MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007516	GCC	2	6	565643	565648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212133
11002	NC_007516	GCA	3	9	565663	565671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212133
11003	NC_007516	CCTC	2	8	565696	565703	0 %	25 %	0 %	75 %	78212133
11004	NC_007516	CAA	2	6	565750	565755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212133
11005	NC_007516	GC	3	6	565760	565765	0 %	0 %	50 %	50 %	78212133
11006	NC_007516	CGT	2	6	565770	565775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
11007	NC_007516	CGC	2	6	565785	565790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212133
11008	NC_007516	TCCA	2	8	565851	565858	25 %	25 %	0 %	50 %	78212134
11009	NC_007516	TTGC	2	8	565936	565943	0 %	50 %	25 %	25 %	78212134
11010	NC_007516	CCG	2	6	565985	565990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212134
11011	NC_007516	CT	3	6	565997	566002	0 %	50 %	0 %	50 %	78212134
11012	NC_007516	CGAT	2	8	566036	566043	25 %	25 %	25 %	25 %	78212134
11013	NC_007516	TCC	2	6	566063	566068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212134
11014	NC_007516	GTG	2	6	566077	566082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212134
11015	NC_007516	TGAT	2	8	566153	566160	25 %	50 %	25 %	0 %	78212134
11016	NC_007516	TGG	2	6	566174	566179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212134
11017	NC_007516	TGG	2	6	566296	566301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212134
11018	NC_007516	GCTG	2	8	566304	566311	0 %	25 %	50 %	25 %	78212134
11019	NC_007516	TCC	2	6	566313	566318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212134
11020	NC_007516	GGT	2	6	566319	566324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212134
11021	NC_007516	GCA	2	6	566325	566330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212134
11022	NC_007516	GTT	2	6	566331	566336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212134
11023	NC_007516	GGC	2	6	566364	566369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212134
11024	NC_007516	GGC	2	6	566379	566384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212134
11025	NC_007516	G	6	6	566457	566462	0 %	0 %	100 %	0 %	78212134
11026	NC_007516	ACTG	2	8	566524	566531	25 %	25 %	25 %	25 %	78212134
11027	NC_007516	TTC	2	6	566584	566589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212134
11028	NC_007516	CAG	2	6	566622	566627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212134
11029	NC_007516	GGTG	2	8	566665	566672	0 %	25 %	75 %	0 %	78212134
11030	NC_007516	TCGTCA	2	12	566818	566829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78212135
11031	NC_007516	GCG	2	6	566909	566914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212135
11032	NC_007516	GCC	2	6	566937	566942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212135
11033	NC_007516	CCG	2	6	566959	566964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212135
11034	NC_007516	GAGTT	2	10	566974	566983	20 %	40 %	40 %	0 %	78212135
11035	NC_007516	TGGAGG	2	12	566986	566997	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	78212135
11036	NC_007516	CCAGC	2	10	567005	567014	20 %	0 %	20 %	60 %	78212135
11037	NC_007516	GCA	2	6	567017	567022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11038	NC_007516	CGA	2	6	567026	567031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11039	NC_007516	TCT	2	6	567062	567067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212135
11040	NC_007516	CT	3	6	567073	567078	0 %	50 %	0 %	50 %	78212135
11041	NC_007516	CCG	2	6	567106	567111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212135
11042	NC_007516	GCA	2	6	567158	567163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11043	NC_007516	CGTGA	2	10	567219	567228	20 %	20 %	40 %	20 %	78212135
11044	NC_007516	CGC	2	6	567239	567244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212135
11045	NC_007516	CGT	2	6	567255	567260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11046	NC_007516	CCGA	2	8	567363	567370	25 %	0 %	25 %	50 %	78212135
11047	NC_007516	GGA	2	6	567416	567421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212135
11048	NC_007516	GCA	6	18	567423	567440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11049	NC_007516	GAC	2	6	567480	567485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11050	NC_007516	GC	3	6	567492	567497	0 %	0 %	50 %	50 %	78212135
11051	NC_007516	GCA	2	6	567563	567568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11052	NC_007516	AC	3	6	567598	567603	50 %	0 %	0 %	50 %	78212135
11053	NC_007516	TGT	2	6	567629	567634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212135
11054	NC_007516	TGGT	2	8	567720	567727	0 %	50 %	50 %	0 %	78212135
11055	NC_007516	GCC	2	6	567728	567733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212135
11056	NC_007516	CGA	2	6	567734	567739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11057	NC_007516	GCT	2	6	567744	567749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11058	NC_007516	TCG	2	6	567764	567769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212135
11059	NC_007516	GAG	2	6	567810	567815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212135
11060	NC_007516	CCT	2	6	567820	567825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212135
11061	NC_007516	TCAG	2	8	567835	567842	25 %	25 %	25 %	25 %	78212135
11062	NC_007516	TCA	2	6	567980	567985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212136
11063	NC_007516	CTG	2	6	567987	567992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
11064	NC_007516	GTG	2	6	568012	568017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212136
11065	NC_007516	CCG	2	6	568027	568032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212136
11066	NC_007516	CGGG	2	8	568047	568054	0 %	0 %	75 %	25 %	78212136
11067	NC_007516	GGC	2	6	568194	568199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212136
11068	NC_007516	TTCC	2	8	568205	568212	0 %	50 %	0 %	50 %	78212136
11069	NC_007516	TGC	2	6	568256	568261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
11070	NC_007516	CCGCA	2	10	568353	568362	20 %	0 %	20 %	60 %	78212136
11071	NC_007516	GTGA	2	8	568363	568370	25 %	25 %	50 %	0 %	78212136
11072	NC_007516	CTG	2	6	568375	568380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
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11078	NC_007516	TGG	2	6	568447	568452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212136
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11080	NC_007516	TGC	2	6	568595	568600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
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11083	NC_007516	CTGCC	2	10	568763	568772	0 %	20 %	20 %	60 %	78212136
11084	NC_007516	CTG	2	6	568786	568791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
11085	NC_007516	GCTG	2	8	568859	568866	0 %	25 %	50 %	25 %	78212136
11086	NC_007516	TGC	2	6	568874	568879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212136
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11089	NC_007516	CGG	2	6	568937	568942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212136
11090	NC_007516	TGG	2	6	568949	568954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212136
11091	NC_007516	GCCT	2	8	569014	569021	0 %	25 %	25 %	50 %	78212136
11092	NC_007516	CGA	2	6	569082	569087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212136
11093	NC_007516	TTG	2	6	569131	569136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212136
11094	NC_007516	GCC	3	9	569164	569172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212136
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11097	NC_007516	GATC	2	8	569541	569548	25 %	25 %	25 %	25 %	78212136
11098	NC_007516	CTC	2	6	569593	569598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212136
11099	NC_007516	ACG	2	6	569615	569620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212136
11100	NC_007516	CTG	2	6	569801	569806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212137
11101	NC_007516	CATGC	2	10	569824	569833	20 %	20 %	20 %	40 %	78212137
11102	NC_007516	CTG	2	6	569886	569891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212137
11103	NC_007516	GTG	2	6	569902	569907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212137
11104	NC_007516	TTG	2	6	569972	569977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212137
11105	NC_007516	GGC	2	6	570048	570053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212137
11106	NC_007516	GCC	2	6	570104	570109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212137
11107	NC_007516	CAGG	2	8	570148	570155	25 %	0 %	50 %	25 %	78212137
11108	NC_007516	CGCTGG	2	12	570169	570180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212137
11109	NC_007516	AGC	2	6	570194	570199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212137
11110	NC_007516	CGA	2	6	570215	570220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212137
11111	NC_007516	ATCA	2	8	570245	570252	50 %	25 %	0 %	25 %	78212137
11112	NC_007516	GGTT	2	8	570336	570343	0 %	50 %	50 %	0 %	78212138
11113	NC_007516	GCCAAC	2	12	570347	570358	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78212138
11114	NC_007516	GCT	2	6	570359	570364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212138
11115	NC_007516	AGC	2	6	570368	570373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212138
11116	NC_007516	GGA	2	6	570376	570381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212138
11117	NC_007516	CCAG	2	8	570483	570490	25 %	0 %	25 %	50 %	78212138
11118	NC_007516	AAG	2	6	570665	570670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212138
11119	NC_007516	CCAAGA	2	12	570705	570716	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78212138
11120	NC_007516	GGC	2	6	570742	570747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212138
11121	NC_007516	CAG	3	9	570755	570763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212138
11122	NC_007516	GCA	2	6	570780	570785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212138
11123	NC_007516	GGC	2	6	570805	570810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212138
11124	NC_007516	GGA	2	6	570823	570828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212138
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11126	NC_007516	GATCT	2	10	570879	570888	20 %	40 %	20 %	20 %	78212138
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11227	NC_007516	CT	3	6	575751	575756	0 %	50 %	0 %	50 %	78212145
11228	NC_007516	ATC	2	6	575773	575778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212145
11229	NC_007516	CTG	2	6	575826	575831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212145
11230	NC_007516	CGAG	2	8	575843	575850	25 %	0 %	50 %	25 %	78212145
11231	NC_007516	GCCAT	2	10	575896	575905	20 %	20 %	20 %	40 %	78212145
11232	NC_007516	TGG	2	6	575924	575929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212145
11233	NC_007516	GCT	2	6	576101	576106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212145
11234	NC_007516	CTG	2	6	576151	576156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212146
11235	NC_007516	CAC	2	6	576340	576345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212146
11236	NC_007516	CAT	2	6	576346	576351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212146
11237	NC_007516	GTA	2	6	576367	576372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212146
11238	NC_007516	CAG	2	6	576412	576417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212146
11239	NC_007516	GAA	2	6	576463	576468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212146
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11241	NC_007516	TAGG	2	8	576631	576638	25 %	25 %	50 %	0 %	78212146
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11474	NC_007516	AGGCC	2	10	586794	586803	20 %	0 %	40 %	40 %	78212156
11475	NC_007516	CAG	2	6	586819	586824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212156
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11477	NC_007516	GGGCAG	2	12	586921	586932	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78212156
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11481	NC_007516	TGG	2	6	587121	587126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212156
11482	NC_007516	GCT	2	6	587136	587141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212157
11483	NC_007516	CGG	2	6	587184	587189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212157
11484	NC_007516	GCCGTA	2	12	587193	587204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212157
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11487	NC_007516	CAG	2	6	587370	587375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212157
11488	NC_007516	CTGAT	2	10	587389	587398	20 %	40 %	20 %	20 %	78212157
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11490	NC_007516	GGC	2	6	587516	587521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212157
11491	NC_007516	CCGG	2	8	587541	587548	0 %	0 %	50 %	50 %	78212157
11492	NC_007516	CGA	3	9	587627	587635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212157
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11495	NC_007516	CA	3	6	587887	587892	50 %	0 %	0 %	50 %	78212157
11496	NC_007516	ATG	2	6	588010	588015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212157
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