MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007516	TGC	2	6	639370	639375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217
12502	NC_007516	GGT	2	6	639400	639405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12503	NC_007516	CTC	2	6	639419	639424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212217
12504	NC_007516	TGT	2	6	639439	639444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212217
12505	NC_007516	TGG	2	6	639459	639464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12506	NC_007516	TGC	2	6	639541	639546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12507	NC_007516	GCC	2	6	639594	639599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212218
12508	NC_007516	CAG	2	6	639641	639646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12509	NC_007516	CCA	2	6	639655	639660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212218
12510	NC_007516	TGG	2	6	639718	639723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212218
12511	NC_007516	TG	3	6	639724	639729	0 %	50 %	50 %	0 %	78212218
12512	NC_007516	CAG	2	6	639771	639776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12513	NC_007516	GGC	2	6	639827	639832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212218
12514	NC_007516	CTG	2	6	639843	639848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12515	NC_007516	CGG	2	6	639886	639891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212218
12516	NC_007516	TGC	2	6	639985	639990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12517	NC_007516	TCT	2	6	640000	640005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212218
12518	NC_007516	CAG	2	6	640065	640070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12519	NC_007516	TGG	2	6	640111	640116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212218
12520	NC_007516	CTGG	2	8	640128	640135	0 %	25 %	50 %	25 %	78212218
12521	NC_007516	GATG	2	8	640199	640206	25 %	25 %	50 %	0 %	78212218
12522	NC_007516	TCA	2	6	640235	640240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212218
12523	NC_007516	CGT	2	6	640260	640265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12524	NC_007516	CTG	2	6	640317	640322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12525	NC_007516	CAGCA	2	10	640336	640345	40 %	0 %	20 %	40 %	78212218
12526	NC_007516	GGGGCA	2	12	640372	640383	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78212218
12527	NC_007516	ACC	2	6	640395	640400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212218
12528	NC_007516	GCTC	2	8	640468	640475	0 %	25 %	25 %	50 %	78212218
12529	NC_007516	TGC	2	6	640498	640503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212218
12530	NC_007516	GAG	2	6	640510	640515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212218
12531	NC_007516	GGA	2	6	640527	640532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212219
12532	NC_007516	GGC	2	6	640560	640565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212219
12533	NC_007516	ATC	2	6	640585	640590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212219
12534	NC_007516	AC	3	6	640640	640645	50 %	0 %	0 %	50 %	78212219
12535	NC_007516	GTCGAA	2	12	640659	640670	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78212219
12536	NC_007516	CAG	3	9	640722	640730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12537	NC_007516	ATCCC	2	10	640796	640805	20 %	20 %	0 %	60 %	78212219
12538	NC_007516	ATCG	2	8	640880	640887	25 %	25 %	25 %	25 %	78212219
12539	NC_007516	CAG	3	9	640899	640907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12540	NC_007516	GCG	2	6	641020	641025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212219
12541	NC_007516	CAG	2	6	641078	641083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12542	NC_007516	GCT	2	6	641109	641114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12543	NC_007516	TCG	2	6	641128	641133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12544	NC_007516	GGC	2	6	641166	641171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212219
12545	NC_007516	CAG	2	6	641175	641180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12546	NC_007516	CCG	2	6	641272	641277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212219
12547	NC_007516	CTGCGC	2	12	641302	641313	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78212219
12548	NC_007516	CA	3	6	641324	641329	50 %	0 %	0 %	50 %	78212219
12549	NC_007516	CCA	2	6	641330	641335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212219
12550	NC_007516	GA	3	6	641425	641430	50 %	0 %	50 %	0 %	78212219
12551	NC_007516	GCTGAC	2	12	641585	641596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12552	NC_007516	CAG	2	6	641622	641627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12553	NC_007516	GTC	2	6	641644	641649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12554	NC_007516	CCCCA	2	10	641668	641677	20 %	0 %	0 %	80 %	78212219
12555	NC_007516	GAG	2	6	641730	641735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212219
12556	NC_007516	AACC	2	8	641812	641819	50 %	0 %	0 %	50 %	78212219
12557	NC_007516	AGC	3	9	641860	641868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12558	NC_007516	TGA	2	6	641987	641992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212219
12559	NC_007516	ATCAGG	2	12	641998	642009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78212219
12560	NC_007516	AAC	2	6	642030	642035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212219
12561	NC_007516	GCA	2	6	642047	642052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212219
12562	NC_007516	ACTTC	2	10	642053	642062	20 %	40 %	0 %	40 %	78212219
12563	NC_007516	CTG	2	6	642358	642363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212220
12564	NC_007516	ACC	2	6	642385	642390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212220
12565	NC_007516	TGG	2	6	642455	642460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212220
12566	NC_007516	TGGA	2	8	642475	642482	25 %	25 %	50 %	0 %	78212220
12567	NC_007516	CCTCA	2	10	642532	642541	20 %	20 %	0 %	60 %	78212220
12568	NC_007516	CGG	2	6	642574	642579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212220
12569	NC_007516	GTT	2	6	642606	642611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212220
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12571	NC_007516	GGT	2	6	642717	642722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212220
12572	NC_007516	TGA	2	6	642729	642734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212220
12573	NC_007516	GCG	2	6	642815	642820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212220
12574	NC_007516	TTG	2	6	642944	642949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212220
12575	NC_007516	CTG	2	6	643015	643020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212220
12576	NC_007516	TCC	2	6	643036	643041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212220
12577	NC_007516	TGT	2	6	643078	643083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212220
12578	NC_007516	GTC	2	6	643111	643116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212220
12579	NC_007516	CGAT	2	8	643220	643227	25 %	25 %	25 %	25 %	78212220
12580	NC_007516	TCC	2	6	643236	643241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212220
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12583	NC_007516	TTA	2	6	643376	643381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212221
12584	NC_007516	TGGGA	2	10	643387	643396	20 %	20 %	60 %	0 %	78212221
12585	NC_007516	CCA	2	6	643418	643423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212221
12586	NC_007516	CCG	2	6	643424	643429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212221
12587	NC_007516	GTC	2	6	643432	643437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212221
12588	NC_007516	AAG	2	6	643450	643455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212221
12589	NC_007516	CAG	2	6	643459	643464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212221
12590	NC_007516	A	6	6	643480	643485	100 %	0 %	0 %	0 %	78212221
12591	NC_007516	AGC	2	6	643493	643498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212221
12592	NC_007516	GCAC	2	8	643529	643536	25 %	0 %	25 %	50 %	78212221
12593	NC_007516	AGC	2	6	643541	643546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212221
12594	NC_007516	CA	3	6	643596	643601	50 %	0 %	0 %	50 %	78212222
12595	NC_007516	GTT	2	6	643610	643615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212222
12596	NC_007516	GTG	2	6	643624	643629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212222
12597	NC_007516	GTC	2	6	643689	643694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12598	NC_007516	GGC	2	6	643730	643735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212222
12599	NC_007516	CCT	2	6	643778	643783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212222
12600	NC_007516	TGG	2	6	643906	643911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212222
12601	NC_007516	TGGTCG	2	12	644026	644037	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78212222
12602	NC_007516	TCG	2	6	644062	644067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12603	NC_007516	ACCG	2	8	644140	644147	25 %	0 %	25 %	50 %	78212222
12604	NC_007516	CTC	2	6	644205	644210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212222
12605	NC_007516	CAG	3	9	644232	644240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12606	NC_007516	ACG	2	6	644287	644292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12607	NC_007516	TCG	2	6	644293	644298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12608	NC_007516	TGA	2	6	644321	644326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212222
12609	NC_007516	AAGG	2	8	644364	644371	50 %	0 %	50 %	0 %	78212222
12610	NC_007516	GGT	2	6	644403	644408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212222
12611	NC_007516	ACG	2	6	644413	644418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12612	NC_007516	TCG	2	6	644473	644478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212222
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12614	NC_007516	CCA	2	6	644513	644518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212222
12615	NC_007516	GGT	2	6	644529	644534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212222
12616	NC_007516	CTG	2	6	644601	644606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12617	NC_007516	CAG	2	6	644625	644630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212222
12618	NC_007516	GGT	2	6	644697	644702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212222
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12620	NC_007516	GCT	2	6	644773	644778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212223
12621	NC_007516	GCC	2	6	644782	644787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212223
12622	NC_007516	GGT	2	6	644797	644802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212223
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12625	NC_007516	GCA	2	6	644990	644995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212223
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12736	NC_007516	CTTC	2	8	651941	651948	0 %	50 %	0 %	50 %	78212231
12737	NC_007516	CTT	2	6	651988	651993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212231
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12980	NC_007516	GTGG	2	8	662312	662319	0 %	25 %	75 %	0 %	78212242
12981	NC_007516	CGC	2	6	662389	662394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212242
12982	NC_007516	CAG	2	6	662429	662434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212242
12983	NC_007516	CAG	2	6	662461	662466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212242
12984	NC_007516	GCT	2	6	662600	662605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12985	NC_007516	GCG	2	6	662606	662611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212243
12986	NC_007516	GCGTC	2	10	662637	662646	0 %	20 %	40 %	40 %	78212243
12987	NC_007516	CCA	2	6	662647	662652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212243
12988	NC_007516	GTC	2	6	662717	662722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12989	NC_007516	GAG	2	6	662723	662728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212243
12990	NC_007516	CAG	2	6	662740	662745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12991	NC_007516	GTC	2	6	662789	662794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12992	NC_007516	CAA	2	6	662806	662811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212243
12993	NC_007516	CAG	2	6	662847	662852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12994	NC_007516	GTC	2	6	662861	662866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243
12995	NC_007516	GTG	2	6	662867	662872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212243
12996	NC_007516	CGGTT	2	10	662933	662942	0 %	40 %	40 %	20 %	78212243
12997	NC_007516	T	6	6	663028	663033	0 %	100 %	0 %	0 %	78212243
12998	NC_007516	GGT	2	6	663098	663103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212243
12999	NC_007516	CGAT	2	8	663271	663278	25 %	25 %	25 %	25 %	78212243
13000	NC_007516	CTG	2	6	663299	663304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212243

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