MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_007516	TCGCC	2	10	2244418	2244427	0 %	20 %	20 %	60 %	78213945
42502	NC_007516	GCA	2	6	2244433	2244438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213945
42503	NC_007516	CAC	2	6	2244488	2244493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213945
42504	NC_007516	GCC	2	6	2244513	2244518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213945
42505	NC_007516	GAA	2	6	2244577	2244582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213945
42506	NC_007516	GCG	2	6	2244597	2244602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213945
42507	NC_007516	CTG	4	12	2244626	2244637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213945
42508	NC_007516	GCA	2	6	2244688	2244693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213945
42509	NC_007516	GCA	2	6	2244742	2244747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213945
42510	NC_007516	AAAGCG	2	12	2244752	2244763	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78213945
42511	NC_007516	CCG	2	6	2244788	2244793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213946
42512	NC_007516	TGC	2	6	2244870	2244875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213946
42513	NC_007516	CCGG	2	8	2244888	2244895	0 %	0 %	50 %	50 %	78213946
42514	NC_007516	GTG	2	6	2244898	2244903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213946
42515	NC_007516	CAA	2	6	2244955	2244960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213946
42516	NC_007516	CCAGCG	2	12	2245002	2245013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78213946
42517	NC_007516	CAC	2	6	2245066	2245071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213946
42518	NC_007516	GCG	2	6	2245091	2245096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213946
42519	NC_007516	TCC	3	9	2245097	2245105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213946
42520	NC_007516	TGG	2	6	2245109	2245114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213946
42521	NC_007516	AAC	2	6	2245127	2245132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213946
42522	NC_007516	GGT	2	6	2245138	2245143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213946
42523	NC_007516	ACC	2	6	2245217	2245222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213946
42524	NC_007516	GCA	2	6	2245330	2245335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213946
42525	NC_007516	CACCAG	2	12	2245336	2245347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78213946
42526	NC_007516	GCT	2	6	2245363	2245368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213946
42527	NC_007516	CCCCAG	2	12	2245399	2245410	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	78213946
42528	NC_007516	CGG	2	6	2245442	2245447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213946
42529	NC_007516	AGC	3	9	2245535	2245543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213946
42530	NC_007516	GCC	2	6	2245550	2245555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213946
42531	NC_007516	C	6	6	2245565	2245570	0 %	0 %	0 %	100 %	78213946
42532	NC_007516	CAG	2	6	2245621	2245626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213946
42533	NC_007516	TTG	2	6	2245810	2245815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213947
42534	NC_007516	CTC	2	6	2245826	2245831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213947
42535	NC_007516	GATG	2	8	2245848	2245855	25 %	25 %	50 %	0 %	78213947
42536	NC_007516	GCT	2	6	2245876	2245881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42537	NC_007516	GCT	2	6	2245915	2245920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42538	NC_007516	GCC	2	6	2246076	2246081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42539	NC_007516	CAGCC	2	10	2246101	2246110	20 %	0 %	20 %	60 %	78213947
42540	NC_007516	TGC	3	9	2246127	2246135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42541	NC_007516	CTT	2	6	2246143	2246148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213947
42542	NC_007516	GTGA	2	8	2246156	2246163	25 %	25 %	50 %	0 %	78213947
42543	NC_007516	CGC	2	6	2246168	2246173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42544	NC_007516	GGT	2	6	2246182	2246187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213947
42545	NC_007516	TGC	2	6	2246205	2246210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42546	NC_007516	GCTG	2	8	2246244	2246251	0 %	25 %	50 %	25 %	78213947
42547	NC_007516	AAC	2	6	2246322	2246327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213947
42548	NC_007516	TGG	2	6	2246373	2246378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213947
42549	NC_007516	GGC	2	6	2246400	2246405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213947
42550	NC_007516	GCG	2	6	2246451	2246456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213947
42551	NC_007516	GCG	2	6	2246539	2246544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213947
42552	NC_007516	GCA	2	6	2246545	2246550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42553	NC_007516	CTT	2	6	2246596	2246601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213947
42554	NC_007516	GCT	2	6	2246620	2246625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42555	NC_007516	GC	3	6	2246632	2246637	0 %	0 %	50 %	50 %	78213947
42556	NC_007516	CGG	2	6	2246670	2246675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213947
42557	NC_007516	CTG	2	6	2246699	2246704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213947
42558	NC_007516	CCG	2	6	2246719	2246724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42559	NC_007516	TGG	3	9	2246736	2246744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213947
42560	NC_007516	C	6	6	2246781	2246786	0 %	0 %	0 %	100 %	78213947
42561	NC_007516	GCC	4	12	2246787	2246798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42562	NC_007516	CACC	2	8	2246827	2246834	25 %	0 %	0 %	75 %	78213947
42563	NC_007516	CCG	2	6	2246907	2246912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42564	NC_007516	GCCGC	2	10	2246923	2246932	0 %	0 %	40 %	60 %	78213947
42565	NC_007516	GCG	2	6	2246984	2246989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213947
42566	NC_007516	CCG	2	6	2247078	2247083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213947
42567	NC_007516	GC	4	8	2247180	2247187	0 %	0 %	50 %	50 %	78213947
42568	NC_007516	TCA	2	6	2247222	2247227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213948
42569	NC_007516	CGA	2	6	2247303	2247308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213948
42570	NC_007516	CCGC	2	8	2247321	2247328	0 %	0 %	25 %	75 %	78213948
42571	NC_007516	CCAC	2	8	2247395	2247402	25 %	0 %	0 %	75 %	78213948
42572	NC_007516	TGC	2	6	2247411	2247416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213948
42573	NC_007516	CCA	2	6	2247468	2247473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213948
42574	NC_007516	ACGG	2	8	2247500	2247507	25 %	0 %	50 %	25 %	78213948
42575	NC_007516	CAG	2	6	2247559	2247564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213948
42576	NC_007516	C	6	6	2247620	2247625	0 %	0 %	0 %	100 %	78213948
42577	NC_007516	CTG	2	6	2247646	2247651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213948
42578	NC_007516	ACA	2	6	2247663	2247668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213948
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42582	NC_007516	GGCAA	2	10	2247932	2247941	40 %	0 %	40 %	20 %	78213948
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42586	NC_007516	CAG	2	6	2248108	2248113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213949
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42588	NC_007516	GCG	2	6	2248201	2248206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213949
42589	NC_007516	GCC	2	6	2248220	2248225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213949
42590	NC_007516	CAA	2	6	2248534	2248539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213950
42591	NC_007516	AAC	2	6	2248547	2248552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213950
42592	NC_007516	CAG	2	6	2248582	2248587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213950
42593	NC_007516	GCG	2	6	2248605	2248610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213950
42594	NC_007516	CGA	2	6	2248665	2248670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213950
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42598	NC_007516	TGC	3	9	2248874	2248882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213950
42599	NC_007516	AGA	2	6	2248902	2248907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213950
42600	NC_007516	GGA	2	6	2248947	2248952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213950
42601	NC_007516	GATCGA	2	12	2248974	2248985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78213950
42602	NC_007516	CACC	2	8	2249025	2249032	25 %	0 %	0 %	75 %	78213950
42603	NC_007516	GAG	3	9	2249113	2249121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213950
42604	NC_007516	CAC	2	6	2249157	2249162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213950
42605	NC_007516	GCG	2	6	2249174	2249179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213950
42606	NC_007516	GCT	2	6	2249316	2249321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213950
42607	NC_007516	GGC	2	6	2249343	2249348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213950
42608	NC_007516	GAA	2	6	2249455	2249460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213950
42609	NC_007516	GATG	2	8	2249481	2249488	25 %	25 %	50 %	0 %	78213950
42610	NC_007516	AG	3	6	2249532	2249537	50 %	0 %	50 %	0 %	78213950
42611	NC_007516	GCCGAT	2	12	2249545	2249556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213950
42612	NC_007516	GCA	2	6	2249634	2249639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213951
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42614	NC_007516	TGGCT	2	10	2249697	2249706	0 %	40 %	40 %	20 %	78213951
42615	NC_007516	GGA	2	6	2249760	2249765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213952
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