MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_007516	ATCC	2	8	1814049	1814056	25 %	25 %	0 %	50 %	78213512
34002	NC_007516	AGC	2	6	1814117	1814122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34003	NC_007516	GGT	2	6	1814127	1814132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213512
34004	NC_007516	CGG	2	6	1814204	1814209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213512
34005	NC_007516	CTG	2	6	1814239	1814244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34006	NC_007516	TGCCC	2	10	1814340	1814349	0 %	20 %	20 %	60 %	78213512
34007	NC_007516	GATCT	2	10	1814356	1814365	20 %	40 %	20 %	20 %	78213512
34008	NC_007516	CTCA	2	8	1814370	1814377	25 %	25 %	0 %	50 %	78213512
34009	NC_007516	GTGAT	2	10	1814399	1814408	20 %	40 %	40 %	0 %	78213512
34010	NC_007516	CTG	2	6	1814455	1814460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34011	NC_007516	GCG	2	6	1814461	1814466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213512
34012	NC_007516	GATGCC	2	12	1814491	1814502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34013	NC_007516	TGC	2	6	1814612	1814617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34014	NC_007516	CCT	2	6	1814676	1814681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213512
34015	NC_007516	ACG	2	6	1814726	1814731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34016	NC_007516	ACG	2	6	1814807	1814812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
34017	NC_007516	GT	3	6	1814858	1814863	0 %	50 %	50 %	0 %	78213512
34018	NC_007516	AAC	2	6	1814955	1814960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213512
34019	NC_007516	ACG	2	6	1815035	1815040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213513
34020	NC_007516	ACA	2	6	1815041	1815046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213513
34021	NC_007516	AAC	2	6	1815082	1815087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213513
34022	NC_007516	TTG	2	6	1815224	1815229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213513
34023	NC_007516	CCG	2	6	1815269	1815274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213513
34024	NC_007516	GTCGAT	2	12	1815312	1815323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78213513
34025	NC_007516	GAGCT	2	10	1815353	1815362	20 %	20 %	40 %	20 %	78213513
34026	NC_007516	GCC	2	6	1815376	1815381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213513
34027	NC_007516	ACC	2	6	1815496	1815501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213513
34028	NC_007516	CCA	2	6	1815641	1815646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213513
34029	NC_007516	GAG	2	6	1815784	1815789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213513
34030	NC_007516	AGG	2	6	1815818	1815823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213513
34031	NC_007516	TGG	2	6	1815833	1815838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213513
34032	NC_007516	TGC	2	6	1815852	1815857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213513
34033	NC_007516	CGC	4	12	1815858	1815869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213513
34034	NC_007516	TGG	2	6	1815914	1815919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213513
34035	NC_007516	TGC	2	6	1815920	1815925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213513
34036	NC_007516	CTC	2	6	1815948	1815953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213513
34037	NC_007516	CAT	2	6	1815981	1815986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213513
34038	NC_007516	GGA	2	6	1816184	1816189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213514
34039	NC_007516	TCT	3	9	1816214	1816222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213514
34040	NC_007516	AGG	2	6	1816282	1816287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213514
34041	NC_007516	CAA	2	6	1816376	1816381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213514
34042	NC_007516	GTG	2	6	1816408	1816413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213514
34043	NC_007516	GAG	2	6	1816425	1816430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213514
34044	NC_007516	AG	4	8	1816461	1816468	50 %	0 %	50 %	0 %	78213514
34045	NC_007516	TCGA	2	8	1816490	1816497	25 %	25 %	25 %	25 %	78213514
34046	NC_007516	TGCT	2	8	1816527	1816534	0 %	50 %	25 %	25 %	78213514
34047	NC_007516	AAC	2	6	1816564	1816569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213514
34048	NC_007516	GGCA	2	8	1816789	1816796	25 %	0 %	50 %	25 %	78213515
34049	NC_007516	AGC	2	6	1816831	1816836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213515
34050	NC_007516	TG	3	6	1817064	1817069	0 %	50 %	50 %	0 %	78213515
34051	NC_007516	GA	3	6	1817074	1817079	50 %	0 %	50 %	0 %	78213515
34052	NC_007516	ACA	2	6	1817114	1817119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213515
34053	NC_007516	CTT	2	6	1817122	1817127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213515
34054	NC_007516	A	6	6	1817288	1817293	100 %	0 %	0 %	0 %	78213515
34055	NC_007516	TAAT	2	8	1817459	1817466	50 %	50 %	0 %	0 %	78213516
34056	NC_007516	GAA	2	6	1817515	1817520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213516
34057	NC_007516	CAA	2	6	1817522	1817527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213516
34058	NC_007516	CTG	2	6	1817544	1817549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34059	NC_007516	GCA	2	6	1817680	1817685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34060	NC_007516	TCA	2	6	1817701	1817706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213516
34061	NC_007516	CGA	2	6	1817743	1817748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34062	NC_007516	AGC	2	6	1817793	1817798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34063	NC_007516	CAA	2	6	1817807	1817812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213516
34064	NC_007516	AC	3	6	1817822	1817827	50 %	0 %	0 %	50 %	78213516
34065	NC_007516	ATC	2	6	1817841	1817846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213516
34066	NC_007516	TCGAA	2	10	1817917	1817926	40 %	20 %	20 %	20 %	78213516
34067	NC_007516	GCA	2	6	1818000	1818005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34068	NC_007516	A	6	6	1818080	1818085	100 %	0 %	0 %	0 %	78213516
34069	NC_007516	GTT	2	6	1818088	1818093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213516
34070	NC_007516	CTG	2	6	1818152	1818157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34071	NC_007516	ACT	2	6	1818172	1818177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213516
34072	NC_007516	AG	3	6	1818227	1818232	50 %	0 %	50 %	0 %	78213516
34073	NC_007516	AAG	2	6	1818363	1818368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213516
34074	NC_007516	CG	3	6	1818375	1818380	0 %	0 %	50 %	50 %	78213516
34075	NC_007516	AGG	2	6	1818429	1818434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213516
34076	NC_007516	AT	3	6	1818447	1818452	50 %	50 %	0 %	0 %	78213516
34077	NC_007516	GAC	2	6	1818454	1818459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34078	NC_007516	CTC	3	9	1818486	1818494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213516
34079	NC_007516	GAT	2	6	1818593	1818598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213516
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34083	NC_007516	TGGCA	2	10	1818778	1818787	20 %	20 %	40 %	20 %	78213516
34084	NC_007516	TGC	2	6	1818881	1818886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213516
34085	NC_007516	CAA	2	6	1818899	1818904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213516
34086	NC_007516	CAA	2	6	1819041	1819046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213516
34087	NC_007516	AGG	2	6	1819086	1819091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213516
34088	NC_007516	CCA	2	6	1819097	1819102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213516
34089	NC_007516	GAA	2	6	1819162	1819167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213516
34090	NC_007516	CAA	2	6	1819460	1819465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213516
34091	NC_007516	GTC	2	6	1819474	1819479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213516
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34093	NC_007516	CAA	2	6	1819589	1819594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213517
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34096	NC_007516	ACC	2	6	1819720	1819725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213517
34097	NC_007516	CGA	2	6	1819781	1819786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213517
34098	NC_007516	AAAT	2	8	1819806	1819813	75 %	25 %	0 %	0 %	78213517
34099	NC_007516	GAT	2	6	1819834	1819839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213517
34100	NC_007516	CAA	2	6	1819926	1819931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213517
34101	NC_007516	CAATC	2	10	1820092	1820101	40 %	20 %	0 %	40 %	78213518
34102	NC_007516	CGT	2	6	1820115	1820120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213518
34103	NC_007516	TCT	2	6	1820134	1820139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213518
34104	NC_007516	AG	3	6	1820171	1820176	50 %	0 %	50 %	0 %	78213518
34105	NC_007516	GTCAAG	2	12	1820177	1820188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78213518
34106	NC_007516	CGA	2	6	1820230	1820235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213518
34107	NC_007516	CCA	2	6	1820314	1820319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213518
34108	NC_007516	ATT	2	6	1820330	1820335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78213518
34109	NC_007516	CTG	2	6	1820344	1820349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213518
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34111	NC_007516	CAGA	2	8	1820389	1820396	50 %	0 %	25 %	25 %	78213518
34112	NC_007516	CAA	2	6	1820407	1820412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213518
34113	NC_007516	AC	3	6	1820479	1820484	50 %	0 %	0 %	50 %	78213518
34114	NC_007516	AAC	2	6	1820498	1820503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213518
34115	NC_007516	CGG	2	6	1820506	1820511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213518
34116	NC_007516	CTT	2	6	1820609	1820614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213518
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34118	NC_007516	CTC	2	6	1820888	1820893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213518
34119	NC_007516	TCCT	2	8	1820912	1820919	0 %	50 %	0 %	50 %	78213518
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34122	NC_007516	GAT	2	6	1821067	1821072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213518
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34231	NC_007516	A	6	6	1826743	1826748	100 %	0 %	0 %	0 %	78213523
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34470	NC_007516	GCA	2	6	1838207	1838212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213535
34471	NC_007516	GCC	2	6	1838215	1838220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213535
34472	NC_007516	CAACAG	2	12	1838229	1838240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78213535
34473	NC_007516	CAG	2	6	1838283	1838288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213535
34474	NC_007516	ACCG	2	8	1838290	1838297	25 %	0 %	25 %	50 %	78213535
34475	NC_007516	GCG	2	6	1838369	1838374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213535
34476	NC_007516	CAG	3	9	1838433	1838441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213535
34477	NC_007516	GCCCA	2	10	1838442	1838451	20 %	0 %	20 %	60 %	78213535
34478	NC_007516	CAG	3	9	1838526	1838534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213535
34479	NC_007516	CAG	2	6	1838541	1838546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213535
34480	NC_007516	CCA	2	6	1838547	1838552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213535
34481	NC_007516	CGG	2	6	1838560	1838565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213535
34482	NC_007516	GCC	2	6	1838577	1838582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213535
34483	NC_007516	GTGA	2	8	1839004	1839011	25 %	25 %	50 %	0 %	78213536
34484	NC_007516	GTG	2	6	1839016	1839021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213536
34485	NC_007516	GATG	2	8	1839060	1839067	25 %	25 %	50 %	0 %	78213536
34486	NC_007516	GTG	2	6	1839073	1839078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213536
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34490	NC_007516	ACC	2	6	1839414	1839419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213537
34491	NC_007516	CTC	2	6	1839455	1839460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213537
34492	NC_007516	GCCTG	2	10	1839481	1839490	0 %	20 %	40 %	40 %	78213537
34493	NC_007516	GCG	2	6	1839491	1839496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213537
34494	NC_007516	GCT	2	6	1839527	1839532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213537
34495	NC_007516	GGC	2	6	1839545	1839550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213537
34496	NC_007516	GCG	2	6	1839563	1839568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213537
34497	NC_007516	CAC	3	9	1839575	1839583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213537
34498	NC_007516	CCT	2	6	1839619	1839624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213537
34499	NC_007516	CAG	2	6	1839625	1839630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213537
34500	NC_007516	CCA	2	6	1839661	1839666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213537

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