3	9	2324047	2324055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44058	NC_007516	ACA	2	6	2324101	2324106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
44059	NC_007516	CAC	2	6	2324213	2324218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214022
44060	NC_007516	GTG	2	6	2324269	2324274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214022
44061	NC_007516	GGTG	2	8	2324282	2324289	0 %	25 %	75 %	0 %	78214022
44062	NC_007516	CCAG	2	8	2324304	2324311	25 %	0 %	25 %	50 %	78214022
44063	NC_007516	AGC	2	6	2324316	2324321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
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44065	NC_007516	GCA	2	6	2324386	2324391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44066	NC_007516	GCA	2	6	2324476	2324481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44067	NC_007516	CAG	2	6	2324507	2324512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44068	NC_007516	GCA	2	6	2324578	2324583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44069	NC_007516	ACG	2	6	2324605	2324610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214022
44070	NC_007516	GCT	2	6	2324909	2324914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214022
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44072	NC_007516	GGTCA	2	10	2324931	2324940	20 %	20 %	40 %	20 %	78214022
44073	NC_007516	TCAA	2	8	2325064	2325071	50 %	25 %	0 %	25 %	78214022
44074	NC_007516	CAA	2	6	2325109	2325114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
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44076	NC_007516	CAT	2	6	2325161	2325166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214022
44077	NC_007516	CTG	2	6	2325213	2325218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214022
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44080	NC_007516	ATC	2	6	2325258	2325263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214022
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44083	NC_007516	TTGA	2	8	2325378	2325385	25 %	50 %	25 %	0 %	78214022
44084	NC_007516	CAA	2	6	2325419	2325424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
44085	NC_007516	ACA	2	6	2325439	2325444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
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44087	NC_007516	AGA	2	6	2325482	2325487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214022
44088	NC_007516	CAA	2	6	2325502	2325507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214022
44089	NC_007516	ACCC	2	8	2325683	2325690	25 %	0 %	0 %	75 %	78214022
44090	NC_007516	TTC	2	6	2326502	2326507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214023
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44093	NC_007516	GCA	2	6	2326628	2326633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214023
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44100	NC_007516	A	7	7	2327047	2327053	100 %	0 %	0 %	0 %	78214023
44101	NC_007516	A	6	6	2327071	2327076	100 %	0 %	0 %	0 %	78214023
44102	NC_007516	TGG	2	6	2327094	2327099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214023
44103	NC_007516	ATT	2	6	2327137	2327142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78214023
44104	NC_007516	T	7	7	2327150	2327156	0 %	100 %	0 %	0 %	78214023
44105	NC_007516	CAC	2	6	2327171	2327176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214023
44106	NC_007516	GGT	2	6	2327352	2327357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214023
44107	NC_007516	TCAGC	2	10	2327456	2327465	20 %	20 %	20 %	40 %	78214024
44108	NC_007516	CAGG	2	8	2327486	2327493	25 %	0 %	50 %	25 %	78214024
44109	NC_007516	GCA	2	6	2327494	2327499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214024
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44112	NC_007516	CCA	2	6	2327545	2327550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
44113	NC_007516	CCG	2	6	2327569	2327574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
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44117	NC_007516	CCG	2	6	2327668	2327673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
44118	NC_007516	CAC	2	6	2327676	2327681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
44119	NC_007516	GCA	2	6	2327683	2327688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214024
44120	NC_007516	CCA	2	6	2327762	2327767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
44121	NC_007516	CGGCCT	2	12	2327786	2327797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78214024
44122	NC_007516	CTC	2	6	2327874	2327879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214024
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44124	NC_007516	CGGC	2	8	2327909	2327916	0 %	0 %	50 %	50 %	78214024
44125	NC_007516	GCT	2	6	2327939	2327944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214024
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44128	NC_007516	GCC	2	6	2328084	2328089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
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44130	NC_007516	ACC	2	6	2328121	2328126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
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44132	NC_007516	CACCG	2	10	2328162	2328171	20 %	0 %	20 %	60 %	78214024
44133	NC_007516	CCTGCA	2	12	2328200	2328211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78214024
44134	NC_007516	CTG	2	6	2328255	2328260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214024
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44140	NC_007516	TG	3	6	2328393	2328398	0 %	50 %	50 %	0 %	78214024
44141	NC_007516	CCCG	2	8	2328479	2328486	0 %	0 %	25 %	75 %	78214024
44142	NC_007516	CCG	2	6	2328577	2328582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
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44145	NC_007516	CGCC	2	8	2328629	2328636	0 %	0 %	25 %	75 %	78214024
44146	NC_007516	GGT	2	6	2328642	2328647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214024
44147	NC_007516	CAC	2	6	2328663	2328668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
44148	NC_007516	AGG	2	6	2328683	2328688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214024
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44150	NC_007516	CCA	2	6	2328737	2328742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214024
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44152	NC_007516	GC	3	6	2328796	2328801	0 %	0 %	50 %	50 %	78214024
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44154	NC_007516	GCC	2	6	2328820	2328825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
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44156	NC_007516	TGGG	2	8	2328937	2328944	0 %	25 %	75 %	0 %	78214024
44157	NC_007516	CGC	2	6	2328977	2328982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214024
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44202	NC_007516	GAA	2	6	2331129	2331134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214026
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44217	NC_007516	GA	3	6	2331661	2331666	50 %	0 %	50 %	0 %	78214026
44218	NC_007516	TGC	2	6	2331691	2331696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214026
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44220	NC_007516	GCC	2	6	2331854	2331859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214026
44221	NC_007516	TGGCC	2	10	2331872	2331881	0 %	20 %	40 %	40 %	78214026
44222	NC_007516	TGA	2	6	2331970	2331975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214026
44223	NC_007516	CGG	2	6	2331977	2331982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214026
44224	NC_007516	CGA	2	6	2332127	2332132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214026
44225	NC_007516	GCA	2	6	2332223	2332228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214026
44226	NC_007516	ACC	2	6	2332231	2332236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214026
44227	NC_007516	GGCT	2	8	2332314	2332321	0 %	25 %	50 %	25 %	78214026
44228	NC_007516	GAC	2	6	2332362	2332367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214026
44229	NC_007516	GCA	2	6	2332406	2332411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214026
44230	NC_007516	TGC	2	6	2332444	2332449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214026
44231	NC_007516	TGG	2	6	2332450	2332455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214026
44232	NC_007516	CCG	2	6	2332555	2332560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214026
44233	NC_007516	A	6	6	2332566	2332571	100 %	0 %	0 %	0 %	78214026
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44347	NC_007516	A	6	6	2339159	2339164	100 %	0 %	0 %	0 %	78214028
44348	NC_007516	GAT	2	6	2339169	2339174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214028
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44350	NC_007516	GAAGA	2	10	2339196	2339205	60 %	0 %	40 %	0 %	78214028
44351	NC_007516	AAGA	2	8	2339235	2339242	75 %	0 %	25 %	0 %	78214028
44352	NC_007516	GGC	2	6	2339256	2339261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214028
44353	NC_007516	CAT	3	9	2339519	2339527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214029
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44356	NC_007516	TGC	2	6	2339755	2339760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214029
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44359	NC_007516	TGC	2	6	2340082	2340087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214030
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44361	NC_007516	ATC	2	6	2340222	2340227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214030
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44364	NC_007516	CTTCG	2	10	2340447	2340456	0 %	40 %	20 %	40 %	78214030
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44422	NC_007516	GATC	2	8	2342788	2342795	25 %	25 %	25 %	25 %	78214031
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44453	NC_007516	GCCTG	2	10	2344078	2344087	0 %	20 %	40 %	40 %	78214031
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44457	NC_007516	GGC	2	6	2344333	2344338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214032
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44459	NC_007516	CCA	2	6	2344441	2344446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214032
44460	NC_007516	CAG	2	6	2344468	2344473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214032
44461	NC_007516	CCA	2	6	2344503	2344508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214032
44462	NC_007516	GTTC	2	8	2344692	2344699	0 %	50 %	25 %	25 %	78214032
44463	NC_007516	TCA	2	6	2344746	2344751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214032
44464	NC_007516	CGG	2	6	2344760	2344765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214032
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44466	NC_007516	CAG	2	6	2344819	2344824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214032
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44499	NC_007516	CAG	2	6	2346222	2346227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214033
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