MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007516	AGC	2	6	588292	588297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212157
11502	NC_007516	GAT	2	6	588312	588317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212157
11503	NC_007516	CTG	2	6	588416	588421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212157
11504	NC_007516	CAC	2	6	588519	588524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212157
11505	NC_007516	ATC	2	6	588544	588549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212157
11506	NC_007516	CCGTG	2	10	588551	588560	0 %	20 %	40 %	40 %	78212157
11507	NC_007516	GC	3	6	588644	588649	0 %	0 %	50 %	50 %	78212157
11508	NC_007516	A	6	6	588662	588667	100 %	0 %	0 %	0 %	78212157
11509	NC_007516	GCTGAA	2	12	588714	588725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78212157
11510	NC_007516	TCC	2	6	588869	588874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212158
11511	NC_007516	CCA	2	6	588882	588887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212158
11512	NC_007516	CA	4	8	588933	588940	50 %	0 %	0 %	50 %	78212158
11513	NC_007516	TGGC	2	8	588985	588992	0 %	25 %	50 %	25 %	78212158
11514	NC_007516	TGATG	2	10	589105	589114	20 %	40 %	40 %	0 %	78212158
11515	NC_007516	TGC	2	6	589183	589188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212158
11516	NC_007516	TTC	2	6	589231	589236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212158
11517	NC_007516	CAA	2	6	589314	589319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212158
11518	NC_007516	ACA	2	6	589328	589333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212158
11519	NC_007516	TGC	2	6	589467	589472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212158
11520	NC_007516	TCG	2	6	589499	589504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212158
11521	NC_007516	GAT	2	6	589827	589832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212159
11522	NC_007516	TTC	2	6	589836	589841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212159
11523	NC_007516	GTT	2	6	589869	589874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212159
11524	NC_007516	GGCTT	2	10	589945	589954	0 %	40 %	40 %	20 %	78212159
11525	NC_007516	GTT	2	6	589983	589988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212159
11526	NC_007516	TGG	2	6	590066	590071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212159
11527	NC_007516	CGA	2	6	590084	590089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212159
11528	NC_007516	GCG	2	6	590097	590102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212159
11529	NC_007516	CTGG	2	8	590124	590131	0 %	25 %	50 %	25 %	78212159
11530	NC_007516	TGG	2	6	590150	590155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212159
11531	NC_007516	TGC	2	6	590195	590200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212159
11532	NC_007516	GTG	2	6	590209	590214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212159
11533	NC_007516	GCTT	2	8	590273	590280	0 %	50 %	25 %	25 %	78212159
11534	NC_007516	CGT	2	6	590292	590297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212159
11535	NC_007516	CGC	2	6	590300	590305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212159
11536	NC_007516	TGG	2	6	590308	590313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212159
11537	NC_007516	GGGCA	2	10	590387	590396	20 %	0 %	60 %	20 %	78212159
11538	NC_007516	CTGG	2	8	590404	590411	0 %	25 %	50 %	25 %	78212159
11539	NC_007516	TC	3	6	590433	590438	0 %	50 %	0 %	50 %	78212159
11540	NC_007516	GGT	2	6	590460	590465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212159
11541	NC_007516	GTT	2	6	590467	590472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212159
11542	NC_007516	GCA	2	6	590491	590496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212159
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11544	NC_007516	GC	3	6	590515	590520	0 %	0 %	50 %	50 %	78212159
11545	NC_007516	CAG	2	6	590521	590526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212159
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11547	NC_007516	GGC	2	6	590640	590645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212159
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11549	NC_007516	CGT	2	6	590712	590717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212159
11550	NC_007516	CGA	2	6	590721	590726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212159
11551	NC_007516	GAG	2	6	590783	590788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212160
11552	NC_007516	GTG	2	6	590789	590794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212160
11553	NC_007516	CTGG	2	8	590824	590831	0 %	25 %	50 %	25 %	78212160
11554	NC_007516	CTG	3	9	590858	590866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212160
11555	NC_007516	CCA	2	6	590868	590873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212160
11556	NC_007516	CT	3	6	590907	590912	0 %	50 %	0 %	50 %	78212160
11557	NC_007516	G	6	6	590938	590943	0 %	0 %	100 %	0 %	78212160
11558	NC_007516	GC	3	6	590946	590951	0 %	0 %	50 %	50 %	78212160
11559	NC_007516	GCT	2	6	590960	590965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212160
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11562	NC_007516	GCT	2	6	591134	591139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212160
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11565	NC_007516	TTG	2	6	591252	591257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212160
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11569	NC_007516	TGT	2	6	591354	591359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212160
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11572	NC_007516	TTC	2	6	591459	591464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212160
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11574	NC_007516	TGCCT	2	10	591484	591493	0 %	40 %	20 %	40 %	78212160
11575	NC_007516	TGC	2	6	591519	591524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212160
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11577	NC_007516	TCG	2	6	591552	591557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212160
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11579	NC_007516	CGGA	2	8	591659	591666	25 %	0 %	50 %	25 %	78212160
11580	NC_007516	CACC	2	8	591682	591689	25 %	0 %	0 %	75 %	78212160
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11586	NC_007516	CTGAT	2	10	592127	592136	20 %	40 %	20 %	20 %	78212161
11587	NC_007516	TCGCC	2	10	592140	592149	0 %	20 %	20 %	60 %	78212161
11588	NC_007516	CGC	2	6	592168	592173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212161
11589	NC_007516	GGC	2	6	592199	592204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212161
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11591	NC_007516	CTG	2	6	592225	592230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
11592	NC_007516	TGCTCG	2	12	592244	592255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
11593	NC_007516	GCT	2	6	592305	592310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
11594	NC_007516	CAC	2	6	592332	592337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212161
11595	NC_007516	CTG	2	6	592342	592347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
11596	NC_007516	AAC	2	6	592445	592450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212161
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11599	NC_007516	GGT	3	9	592554	592562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212161
11600	NC_007516	GATC	2	8	592614	592621	25 %	25 %	25 %	25 %	78212161
11601	NC_007516	GTC	2	6	592676	592681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
11602	NC_007516	GAT	2	6	592690	592695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212161
11603	NC_007516	CAG	3	9	592834	592842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212162
11604	NC_007516	TTC	2	6	592901	592906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212162
11605	NC_007516	GCT	2	6	593133	593138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212162
11606	NC_007516	CAT	2	6	593223	593228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212162
11607	NC_007516	TGC	3	9	593297	593305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212162
11608	NC_007516	CTGG	2	8	593448	593455	0 %	25 %	50 %	25 %	78212162
11609	NC_007516	CTG	2	6	593542	593547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212162
11610	NC_007516	CTG	2	6	593584	593589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212162
11611	NC_007516	CTC	2	6	593599	593604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212162
11612	NC_007516	TCT	2	6	593669	593674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212163
11613	NC_007516	CAG	2	6	593681	593686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212163
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11615	NC_007516	TGA	2	6	593743	593748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212163
11616	NC_007516	TGG	2	6	593757	593762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212163
11617	NC_007516	TCAG	2	8	593769	593776	25 %	25 %	25 %	25 %	78212163
11618	NC_007516	AGC	2	6	593803	593808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212163
11619	NC_007516	TGTC	2	8	593871	593878	0 %	50 %	25 %	25 %	78212163
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11621	NC_007516	GCT	2	6	593948	593953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212163
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11982	NC_007516	GAA	2	6	611735	611740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212183
11983	NC_007516	GCGGTG	2	12	611766	611777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78212183
11984	NC_007516	TTG	2	6	611824	611829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212183
11985	NC_007516	GTG	2	6	611862	611867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212184
11986	NC_007516	GTC	2	6	611884	611889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212184
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11990	NC_007516	TGC	2	6	611970	611975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212184
11991	NC_007516	GCA	2	6	611999	612004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212184
11992	NC_007516	CCAGC	2	10	612038	612047	20 %	0 %	20 %	60 %	78212184
11993	NC_007516	CGA	2	6	612120	612125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212184
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11997	NC_007516	GCA	2	6	612209	612214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212184
11998	NC_007516	GCCA	2	8	612253	612260	25 %	0 %	25 %	50 %	78212184
11999	NC_007516	ACG	2	6	612311	612316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212184
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