MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007516	ACG	2	6	736374	736379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14502	NC_007516	TTA	2	6	736411	736416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212315
14503	NC_007516	CTG	2	6	736476	736481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14504	NC_007516	CTT	2	6	736516	736521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212315
14505	NC_007516	CTG	3	9	736622	736630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14506	NC_007516	GTC	3	9	736741	736749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14507	NC_007516	CG	3	6	736753	736758	0 %	0 %	50 %	50 %	78212315
14508	NC_007516	GAT	2	6	736961	736966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212315
14509	NC_007516	GCA	3	9	736969	736977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14510	NC_007516	CTTC	2	8	737044	737051	0 %	50 %	0 %	50 %	78212315
14511	NC_007516	GCC	2	6	737089	737094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212315
14512	NC_007516	CTG	2	6	737106	737111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212315
14513	NC_007516	AGC	2	6	737251	737256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14514	NC_007516	CCA	2	6	737261	737266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212316
14515	NC_007516	TGC	2	6	737273	737278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14516	NC_007516	GTG	2	6	737350	737355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212316
14517	NC_007516	CTG	2	6	737456	737461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14518	NC_007516	CAG	2	6	737508	737513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14519	NC_007516	CCG	2	6	737617	737622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212316
14520	NC_007516	TGC	2	6	737638	737643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14521	NC_007516	ACG	2	6	737731	737736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14522	NC_007516	ATC	2	6	737752	737757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212316
14523	NC_007516	GCA	2	6	737768	737773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212316
14524	NC_007516	CGAT	2	8	738194	738201	25 %	25 %	25 %	25 %	78212317
14525	NC_007516	GAA	2	6	738232	738237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212317
14526	NC_007516	TTC	2	6	738270	738275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212317
14527	NC_007516	CAA	2	6	738328	738333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212317
14528	NC_007516	GTT	2	6	738352	738357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212317
14529	NC_007516	T	8	8	738365	738372	0 %	100 %	0 %	0 %	78212317
14530	NC_007516	GTCG	2	8	738395	738402	0 %	25 %	50 %	25 %	78212317
14531	NC_007516	GGC	2	6	738409	738414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212317
14532	NC_007516	CT	4	8	738465	738472	0 %	50 %	0 %	50 %	78212317
14533	NC_007516	TGG	2	6	738489	738494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212317
14534	NC_007516	GGC	2	6	738517	738522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212317
14535	NC_007516	TGG	2	6	738540	738545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212317
14536	NC_007516	T	6	6	738588	738593	0 %	100 %	0 %	0 %	78212317
14537	NC_007516	TCGA	2	8	738614	738621	25 %	25 %	25 %	25 %	78212317
14538	NC_007516	CTT	2	6	738626	738631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212317
14539	NC_007516	T	7	7	738633	738639	0 %	100 %	0 %	0 %	78212317
14540	NC_007516	AT	3	6	738664	738669	50 %	50 %	0 %	0 %	78212317
14541	NC_007516	GCAA	2	8	738676	738683	50 %	0 %	25 %	25 %	78212317
14542	NC_007516	A	8	8	738682	738689	100 %	0 %	0 %	0 %	78212317
14543	NC_007516	AGC	2	6	739091	739096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212318
14544	NC_007516	CCG	2	6	739127	739132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212318
14545	NC_007516	ACA	2	6	739141	739146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212318
14546	NC_007516	GAA	2	6	739155	739160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212318
14547	NC_007516	CTC	2	6	739174	739179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212318
14548	NC_007516	CCA	2	6	739531	739536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212319
14549	NC_007516	CTC	2	6	739537	739542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212319
14550	NC_007516	AGC	2	6	739577	739582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212319
14551	NC_007516	GGAG	2	8	739586	739593	25 %	0 %	75 %	0 %	78212319
14552	NC_007516	TGGC	2	8	739605	739612	0 %	25 %	50 %	25 %	78212319
14553	NC_007516	TTG	2	6	739626	739631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212319
14554	NC_007516	CTG	2	6	739640	739645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212319
14555	NC_007516	GATC	2	8	739855	739862	25 %	25 %	25 %	25 %	78212320
14556	NC_007516	GGTA	2	8	739896	739903	25 %	25 %	50 %	0 %	78212320
14557	NC_007516	GGC	2	6	740618	740623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212321
14558	NC_007516	ATT	2	6	740626	740631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212321
14559	NC_007516	AATG	2	8	740692	740699	50 %	25 %	25 %	0 %	78212321
14560	NC_007516	AGG	2	6	740768	740773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212321
14561	NC_007516	AAAG	2	8	740808	740815	75 %	0 %	25 %	0 %	78212321
14562	NC_007516	TGG	2	6	741013	741018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212322
14563	NC_007516	GAT	2	6	741048	741053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212322
14564	NC_007516	GA	3	6	741068	741073	50 %	0 %	50 %	0 %	78212322
14565	NC_007516	GCT	2	6	741074	741079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212322
14566	NC_007516	TGA	2	6	741080	741085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212322
14567	NC_007516	CTG	2	6	741164	741169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212322
14568	NC_007516	TGAT	2	8	741214	741221	25 %	50 %	25 %	0 %	78212322
14569	NC_007516	GA	3	6	741229	741234	50 %	0 %	50 %	0 %	78212322
14570	NC_007516	TCA	2	6	741264	741269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212322
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14572	NC_007516	GAG	2	6	741315	741320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212322
14573	NC_007516	ACGA	2	8	741325	741332	50 %	0 %	25 %	25 %	78212322
14574	NC_007516	AAG	2	6	741404	741409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212322
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14578	NC_007516	CTT	2	6	742013	742018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212323
14579	NC_007516	CGT	2	6	742022	742027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
14580	NC_007516	TAGT	2	8	742052	742059	25 %	50 %	25 %	0 %	78212323
14581	NC_007516	ATTCGT	2	12	742115	742126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78212323
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14588	NC_007516	AAAC	2	8	742327	742334	75 %	0 %	0 %	25 %	78212323
14589	NC_007516	GTTG	2	8	742346	742353	0 %	50 %	50 %	0 %	78212323
14590	NC_007516	GCTT	2	8	742388	742395	0 %	50 %	25 %	25 %	78212323
14591	NC_007516	CTT	2	6	742404	742409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212323
14592	NC_007516	GCT	2	6	742427	742432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
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14599	NC_007516	TGGAT	2	10	743263	743272	20 %	40 %	40 %	0 %	78212324
14600	NC_007516	CGT	2	6	743347	743352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
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14603	NC_007516	AAG	2	6	743526	743531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212324
14604	NC_007516	GTAG	2	8	743611	743618	25 %	25 %	50 %	0 %	78212324
14605	NC_007516	TTC	2	6	743647	743652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212324
14606	NC_007516	TCT	2	6	743656	743661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212324
14607	NC_007516	TGCT	2	8	743669	743676	0 %	50 %	25 %	25 %	78212324
14608	NC_007516	GCT	3	9	743719	743727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
14609	NC_007516	GCAAG	2	10	743745	743754	40 %	0 %	40 %	20 %	78212324
14610	NC_007516	GAC	2	6	743808	743813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212324
14611	NC_007516	GCT	2	6	743853	743858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
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14613	NC_007516	TGA	2	6	743897	743902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212324
14614	NC_007516	CAT	2	6	744047	744052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212325
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14616	NC_007516	CTG	2	6	744109	744114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212325
14617	NC_007516	CCAC	2	8	744130	744137	25 %	0 %	0 %	75 %	78212325
14618	NC_007516	TGA	2	6	744187	744192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212325
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14620	NC_007516	ACG	2	6	744652	744657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212326
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14984	NC_007516	CCT	2	6	764378	764383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212343
14985	NC_007516	TGATC	2	10	764429	764438	20 %	40 %	20 %	20 %	78212343
14986	NC_007516	TGG	2	6	764494	764499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
14987	NC_007516	TCGA	2	8	764538	764545	25 %	25 %	25 %	25 %	78212343
14988	NC_007516	GTG	2	6	764697	764702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
14989	NC_007516	CTT	2	6	764708	764713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212343
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14992	NC_007516	TGG	2	6	764881	764886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
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