MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_007513	TGA	2	6	1080209	1080214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184690
19502	NC_007513	CAT	2	6	1080249	1080254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184690
19503	NC_007513	TG	3	6	1080320	1080325	0 %	50 %	50 %	0 %	78184690
19504	NC_007513	TTG	2	6	1080340	1080345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184690
19505	NC_007513	ACG	2	6	1080414	1080419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184690
19506	NC_007513	ATT	2	6	1080500	1080505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184690
19507	NC_007513	TCA	2	6	1080514	1080519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184690
19508	NC_007513	T	6	6	1080534	1080539	0 %	100 %	0 %	0 %	78184690
19509	NC_007513	GAT	2	6	1080560	1080565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184690
19510	NC_007513	TCA	2	6	1080608	1080613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184690
19511	NC_007513	TCC	2	6	1080695	1080700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184691
19512	NC_007513	TGGTG	2	10	1080737	1080746	0 %	40 %	60 %	0 %	78184691
19513	NC_007513	CT	3	6	1080818	1080823	0 %	50 %	0 %	50 %	78184691
19514	NC_007513	CAT	2	6	1080875	1080880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184691
19515	NC_007513	CAC	2	6	1080881	1080886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184691
19516	NC_007513	CTG	2	6	1080924	1080929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184691
19517	NC_007513	CAG	2	6	1080951	1080956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184691
19518	NC_007513	GGC	2	6	1080986	1080991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184691
19519	NC_007513	TTG	2	6	1081111	1081116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184691
19520	NC_007513	TGG	2	6	1081123	1081128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184691
19521	NC_007513	TGC	2	6	1081154	1081159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184691
19522	NC_007513	TGG	2	6	1081180	1081185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184691
19523	NC_007513	GCA	2	6	1081242	1081247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184691
19524	NC_007513	GTTGG	2	10	1081369	1081378	0 %	40 %	60 %	0 %	78184692
19525	NC_007513	CCA	2	6	1081388	1081393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184692
19526	NC_007513	CAC	2	6	1081426	1081431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184692
19527	NC_007513	TTGG	2	8	1081461	1081468	0 %	50 %	50 %	0 %	78184692
19528	NC_007513	ACG	2	6	1081583	1081588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184692
19529	NC_007513	TGGT	2	8	1081619	1081626	0 %	50 %	50 %	0 %	78184692
19530	NC_007513	TCA	2	6	1081662	1081667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184692
19531	NC_007513	TGG	2	6	1081671	1081676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184692
19532	NC_007513	TTGA	2	8	1081726	1081733	25 %	50 %	25 %	0 %	78184692
19533	NC_007513	TACGAC	2	12	1081774	1081785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78184692
19534	NC_007513	A	6	6	1081960	1081965	100 %	0 %	0 %	0 %	78184693
19535	NC_007513	GAG	2	6	1082023	1082028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184693
19536	NC_007513	TCG	3	9	1082050	1082058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184693
19537	NC_007513	TCG	2	6	1082097	1082102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184693
19538	NC_007513	TGG	2	6	1082199	1082204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184693
19539	NC_007513	GAA	2	6	1082259	1082264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184693
19540	NC_007513	CCG	2	6	1082423	1082428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184693
19541	NC_007513	CAGA	2	8	1082460	1082467	50 %	0 %	25 %	25 %	78184693
19542	NC_007513	AGT	2	6	1082486	1082491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184693
19543	NC_007513	CCA	2	6	1082496	1082501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184694
19544	NC_007513	CTG	2	6	1082552	1082557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184694
19545	NC_007513	GCT	2	6	1082562	1082567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184694
19546	NC_007513	GCA	2	6	1082620	1082625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184694
19547	NC_007513	CAAA	2	8	1082737	1082744	75 %	0 %	0 %	25 %	78184694
19548	NC_007513	TGC	3	9	1082787	1082795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184694
19549	NC_007513	GTA	2	6	1082966	1082971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184694
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19551	NC_007513	GAT	2	6	1083078	1083083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184694
19552	NC_007513	CCG	2	6	1083084	1083089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184694
19553	NC_007513	CAC	2	6	1083148	1083153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184694
19554	NC_007513	TTG	2	6	1083227	1083232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184694
19555	NC_007513	TCG	2	6	1083267	1083272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184694
19556	NC_007513	CCA	2	6	1083280	1083285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184694
19557	NC_007513	CCAC	2	8	1083301	1083308	25 %	0 %	0 %	75 %	78184694
19558	NC_007513	CAG	2	6	1083311	1083316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184694
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19562	NC_007513	CCGG	2	8	1083439	1083446	0 %	0 %	50 %	50 %	78184694
19563	NC_007513	TCT	2	6	1083477	1083482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184694
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19570	NC_007513	GC	3	6	1083754	1083759	0 %	0 %	50 %	50 %	78184694
19571	NC_007513	AATC	2	8	1083764	1083771	50 %	25 %	0 %	25 %	78184694
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19583	NC_007513	TGG	2	6	1084252	1084257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184694
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19588	NC_007513	TCGA	2	8	1084778	1084785	25 %	25 %	25 %	25 %	78184694
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19594	NC_007513	CAAT	2	8	1085172	1085179	50 %	25 %	0 %	25 %	78184694
19595	NC_007513	CTGG	2	8	1085198	1085205	0 %	25 %	50 %	25 %	78184694
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19602	NC_007513	ACC	2	6	1085466	1085471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184694
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19604	NC_007513	GATC	2	8	1085497	1085504	25 %	25 %	25 %	25 %	78184694
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19606	NC_007513	CAGGC	2	10	1085577	1085586	20 %	0 %	40 %	40 %	78184694
19607	NC_007513	AG	3	6	1085587	1085592	50 %	0 %	50 %	0 %	78184694
19608	NC_007513	ACA	2	6	1085635	1085640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184694
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19615	NC_007513	GCT	2	6	1085929	1085934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184694
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