MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_007516	ATGC	2	8	612411	612418	25 %	25 %	25 %	25 %	78212185
12002	NC_007516	GAG	2	6	612525	612530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212185
12003	NC_007516	GTG	2	6	612544	612549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212185
12004	NC_007516	CGC	2	6	612570	612575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212185
12005	NC_007516	TGG	2	6	612598	612603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212185
12006	NC_007516	GGCG	2	8	612620	612627	0 %	0 %	75 %	25 %	78212185
12007	NC_007516	TGG	2	6	612691	612696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212185
12008	NC_007516	TCA	2	6	612752	612757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212185
12009	NC_007516	CGG	2	6	612869	612874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212185
12010	NC_007516	GCG	2	6	613042	613047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212185
12011	NC_007516	ACC	2	6	613122	613127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212185
12012	NC_007516	GCC	2	6	613152	613157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212185
12013	NC_007516	GGT	2	6	613169	613174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212185
12014	NC_007516	GCAGC	2	10	613190	613199	20 %	0 %	40 %	40 %	78212185
12015	NC_007516	CGG	2	6	613244	613249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212185
12016	NC_007516	CGC	2	6	613253	613258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212185
12017	NC_007516	CGC	2	6	613349	613354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212185
12018	NC_007516	CGC	2	6	613394	613399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212185
12019	NC_007516	AC	3	6	613462	613467	50 %	0 %	0 %	50 %	78212185
12020	NC_007516	ACCC	2	8	613471	613478	25 %	0 %	0 %	75 %	78212185
12021	NC_007516	CGT	2	6	613523	613528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212186
12022	NC_007516	CAGAT	2	10	613544	613553	40 %	20 %	20 %	20 %	78212186
12023	NC_007516	TGA	2	6	613574	613579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212186
12024	NC_007516	GAT	2	6	613640	613645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212186
12025	NC_007516	TGT	2	6	613667	613672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212186
12026	NC_007516	GTT	2	6	613673	613678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212186
12027	NC_007516	GT	3	6	613684	613689	0 %	50 %	50 %	0 %	78212186
12028	NC_007516	GGC	2	6	613752	613757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212187
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12031	NC_007516	GATT	2	8	613807	613814	25 %	50 %	25 %	0 %	78212187
12032	NC_007516	CCATC	2	10	613823	613832	20 %	20 %	0 %	60 %	78212187
12033	NC_007516	TCC	2	6	613855	613860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212187
12034	NC_007516	C	6	6	613874	613879	0 %	0 %	0 %	100 %	78212187
12035	NC_007516	TGT	2	6	613947	613952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212187
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12037	NC_007516	CCA	2	6	614156	614161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212187
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12039	NC_007516	GGC	2	6	614187	614192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212187
12040	NC_007516	ATC	2	6	614332	614337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212187
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12042	NC_007516	GGCCG	2	10	614398	614407	0 %	0 %	60 %	40 %	78212187
12043	NC_007516	GCA	2	6	614417	614422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212187
12044	NC_007516	GCT	2	6	614438	614443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212187
12045	NC_007516	GCA	2	6	614474	614479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212187
12046	NC_007516	GCGCAC	2	12	614517	614528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78212187
12047	NC_007516	CTG	2	6	614583	614588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212187
12048	NC_007516	CAT	2	6	614723	614728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212187
12049	NC_007516	GAGCCA	2	12	614761	614772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212187
12050	NC_007516	GCG	2	6	614843	614848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212187
12051	NC_007516	G	6	6	614856	614861	0 %	0 %	100 %	0 %	78212187
12052	NC_007516	GTC	2	6	615101	615106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212188
12053	NC_007516	TGG	2	6	615129	615134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212188
12054	NC_007516	TGA	2	6	615183	615188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212188
12055	NC_007516	TGC	2	6	615220	615225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212188
12056	NC_007516	ACC	2	6	615290	615295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212188
12057	NC_007516	TCT	2	6	615376	615381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212188
12058	NC_007516	GGA	2	6	615394	615399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212188
12059	NC_007516	CCG	2	6	615406	615411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212188
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12062	NC_007516	TGC	2	6	615663	615668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212188
12063	NC_007516	GCT	3	9	615697	615705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212188
12064	NC_007516	GCT	2	6	615822	615827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212188
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12119	NC_007516	GCT	2	6	618262	618267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12120	NC_007516	GGC	2	6	618270	618275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212191
12121	NC_007516	GTT	2	6	618324	618329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212191
12122	NC_007516	TCC	2	6	618397	618402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212191
12123	NC_007516	GAGG	2	8	618462	618469	25 %	0 %	75 %	0 %	78212191
12124	NC_007516	GAG	2	6	618515	618520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212191
12125	NC_007516	CTC	2	6	618552	618557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212191
12126	NC_007516	AAG	2	6	618558	618563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212191
12127	NC_007516	CCG	2	6	618569	618574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212191
12128	NC_007516	TTG	2	6	618640	618645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212191
12129	NC_007516	TCC	2	6	618694	618699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212191
12130	NC_007516	ACC	2	6	618716	618721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212191
12131	NC_007516	GAG	2	6	618839	618844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212191
12132	NC_007516	CCA	3	9	618962	618970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212191
12133	NC_007516	CAA	2	6	618971	618976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212191
12134	NC_007516	CCG	2	6	619004	619009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212191
12135	NC_007516	ACG	2	6	619014	619019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12136	NC_007516	TCA	2	6	619105	619110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212191
12137	NC_007516	CCTGCT	2	12	619154	619165	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78212191
12138	NC_007516	GCG	2	6	619199	619204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212191
12139	NC_007516	GCT	2	6	619213	619218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12140	NC_007516	AGC	2	6	619262	619267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12141	NC_007516	TGC	2	6	619312	619317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12142	NC_007516	CTC	2	6	619344	619349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212191
12143	NC_007516	GCA	2	6	619439	619444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212191
12144	NC_007516	GCC	2	6	619953	619958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212192
12145	NC_007516	GGC	2	6	619998	620003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212192
12146	NC_007516	GCT	2	6	620236	620241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12147	NC_007516	GCA	2	6	620344	620349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12148	NC_007516	CAC	2	6	620432	620437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212193
12149	NC_007516	TTG	2	6	620463	620468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212193
12150	NC_007516	ATC	2	6	620525	620530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212193
12151	NC_007516	CTG	2	6	620534	620539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12152	NC_007516	GAC	2	6	620541	620546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12153	NC_007516	GCA	3	9	620586	620594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12154	NC_007516	TGC	2	6	620633	620638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12155	NC_007516	TCG	2	6	620661	620666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212193
12156	NC_007516	CAG	2	6	620787	620792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212194
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12158	NC_007516	CAC	2	6	620856	620861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212194
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12161	NC_007516	GCCA	2	8	621197	621204	25 %	0 %	25 %	50 %	78212195
12162	NC_007516	TCG	2	6	621207	621212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212195
12163	NC_007516	TGC	2	6	621219	621224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212195
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12176	NC_007516	CCGCG	2	10	622136	622145	0 %	0 %	40 %	60 %	78212196
12177	NC_007516	CTTC	2	8	622238	622245	0 %	50 %	0 %	50 %	78212196
12178	NC_007516	CTG	2	6	622267	622272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212196
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12180	NC_007516	GCT	2	6	622302	622307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212196
12181	NC_007516	TGAT	2	8	622330	622337	25 %	50 %	25 %	0 %	78212196
12182	NC_007516	GATT	2	8	622364	622371	25 %	50 %	25 %	0 %	78212196
12183	NC_007516	ATCG	2	8	622392	622399	25 %	25 %	25 %	25 %	78212196
12184	NC_007516	GGCT	2	8	622418	622425	0 %	25 %	50 %	25 %	78212196
12185	NC_007516	CAGCTC	2	12	622435	622446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78212196
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12193	NC_007516	CAG	2	6	623132	623137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212198
12194	NC_007516	CAG	2	6	623153	623158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212198
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12198	NC_007516	CTG	2	6	623303	623308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212198
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12202	NC_007516	AGG	2	6	623436	623441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212198
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12204	NC_007516	GTC	2	6	623495	623500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212198
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12210	NC_007516	GCG	2	6	623725	623730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212198
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12224	NC_007516	TCT	2	6	624503	624508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212199
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12226	NC_007516	CAG	2	6	624569	624574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212199
12227	NC_007516	ATC	2	6	624591	624596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212199
12228	NC_007516	GCT	2	6	624644	624649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212199
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12231	NC_007516	GT	3	6	625027	625032	0 %	50 %	50 %	0 %	78212200
12232	NC_007516	AAAAC	2	10	625048	625057	80 %	0 %	0 %	20 %	78212200
12233	NC_007516	G	6	6	625124	625129	0 %	0 %	100 %	0 %	78212200
12234	NC_007516	TCC	2	6	625202	625207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212200
12235	NC_007516	GTT	2	6	625230	625235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212200
12236	NC_007516	TGA	2	6	625339	625344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212200
12237	NC_007516	GA	3	6	625409	625414	50 %	0 %	50 %	0 %	78212200
12238	NC_007516	A	7	7	625430	625436	100 %	0 %	0 %	0 %	78212200
12239	NC_007516	GCA	2	6	625452	625457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212200
12240	NC_007516	GCC	2	6	625517	625522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212200
12241	NC_007516	ACG	2	6	625547	625552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212200
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12243	NC_007516	CAT	2	6	625603	625608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212200
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12479	NC_007516	TGG	3	9	638711	638719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12480	NC_007516	GCTGGG	2	12	638725	638736	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78212217
12481	NC_007516	CTGGC	2	10	638768	638777	0 %	20 %	40 %	40 %	78212217
12482	NC_007516	CTG	2	6	638783	638788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217
12483	NC_007516	GTG	2	6	638822	638827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12484	NC_007516	GGGA	2	8	638866	638873	25 %	0 %	75 %	0 %	78212217
12485	NC_007516	TGG	2	6	638883	638888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12486	NC_007516	TGC	2	6	638901	638906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217
12487	NC_007516	GGC	3	9	638918	638926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212217
12488	NC_007516	CGC	2	6	638965	638970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212217
12489	NC_007516	TTG	2	6	638982	638987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212217
12490	NC_007516	TGG	2	6	638995	639000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212217
12491	NC_007516	GCA	2	6	639004	639009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212217
12492	NC_007516	CTG	2	6	639020	639025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217
12493	NC_007516	TGA	3	9	639042	639050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212217
12494	NC_007516	GGC	2	6	639097	639102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212217
12495	NC_007516	CGG	2	6	639154	639159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212217
12496	NC_007516	GGC	2	6	639168	639173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212217
12497	NC_007516	GCT	2	6	639187	639192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217
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12499	NC_007516	G	6	6	639326	639331	0 %	0 %	100 %	0 %	78212217
12500	NC_007516	CTG	3	9	639353	639361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212217

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