MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_007513	ATC	2	6	2227342	2227347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185884
40003	NC_007513	CAA	2	6	2227362	2227367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
40004	NC_007513	TCG	2	6	2227436	2227441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
40005	NC_007513	ACC	2	6	2227451	2227456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
40006	NC_007513	GT	3	6	2227458	2227463	0 %	50 %	50 %	0 %	78185884
40007	NC_007513	TGA	2	6	2227517	2227522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185884
40008	NC_007513	CCG	2	6	2227610	2227615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185884
40009	NC_007513	AAT	2	6	2227647	2227652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78185884
40010	NC_007513	CAA	2	6	2227666	2227671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
40011	NC_007513	A	6	6	2227670	2227675	100 %	0 %	0 %	0 %	78185884
40012	NC_007513	AGC	2	6	2228069	2228074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
40013	NC_007513	GCT	2	6	2228082	2228087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
40014	NC_007513	TGT	2	6	2228169	2228174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
40015	NC_007513	AAC	2	6	2228309	2228314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
40016	NC_007513	GA	3	6	2228319	2228324	50 %	0 %	50 %	0 %	78185884
40017	NC_007513	TCC	2	6	2228327	2228332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185884
40018	NC_007513	CTC	2	6	2228404	2228409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185884
40019	NC_007513	TCTT	2	8	2228411	2228418	0 %	75 %	0 %	25 %	78185884
40020	NC_007513	AGCCA	2	10	2228437	2228446	40 %	0 %	20 %	40 %	78185884
40021	NC_007513	CAC	2	6	2228448	2228453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
40022	NC_007513	TTCC	2	8	2228496	2228503	0 %	50 %	0 %	50 %	78185884
40023	NC_007513	CCA	3	9	2228520	2228528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
40024	NC_007513	TGG	2	6	2228537	2228542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185884
40025	NC_007513	GCG	2	6	2228621	2228626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185884
40026	NC_007513	AAC	2	6	2228668	2228673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
40027	NC_007513	AGG	2	6	2228711	2228716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185884
40028	NC_007513	CAAA	2	8	2228796	2228803	75 %	0 %	0 %	25 %	78185884
40029	NC_007513	TTG	2	6	2228862	2228867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
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40031	NC_007513	GC	3	6	2228947	2228952	0 %	0 %	50 %	50 %	78185884
40032	NC_007513	ACC	2	6	2229050	2229055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
40033	NC_007513	CCG	2	6	2229140	2229145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185884
40034	NC_007513	GCTG	2	8	2229268	2229275	0 %	25 %	50 %	25 %	78185885
40035	NC_007513	GCCA	2	8	2229298	2229305	25 %	0 %	25 %	50 %	78185885
40036	NC_007513	TGA	2	6	2229401	2229406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185885
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40041	NC_007513	A	6	6	2229657	2229662	100 %	0 %	0 %	0 %	78185885
40042	NC_007513	TCCGAT	2	12	2229698	2229709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78185885
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40049	NC_007513	GCC	2	6	2229935	2229940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185885
40050	NC_007513	CGT	2	6	2229956	2229961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185885
40051	NC_007513	GTC	2	6	2230039	2230044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185885
40052	NC_007513	GA	3	6	2230045	2230050	50 %	0 %	50 %	0 %	78185885
40053	NC_007513	CAC	2	6	2230150	2230155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185885
40054	NC_007513	TGCT	2	8	2230180	2230187	0 %	50 %	25 %	25 %	78185885
40055	NC_007513	GAC	2	6	2230203	2230208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185885
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40057	NC_007513	TCA	2	6	2230295	2230300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185885
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40102	NC_007513	TCG	2	6	2233018	2233023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185887
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40105	NC_007513	TCAA	2	8	2233137	2233144	50 %	25 %	0 %	25 %	78185887
40106	NC_007513	AC	3	6	2233185	2233190	50 %	0 %	0 %	50 %	78185887
40107	NC_007513	CAT	2	6	2233204	2233209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185887
40108	NC_007513	ATC	2	6	2233226	2233231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185887
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40110	NC_007513	A	6	6	2233395	2233400	100 %	0 %	0 %	0 %	78185887
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40115	NC_007513	ACG	2	6	2233731	2233736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185888
40116	NC_007513	GGCT	2	8	2233801	2233808	0 %	25 %	50 %	25 %	78185888
40117	NC_007513	TGC	2	6	2233846	2233851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185888
40118	NC_007513	TCGT	2	8	2233998	2234005	0 %	50 %	25 %	25 %	78185888
40119	NC_007513	AGC	2	6	2234008	2234013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185888
40120	NC_007513	A	6	6	2234070	2234075	100 %	0 %	0 %	0 %	78185888
40121	NC_007513	TTG	2	6	2234091	2234096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185888
40122	NC_007513	ACC	2	6	2234184	2234189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185888
40123	NC_007513	ATG	2	6	2234219	2234224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185888
40124	NC_007513	ACC	2	6	2234264	2234269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185888
40125	NC_007513	GTGA	2	8	2234270	2234277	25 %	25 %	50 %	0 %	78185888
40126	NC_007513	ATC	2	6	2234390	2234395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185888
40127	NC_007513	CTT	2	6	2234408	2234413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185888
40128	NC_007513	GGT	2	6	2234414	2234419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185888
40129	NC_007513	TCT	2	6	2234430	2234435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185888
40130	NC_007513	CCAG	2	8	2234441	2234448	25 %	0 %	25 %	50 %	78185888
40131	NC_007513	GCA	2	6	2234450	2234455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185888
40132	NC_007513	GGCC	2	8	2234461	2234468	0 %	0 %	50 %	50 %	78185888
40133	NC_007513	CTG	2	6	2234493	2234498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185888
40134	NC_007513	GGT	2	6	2234506	2234511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185888
40135	NC_007513	CAA	3	9	2234557	2234565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185888

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