MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_007516	GCG	2	6	821202	821207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212395
16002	NC_007516	TGA	2	6	821208	821213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212395
16003	NC_007516	TGC	2	6	821256	821261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212396
16004	NC_007516	CGG	2	6	821269	821274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16005	NC_007516	TCG	2	6	821334	821339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212396
16006	NC_007516	GATC	2	8	821344	821351	25 %	25 %	25 %	25 %	78212396
16007	NC_007516	GGT	2	6	821407	821412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212396
16008	NC_007516	GCG	2	6	821426	821431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16009	NC_007516	G	7	7	821476	821482	0 %	0 %	100 %	0 %	78212396
16010	NC_007516	GGC	2	6	821515	821520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16011	NC_007516	GC	3	6	821524	821529	0 %	0 %	50 %	50 %	78212396
16012	NC_007516	GAT	2	6	821570	821575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212396
16013	NC_007516	CTG	2	6	821593	821598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212396
16014	NC_007516	CGC	2	6	821662	821667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212396
16015	NC_007516	CGG	2	6	821681	821686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16016	NC_007516	GGC	2	6	821749	821754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16017	NC_007516	GC	3	6	821774	821779	0 %	0 %	50 %	50 %	78212396
16018	NC_007516	CGC	2	6	821854	821859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212396
16019	NC_007516	CGGTG	2	10	821860	821869	0 %	20 %	60 %	20 %	78212396
16020	NC_007516	GGC	2	6	821872	821877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212396
16021	NC_007516	TGG	2	6	821922	821927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212396
16022	NC_007516	GCA	2	6	822020	822025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212396
16023	NC_007516	CAG	2	6	822026	822031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212396
16024	NC_007516	TGG	2	6	822078	822083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212396
16025	NC_007516	CCA	2	6	822084	822089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212396
16026	NC_007516	AGCC	2	8	822132	822139	25 %	0 %	25 %	50 %	78212396
16027	NC_007516	TGA	2	6	822175	822180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212396
16028	NC_007516	GAG	2	6	822194	822199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212396
16029	NC_007516	TTG	2	6	822278	822283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212396
16030	NC_007516	G	7	7	822461	822467	0 %	0 %	100 %	0 %	78212397
16031	NC_007516	TGG	2	6	822493	822498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212397
16032	NC_007516	CGT	2	6	822508	822513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212397
16033	NC_007516	GGA	2	6	822515	822520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212397
16034	NC_007516	CGA	2	6	822575	822580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212397
16035	NC_007516	TGG	2	6	822655	822660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212397
16036	NC_007516	CAC	2	6	822677	822682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212397
16037	NC_007516	CCG	2	6	822683	822688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212397
16038	NC_007516	TTGT	2	8	822693	822700	0 %	75 %	25 %	0 %	78212397
16039	NC_007516	TGC	2	6	822739	822744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212397
16040	NC_007516	GCCT	2	8	822754	822761	0 %	25 %	25 %	50 %	78212397
16041	NC_007516	TCG	2	6	822799	822804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212397
16042	NC_007516	TCC	2	6	822805	822810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212397
16043	NC_007516	GTG	2	6	822876	822881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212398
16044	NC_007516	CTG	2	6	822908	822913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16045	NC_007516	CCTG	2	8	822934	822941	0 %	25 %	25 %	50 %	78212398
16046	NC_007516	CCG	2	6	823017	823022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212398
16047	NC_007516	TGC	2	6	823047	823052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16048	NC_007516	CAG	2	6	823162	823167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16049	NC_007516	TG	3	6	823181	823186	0 %	50 %	50 %	0 %	78212398
16050	NC_007516	GCA	2	6	823306	823311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16051	NC_007516	TGG	2	6	823341	823346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212398
16052	NC_007516	CGT	2	6	823397	823402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16053	NC_007516	GCC	2	6	823406	823411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212398
16054	NC_007516	GGC	2	6	823415	823420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212398
16055	NC_007516	TGG	2	6	823426	823431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212398
16056	NC_007516	CCT	2	6	823442	823447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212398
16057	NC_007516	GTT	2	6	823483	823488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212398
16058	NC_007516	CGG	2	6	823551	823556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212398
16059	NC_007516	GCT	2	6	823570	823575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16060	NC_007516	CAG	2	6	823627	823632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16061	NC_007516	GCA	2	6	823682	823687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16062	NC_007516	GCGG	2	8	823738	823745	0 %	0 %	75 %	25 %	78212398
16063	NC_007516	CAC	2	6	823755	823760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212398
16064	NC_007516	CGGTGG	2	12	823809	823820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78212398
16065	NC_007516	CTG	2	6	823877	823882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16066	NC_007516	CAC	2	6	823942	823947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212398
16067	NC_007516	CCGC	2	8	823952	823959	0 %	0 %	25 %	75 %	78212398
16068	NC_007516	TTC	2	6	823962	823967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212398
16069	NC_007516	TGC	2	6	823986	823991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16070	NC_007516	GATCT	2	10	824009	824018	20 %	40 %	20 %	20 %	78212398
16071	NC_007516	TCC	2	6	824056	824061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212398
16072	NC_007516	GTC	2	6	824095	824100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212398
16073	NC_007516	CGCCA	2	10	824129	824138	20 %	0 %	20 %	60 %	78212399
16074	NC_007516	GGAGCT	2	12	824191	824202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78212399
16075	NC_007516	GGA	2	6	824206	824211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212399
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16078	NC_007516	CCGC	2	8	824305	824312	0 %	0 %	25 %	75 %	78212399
16079	NC_007516	GGCT	2	8	824334	824341	0 %	25 %	50 %	25 %	78212399
16080	NC_007516	GTGC	2	8	824407	824414	0 %	25 %	50 %	25 %	78212399
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16085	NC_007516	CCA	2	6	824586	824591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212399
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16087	NC_007516	TTG	2	6	824601	824606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212399
16088	NC_007516	CGCTG	2	10	824631	824640	0 %	20 %	40 %	40 %	78212399
16089	NC_007516	TCA	2	6	824710	824715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212399
16090	NC_007516	GATG	2	8	824725	824732	25 %	25 %	50 %	0 %	78212399
16091	NC_007516	CAT	2	6	824767	824772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212399
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16094	NC_007516	TCT	2	6	824971	824976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212399
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16096	NC_007516	CAGC	2	8	825027	825034	25 %	0 %	25 %	50 %	78212399
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16098	NC_007516	GAGCT	2	10	825089	825098	20 %	20 %	40 %	20 %	78212399
16099	NC_007516	ACCAC	2	10	825102	825111	40 %	0 %	0 %	60 %	78212399
16100	NC_007516	ACCT	2	8	825143	825150	25 %	25 %	0 %	50 %	78212399
16101	NC_007516	GGC	2	6	825187	825192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212399
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16104	NC_007516	GGC	2	6	825265	825270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212399
16105	NC_007516	GAC	2	6	825320	825325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212399
16106	NC_007516	GTT	2	6	825346	825351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212399
16107	NC_007516	CGG	2	6	825379	825384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212399
16108	NC_007516	GGC	2	6	825412	825417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212399
16109	NC_007516	GAG	2	6	825473	825478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212399
16110	NC_007516	CAG	2	6	825492	825497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212400
16111	NC_007516	CGC	2	6	825550	825555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212400
16112	NC_007516	ATC	2	6	825569	825574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212400
16113	NC_007516	GCT	2	6	825629	825634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212400
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16116	NC_007516	GT	3	6	825877	825882	0 %	50 %	50 %	0 %	78212400
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16119	NC_007516	CGC	2	6	826050	826055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212401
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16121	NC_007516	CCAT	2	8	826114	826121	25 %	25 %	0 %	50 %	78212401
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16243	NC_007516	GGCTGC	2	12	837364	837375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212410
16244	NC_007516	TGC	2	6	837438	837443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212410
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16265	NC_007516	GA	3	6	838357	838362	50 %	0 %	50 %	0 %	78212410
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16274	NC_007516	CACC	2	8	839171	839178	25 %	0 %	0 %	75 %	78212412
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16349	NC_007516	CTGGT	2	10	842242	842251	0 %	40 %	40 %	20 %	78212414
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16363	NC_007516	TGC	2	6	842736	842741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212415
16364	NC_007516	GCC	2	6	842794	842799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212415
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16366	NC_007516	TGG	2	6	842820	842825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212415
16367	NC_007516	TGG	2	6	842853	842858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212415
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16371	NC_007516	ATC	2	6	842945	842950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212415
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16380	NC_007516	ATCG	2	8	843258	843265	25 %	25 %	25 %	25 %	78212416
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