MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_007516	TCG	2	6	534019	534024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212101
10502	NC_007516	ACA	2	6	534044	534049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212101
10503	NC_007516	TCA	2	6	534278	534283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212102
10504	NC_007516	GAGCT	2	10	535679	535688	20 %	20 %	40 %	20 %	78212103
10505	NC_007516	TGG	2	6	535697	535702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212103
10506	NC_007516	CTG	2	6	535780	535785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212103
10507	NC_007516	ACG	2	6	535803	535808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212103
10508	NC_007516	CAT	2	6	535884	535889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212103
10509	NC_007516	GGT	2	6	535897	535902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212103
10510	NC_007516	CTGG	2	8	535986	535993	0 %	25 %	50 %	25 %	78212103
10511	NC_007516	CGT	2	6	535994	535999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212103
10512	NC_007516	CAA	2	6	536030	536035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212103
10513	NC_007516	GCA	2	6	536158	536163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212103
10514	NC_007516	CTC	2	6	536238	536243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212104
10515	NC_007516	CAG	2	6	536256	536261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10516	NC_007516	CCA	2	6	536306	536311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
10517	NC_007516	GAG	2	6	536324	536329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212104
10518	NC_007516	TGC	2	6	536454	536459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10519	NC_007516	CTG	2	6	536499	536504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10520	NC_007516	GCT	2	6	536507	536512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10521	NC_007516	CCA	2	6	536534	536539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
10522	NC_007516	AACC	2	8	536596	536603	50 %	0 %	0 %	50 %	78212104
10523	NC_007516	AGTTCG	2	12	536671	536682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78212104
10524	NC_007516	GTGG	2	8	536699	536706	0 %	25 %	75 %	0 %	78212104
10525	NC_007516	ACA	2	6	536891	536896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
10526	NC_007516	CCA	2	6	536939	536944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
10527	NC_007516	CCA	2	6	536987	536992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
10528	NC_007516	T	6	6	536997	537002	0 %	100 %	0 %	0 %	78212104
10529	NC_007516	TGG	2	6	537105	537110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212104
10530	NC_007516	AAG	2	6	537139	537144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212104
10531	NC_007516	CTT	2	6	537146	537151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212104
10532	NC_007516	GCA	2	6	537221	537226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10533	NC_007516	GCT	2	6	537257	537262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10534	NC_007516	CAG	3	9	537338	537346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10535	NC_007516	AAGA	2	8	537446	537453	75 %	0 %	25 %	0 %	78212104
10536	NC_007516	CTCC	2	8	537476	537483	0 %	25 %	0 %	75 %	78212104
10537	NC_007516	CACC	2	8	537533	537540	25 %	0 %	0 %	75 %	78212104
10538	NC_007516	TCA	2	6	537607	537612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212104
10539	NC_007516	CAA	2	6	537654	537659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
10540	NC_007516	CAG	2	6	537678	537683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
10541	NC_007516	GTT	2	6	537696	537701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212104
10542	NC_007516	ACA	2	6	537745	537750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
10543	NC_007516	CGG	2	6	537790	537795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212104
10544	NC_007516	ATT	2	6	537802	537807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212104
10545	NC_007516	AAC	2	6	538712	538717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212105
10546	NC_007516	CAA	2	6	538885	538890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212105
10547	NC_007516	AGA	2	6	539187	539192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212105
10548	NC_007516	AGGA	2	8	539230	539237	50 %	0 %	50 %	0 %	78212105
10549	NC_007516	G	7	7	539281	539287	0 %	0 %	100 %	0 %	78212105
10550	NC_007516	ATG	2	6	539407	539412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212105
10551	NC_007516	AATC	2	8	539489	539496	50 %	25 %	0 %	25 %	78212105
10552	NC_007516	AT	3	6	539530	539535	50 %	50 %	0 %	0 %	78212105
10553	NC_007516	CTA	2	6	539572	539577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212105
10554	NC_007516	AAT	2	6	539629	539634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78212105
10555	NC_007516	TCA	2	6	539783	539788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212106
10556	NC_007516	CCG	2	6	539797	539802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212106
10557	NC_007516	CGT	2	6	539878	539883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212106
10558	NC_007516	GTA	2	6	539891	539896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212106
10559	NC_007516	TCACC	2	10	539973	539982	20 %	20 %	0 %	60 %	78212106
10560	NC_007516	GAG	2	6	540049	540054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212106
10561	NC_007516	CAA	2	6	540069	540074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212106
10562	NC_007516	AAC	3	9	540085	540093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212106
10563	NC_007516	CAC	2	6	540100	540105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212106
10564	NC_007516	CAG	2	6	540436	540441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10565	NC_007516	CTG	2	6	540514	540519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10566	NC_007516	TCA	2	6	540590	540595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212107
10567	NC_007516	TGA	2	6	540636	540641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212107
10568	NC_007516	CAG	2	6	540688	540693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10569	NC_007516	CAG	2	6	540739	540744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10570	NC_007516	GAA	2	6	540772	540777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212107
10571	NC_007516	GCT	2	6	540802	540807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10572	NC_007516	CCAG	2	8	540810	540817	25 %	0 %	25 %	50 %	78212107
10573	NC_007516	GCA	2	6	540822	540827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
10574	NC_007516	TGC	2	6	540924	540929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
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10577	NC_007516	CAG	2	6	541331	541336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212108
10578	NC_007516	ACT	2	6	541432	541437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212108
10579	NC_007516	AGC	2	6	541454	541459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212108
10580	NC_007516	TCC	2	6	541587	541592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212108
10581	NC_007516	ATC	2	6	541724	541729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212108
10582	NC_007516	TCA	2	6	541758	541763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212108
10583	NC_007516	TGG	2	6	541842	541847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212108
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10585	NC_007516	TGC	2	6	541928	541933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212108
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10587	NC_007516	TGC	2	6	542881	542886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212109
10588	NC_007516	GCT	2	6	542972	542977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212109
10589	NC_007516	CAA	2	6	542992	542997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212109
10590	NC_007516	A	6	6	542996	543001	100 %	0 %	0 %	0 %	78212109
10591	NC_007516	GAC	2	6	543032	543037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212109
10592	NC_007516	CAG	2	6	543133	543138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212109
10593	NC_007516	TA	3	6	543410	543415	50 %	50 %	0 %	0 %	78212110
10594	NC_007516	AAC	2	6	543420	543425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212110
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10596	NC_007516	A	6	6	543448	543453	100 %	0 %	0 %	0 %	78212110
10597	NC_007516	GCC	2	6	543463	543468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212110
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10601	NC_007516	TGG	2	6	543741	543746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212110
10602	NC_007516	A	6	6	543811	543816	100 %	0 %	0 %	0 %	78212110
10603	NC_007516	TCT	2	6	543839	543844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212110
10604	NC_007516	CT	3	6	543874	543879	0 %	50 %	0 %	50 %	78212110
10605	NC_007516	CTTC	2	8	543985	543992	0 %	50 %	0 %	50 %	78212110
10606	NC_007516	GCT	2	6	544015	544020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212110
10607	NC_007516	A	6	6	544021	544026	100 %	0 %	0 %	0 %	78212110
10608	NC_007516	GGA	2	6	544038	544043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212110
10609	NC_007516	AGCT	2	8	544094	544101	25 %	25 %	25 %	25 %	78212110
10610	NC_007516	A	7	7	544139	544145	100 %	0 %	0 %	0 %	78212110
10611	NC_007516	GACAGT	2	12	544234	544245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78212111
10612	NC_007516	GCC	2	6	544293	544298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212111
10613	NC_007516	GCT	2	6	544299	544304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212111
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10615	NC_007516	CAA	2	6	544435	544440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212111
10616	NC_007516	GTT	2	6	544441	544446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212111
10617	NC_007516	CAG	2	6	544542	544547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212111
10618	NC_007516	TGA	2	6	544596	544601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212111
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10620	NC_007516	GCT	2	6	544682	544687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212112
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10622	NC_007516	CTG	2	6	544819	544824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212112
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10972	NC_007516	ACGGTG	2	12	564268	564279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78212131
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10975	NC_007516	TGG	2	6	564521	564526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212131
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10979	NC_007516	CGA	2	6	564884	564889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212132
10980	NC_007516	CATC	2	8	564893	564900	25 %	25 %	0 %	50 %	78212132
10981	NC_007516	GC	3	6	564902	564907	0 %	0 %	50 %	50 %	78212132
10982	NC_007516	CCG	2	6	564911	564916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212132
10983	NC_007516	GGT	2	6	564948	564953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212132
10984	NC_007516	TCAAT	2	10	565030	565039	40 %	40 %	0 %	20 %	78212133
10985	NC_007516	GCT	2	6	565048	565053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10986	NC_007516	GCA	2	6	565081	565086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10987	NC_007516	GCG	2	6	565100	565105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212133
10988	NC_007516	TTGC	2	8	565106	565113	0 %	50 %	25 %	25 %	78212133
10989	NC_007516	GACGG	2	10	565121	565130	20 %	0 %	60 %	20 %	78212133
10990	NC_007516	GTC	2	6	565133	565138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10991	NC_007516	GCTGC	2	10	565156	565165	0 %	20 %	40 %	40 %	78212133
10992	NC_007516	GAC	2	6	565168	565173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10993	NC_007516	TCG	2	6	565185	565190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10994	NC_007516	CCA	2	6	565201	565206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212133
10995	NC_007516	TGCCTG	2	12	565214	565225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10996	NC_007516	GCT	2	6	565319	565324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10997	NC_007516	CGA	2	6	565507	565512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212133
10998	NC_007516	C	7	7	565540	565546	0 %	0 %	0 %	100 %	78212133
10999	NC_007516	CCA	2	6	565573	565578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212133
11000	NC_007516	GCA	2	6	565603	565608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212133

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