MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007516	GGC	2	6	663331	663336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13002	NC_007516	TTG	2	6	663351	663356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212243
13003	NC_007516	TGG	2	6	663385	663390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212243
13004	NC_007516	CAC	2	6	663406	663411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212243
13005	NC_007516	CAG	2	6	663422	663427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13006	NC_007516	CAG	2	6	663464	663469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13007	NC_007516	CAC	2	6	663476	663481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212243
13008	NC_007516	TGC	2	6	663523	663528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13009	NC_007516	TCC	2	6	663552	663557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212243
13010	NC_007516	GCG	2	6	663579	663584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13011	NC_007516	GGC	2	6	663614	663619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13012	NC_007516	CCG	2	6	663664	663669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212243
13013	NC_007516	GGC	2	6	663689	663694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13014	NC_007516	CCG	2	6	663696	663701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212243
13015	NC_007516	GCG	2	6	663758	663763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13016	NC_007516	GGAA	2	8	663817	663824	50 %	0 %	50 %	0 %	78212243
13017	NC_007516	ATA	2	6	663837	663842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78212243
13018	NC_007516	CAG	2	6	663941	663946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13019	NC_007516	CGCC	2	8	663949	663956	0 %	0 %	25 %	75 %	78212243
13020	NC_007516	CT	3	6	663998	664003	0 %	50 %	0 %	50 %	78212243
13021	NC_007516	GCA	2	6	664102	664107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13022	NC_007516	CAC	2	6	664145	664150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212243
13023	NC_007516	GCA	2	6	664165	664170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13024	NC_007516	CGG	2	6	664267	664272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
13025	NC_007516	CAG	3	9	664292	664300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
13026	NC_007516	CAA	2	6	664502	664507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212244
13027	NC_007516	TGG	2	6	664560	664565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212244
13028	NC_007516	GAC	2	6	664571	664576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212244
13029	NC_007516	GC	3	6	664730	664735	0 %	0 %	50 %	50 %	78212244
13030	NC_007516	GCA	2	6	664804	664809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212244
13031	NC_007516	GATC	2	8	664818	664825	25 %	25 %	25 %	25 %	78212244
13032	NC_007516	GAG	2	6	664829	664834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212244
13033	NC_007516	CTT	2	6	664895	664900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212244
13034	NC_007516	CAG	2	6	664904	664909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212244
13035	NC_007516	CGC	2	6	664918	664923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212244
13036	NC_007516	C	6	6	665233	665238	0 %	0 %	0 %	100 %	78212245
13037	NC_007516	CCG	2	6	665310	665315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212245
13038	NC_007516	CTC	2	6	665350	665355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212245
13039	NC_007516	GGA	2	6	665401	665406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212245
13040	NC_007516	ACG	2	6	665514	665519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212245
13041	NC_007516	GCA	2	6	665568	665573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212245
13042	NC_007516	CGC	2	6	665584	665589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212245
13043	NC_007516	GGA	2	6	665599	665604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212245
13044	NC_007516	CGT	2	6	665647	665652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212245
13045	NC_007516	GATG	2	8	665660	665667	25 %	25 %	50 %	0 %	78212245
13046	NC_007516	GGTT	2	8	665765	665772	0 %	50 %	50 %	0 %	78212246
13047	NC_007516	CCA	2	6	665799	665804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212246
13048	NC_007516	CAG	2	6	665825	665830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212246
13049	NC_007516	CAA	2	6	665902	665907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212246
13050	NC_007516	CAA	2	6	665911	665916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212246
13051	NC_007516	CAC	2	6	666049	666054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212246
13052	NC_007516	GCA	2	6	666195	666200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212247
13053	NC_007516	CGAG	2	8	666229	666236	25 %	0 %	50 %	25 %	78212247
13054	NC_007516	GCT	2	6	666296	666301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212247
13055	NC_007516	TGT	2	6	666327	666332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212247
13056	NC_007516	GCA	2	6	666371	666376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212247
13057	NC_007516	GCT	2	6	666416	666421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212247
13058	NC_007516	TCC	2	6	666461	666466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212247
13059	NC_007516	GTC	2	6	666502	666507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212247
13060	NC_007516	CAG	2	6	666606	666611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212248
13061	NC_007516	CCA	2	6	666614	666619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212248
13062	NC_007516	TTC	2	6	666672	666677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212248
13063	NC_007516	CAGC	2	8	666788	666795	25 %	0 %	25 %	50 %	78212248
13064	NC_007516	CGC	2	6	666838	666843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212248
13065	NC_007516	CAC	2	6	666855	666860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212248
13066	NC_007516	CTG	2	6	666876	666881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212248
13067	NC_007516	AGC	2	6	666940	666945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212248
13068	NC_007516	GCA	2	6	666962	666967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212248
13069	NC_007516	TGC	2	6	667060	667065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212248
13070	NC_007516	CCA	2	6	667121	667126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212248
13071	NC_007516	GTA	2	6	667163	667168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212248
13072	NC_007516	GCA	3	9	667226	667234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212248
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13074	NC_007516	AGA	2	6	667315	667320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212248
13075	NC_007516	CAG	2	6	667335	667340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212248
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13078	NC_007516	CTG	2	6	667434	667439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212248
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13080	NC_007516	GC	3	6	667540	667545	0 %	0 %	50 %	50 %	78212248
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13084	NC_007516	CTG	2	6	667677	667682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212248
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13089	NC_007516	TCG	2	6	668218	668223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212249
13090	NC_007516	CCT	2	6	668247	668252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212249
13091	NC_007516	CG	3	6	668284	668289	0 %	0 %	50 %	50 %	78212249
13092	NC_007516	TGC	2	6	668386	668391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212249
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13101	NC_007516	CCAG	2	8	668769	668776	25 %	0 %	25 %	50 %	78212250
13102	NC_007516	GGC	2	6	668785	668790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212250
13103	NC_007516	GTG	2	6	668793	668798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212250
13104	NC_007516	CAG	2	6	668845	668850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13105	NC_007516	CTG	2	6	668858	668863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13106	NC_007516	GTT	2	6	668874	668879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212250
13107	NC_007516	GATC	2	8	668889	668896	25 %	25 %	25 %	25 %	78212250
13108	NC_007516	CAC	2	6	668986	668991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212250
13109	NC_007516	TGG	2	6	668993	668998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212250
13110	NC_007516	GCT	2	6	669090	669095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
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13112	NC_007516	GAGG	2	8	669136	669143	25 %	0 %	75 %	0 %	78212250
13113	NC_007516	CTG	3	9	669164	669172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13114	NC_007516	TGC	2	6	669180	669185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13115	NC_007516	GAG	2	6	669193	669198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212250
13116	NC_007516	CCA	2	6	669202	669207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212250
13117	NC_007516	GCT	2	6	669214	669219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13118	NC_007516	G	6	6	669223	669228	0 %	0 %	100 %	0 %	78212250
13119	NC_007516	GCT	2	6	669246	669251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13120	NC_007516	CCG	2	6	669255	669260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212250
13121	NC_007516	TCA	2	6	669276	669281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212250
13122	NC_007516	GCA	4	12	669312	669323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13123	NC_007516	C	6	6	669455	669460	0 %	0 %	0 %	100 %	78212250
13124	NC_007516	AGC	2	6	669470	669475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13125	NC_007516	CGT	3	9	669510	669518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13126	NC_007516	CCA	2	6	669581	669586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212250
13127	NC_007516	CTG	2	6	669587	669592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13128	NC_007516	CTGATC	2	12	669628	669639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78212250
13129	NC_007516	GCT	3	9	669679	669687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13130	NC_007516	CCT	2	6	669716	669721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212250
13131	NC_007516	GCG	2	6	669722	669727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212250
13132	NC_007516	CAGG	2	8	669802	669809	25 %	0 %	50 %	25 %	78212250
13133	NC_007516	CTG	2	6	669862	669867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212250
13134	NC_007516	CCTCG	2	10	669868	669877	0 %	20 %	20 %	60 %	78212250
13135	NC_007516	CGA	2	6	669888	669893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212250
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13138	NC_007516	CTG	2	6	670003	670008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212251
13139	NC_007516	GAGGT	2	10	670038	670047	20 %	20 %	60 %	0 %	78212251
13140	NC_007516	CAC	2	6	670058	670063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212251
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13142	NC_007516	ACC	2	6	670095	670100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212251
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13144	NC_007516	CGT	2	6	670186	670191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212251
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13147	NC_007516	CGGA	2	8	670251	670258	25 %	0 %	50 %	25 %	78212251
13148	NC_007516	CAG	2	6	670331	670336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212251
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13150	NC_007516	CCA	2	6	670399	670404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212251
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13152	NC_007516	TGC	2	6	670483	670488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212251
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13156	NC_007516	CCGG	2	8	670723	670730	0 %	0 %	50 %	50 %	78212251
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13212	NC_007516	TGC	2	6	672439	672444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212252
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13225	NC_007516	TGC	2	6	672994	672999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212253
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13230	NC_007516	C	6	6	673226	673231	0 %	0 %	0 %	100 %	78212254
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13236	NC_007516	GATG	2	8	673417	673424	25 %	25 %	50 %	0 %	78212254
13237	NC_007516	GGT	2	6	673513	673518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212254
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13361	NC_007516	CAC	3	9	679901	679909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212259
13362	NC_007516	CGG	2	6	679981	679986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212259
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13365	NC_007516	TGC	2	6	680137	680142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212259
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13391	NC_007516	TCGA	2	8	681026	681033	25 %	25 %	25 %	25 %	78212260
13392	NC_007516	TGGATC	2	12	681059	681070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78212260
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13407	NC_007516	ATGGCG	2	12	681695	681706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78212261
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13415	NC_007516	GCCA	2	8	682155	682162	25 %	0 %	25 %	50 %	78212262
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13452	NC_007516	AGCGGT	2	12	683583	683594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78212264
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13455	NC_007516	CTG	3	9	683693	683701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
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13460	NC_007516	TCAC	2	8	683868	683875	25 %	25 %	0 %	50 %	78212265
13461	NC_007516	CCG	2	6	683876	683881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212265
13462	NC_007516	CTG	2	6	683888	683893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
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13465	NC_007516	GCA	2	6	684028	684033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212265
13466	NC_007516	GAG	2	6	684066	684071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212265
13467	NC_007516	AGA	2	6	684079	684084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212265
13468	NC_007516	GCC	2	6	684224	684229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212265
13469	NC_007516	CCT	2	6	684232	684237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212265
13470	NC_007516	GGC	2	6	684281	684286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212265
13471	NC_007516	CTG	2	6	684302	684307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
13472	NC_007516	CGGCTG	2	12	684309	684320	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212265
13473	NC_007516	CGT	3	9	684322	684330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
13474	NC_007516	CAG	2	6	684350	684355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212265
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13476	NC_007516	GGT	2	6	684428	684433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212265
13477	NC_007516	A	6	6	684473	684478	100 %	0 %	0 %	0 %	78212265
13478	NC_007516	GCT	2	6	684480	684485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
13479	NC_007516	GGC	2	6	684500	684505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212265
13480	NC_007516	TGC	2	6	684579	684584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212265
13481	NC_007516	GTC	2	6	684899	684904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212266
13482	NC_007516	CTG	2	6	684905	684910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212266
13483	NC_007516	AGG	2	6	685056	685061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212266
13484	NC_007516	GCG	2	6	685093	685098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212266
13485	NC_007516	AGC	2	6	685107	685112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212266
13486	NC_007516	TGC	2	6	685134	685139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212266
13487	NC_007516	CCA	2	6	685158	685163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212266
13488	NC_007516	CCG	2	6	685203	685208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212266
13489	NC_007516	GGT	3	9	685240	685248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212266
13490	NC_007516	CGA	2	6	685432	685437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212266
13491	NC_007516	CCA	2	6	685440	685445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212266
13492	NC_007516	TCT	2	6	685455	685460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212266
13493	NC_007516	GAG	2	6	685643	685648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212266
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13495	NC_007516	GGA	2	6	685732	685737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212266
13496	NC_007516	CCG	2	6	685789	685794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212266
13497	NC_007516	GC	3	6	685798	685803	0 %	0 %	50 %	50 %	78212266
13498	NC_007516	CCA	2	6	685851	685856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212266
13499	NC_007516	GCG	2	6	685886	685891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212266
13500	NC_007516	CAA	2	6	685903	685908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212266

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