MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_007513	TTC	2	6	1026553	1026558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184636
18503	NC_007513	TCT	2	6	1026629	1026634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184636
18504	NC_007513	CG	3	6	1026652	1026657	0 %	0 %	50 %	50 %	78184636
18505	NC_007513	TTG	3	9	1026692	1026700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184636
18506	NC_007513	GA	3	6	1026701	1026706	50 %	0 %	50 %	0 %	78184636
18507	NC_007513	TGC	2	6	1026740	1026745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184636
18508	NC_007513	GGA	2	6	1026966	1026971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184636
18509	NC_007513	CTC	2	6	1026991	1026996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184636
18510	NC_007513	TTCG	2	8	1027020	1027027	0 %	50 %	25 %	25 %	78184636
18511	NC_007513	CGG	2	6	1027151	1027156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184636
18512	NC_007513	ATCA	2	8	1027250	1027257	50 %	25 %	0 %	25 %	78184637
18513	NC_007513	GAA	2	6	1027356	1027361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184637
18514	NC_007513	TGC	2	6	1027488	1027493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184637
18515	NC_007513	GCG	2	6	1027547	1027552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184637
18516	NC_007513	ATTTGA	2	12	1027563	1027574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78184637
18517	NC_007513	TGC	2	6	1027575	1027580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184638
18518	NC_007513	CGAT	2	8	1027583	1027590	25 %	25 %	25 %	25 %	78184638
18519	NC_007513	GTT	2	6	1027601	1027606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184638
18520	NC_007513	TG	3	6	1027613	1027618	0 %	50 %	50 %	0 %	78184638
18521	NC_007513	GGC	2	6	1027642	1027647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184638
18522	NC_007513	AGG	2	6	1027692	1027697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184638
18523	NC_007513	GTT	2	6	1027734	1027739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184638
18524	NC_007513	ATC	2	6	1027781	1027786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184638
18525	NC_007513	GTG	2	6	1027821	1027826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184638
18526	NC_007513	GGTT	2	8	1027852	1027859	0 %	50 %	50 %	0 %	78184638
18527	NC_007513	GAT	2	6	1028003	1028008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184638
18528	NC_007513	CTC	2	6	1028009	1028014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184638
18529	NC_007513	GCT	2	6	1028063	1028068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184639
18530	NC_007513	CCCA	2	8	1028159	1028166	25 %	0 %	0 %	75 %	78184639
18531	NC_007513	G	6	6	1028168	1028173	0 %	0 %	100 %	0 %	78184639
18532	NC_007513	GCT	2	6	1028222	1028227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184639
18533	NC_007513	AGA	2	6	1028268	1028273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184639
18534	NC_007513	GCA	2	6	1028326	1028331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184639
18535	NC_007513	CAT	2	6	1028473	1028478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184640
18536	NC_007513	CGC	2	6	1028487	1028492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184640
18537	NC_007513	CAG	2	6	1028510	1028515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184640
18538	NC_007513	GAA	2	6	1028569	1028574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184640
18539	NC_007513	CTT	2	6	1028579	1028584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184640
18540	NC_007513	GA	3	6	1028622	1028627	50 %	0 %	50 %	0 %	78184640
18541	NC_007513	CGCA	2	8	1028666	1028673	25 %	0 %	25 %	50 %	78184640
18542	NC_007513	ACCG	2	8	1028686	1028693	25 %	0 %	25 %	50 %	78184640
18543	NC_007513	TGA	2	6	1028697	1028702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184640
18544	NC_007513	GAC	2	6	1028818	1028823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184640
18545	NC_007513	GGGACG	2	12	1028860	1028871	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78184640
18546	NC_007513	TTC	2	6	1028953	1028958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184641
18547	NC_007513	CAC	2	6	1029031	1029036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184641
18548	NC_007513	TCA	2	6	1029117	1029122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184641
18549	NC_007513	GTC	2	6	1029207	1029212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184641
18550	NC_007513	CACC	2	8	1029213	1029220	25 %	0 %	0 %	75 %	78184641
18551	NC_007513	GTT	2	6	1029280	1029285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184641
18552	NC_007513	CGA	2	6	1029297	1029302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184641
18553	NC_007513	TTG	2	6	1029323	1029328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184641
18554	NC_007513	GC	3	6	1029353	1029358	0 %	0 %	50 %	50 %	78184641
18555	NC_007513	CTCC	2	8	1029360	1029367	0 %	25 %	0 %	75 %	78184641
18556	NC_007513	CTC	2	6	1029475	1029480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184641
18557	NC_007513	CAA	2	6	1029549	1029554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184641
18558	NC_007513	GT	3	6	1029639	1029644	0 %	50 %	50 %	0 %	78184641
18559	NC_007513	GGC	2	6	1029664	1029669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184641
18560	NC_007513	CGA	2	6	1029713	1029718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184641
18561	NC_007513	CCGCA	2	10	1029803	1029812	20 %	0 %	20 %	60 %	78184641
18562	NC_007513	CATCG	2	10	1029823	1029832	20 %	20 %	20 %	40 %	78184641
18563	NC_007513	GCT	2	6	1029876	1029881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184641
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18566	NC_007513	CTTTG	2	10	1029951	1029960	0 %	60 %	20 %	20 %	78184641
18567	NC_007513	GTC	2	6	1030009	1030014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184641
18568	NC_007513	CCG	2	6	1030065	1030070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184641
18569	NC_007513	TCG	2	6	1030076	1030081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184641
18570	NC_007513	CGC	2	6	1030107	1030112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184641
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18572	NC_007513	GTT	2	6	1030148	1030153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184641
18573	NC_007513	GC	3	6	1030189	1030194	0 %	0 %	50 %	50 %	78184641
18574	NC_007513	CGC	2	6	1030242	1030247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184641
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18577	NC_007513	GCTG	2	8	1030359	1030366	0 %	25 %	50 %	25 %	78184641
18578	NC_007513	CGT	2	6	1030404	1030409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184641
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18581	NC_007513	TGCA	2	8	1030526	1030533	25 %	25 %	25 %	25 %	78184642
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18585	NC_007513	GT	3	6	1030724	1030729	0 %	50 %	50 %	0 %	78184642
18586	NC_007513	CTCC	2	8	1030792	1030799	0 %	25 %	0 %	75 %	78184642
18587	NC_007513	GCA	2	6	1030801	1030806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184642
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18589	NC_007513	G	6	6	1030972	1030977	0 %	0 %	100 %	0 %	78184642
18590	NC_007513	TGG	2	6	1031031	1031036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184642
18591	NC_007513	AACGAC	2	12	1031042	1031053	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78184642
18592	NC_007513	GGTG	2	8	1031071	1031078	0 %	25 %	75 %	0 %	78184642
18593	NC_007513	TCC	2	6	1031113	1031118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184642
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18597	NC_007513	CGAT	2	8	1031283	1031290	25 %	25 %	25 %	25 %	78184642
18598	NC_007513	TGG	2	6	1031341	1031346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184642
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18601	NC_007513	CAT	2	6	1031463	1031468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184642
18602	NC_007513	CCAAGC	2	12	1031469	1031480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78184642
18603	NC_007513	GTT	2	6	1031543	1031548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184642
18604	NC_007513	TCT	2	6	1031587	1031592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184642
18605	NC_007513	ACGTTG	2	12	1031616	1031627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78184642
18606	NC_007513	AGC	2	6	1031637	1031642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184642
18607	NC_007513	GCTG	2	8	1031653	1031660	0 %	25 %	50 %	25 %	78184642
18608	NC_007513	TGT	2	6	1031689	1031694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184642
18609	NC_007513	TCC	2	6	1031712	1031717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184642
18610	NC_007513	GTTC	2	8	1031773	1031780	0 %	50 %	25 %	25 %	78184642
18611	NC_007513	GCA	2	6	1031899	1031904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184642
18612	NC_007513	GAT	2	6	1031905	1031910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184642
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18615	NC_007513	TGG	2	6	1032072	1032077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184642
18616	NC_007513	GCT	2	6	1032095	1032100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184642
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18618	NC_007513	GTC	2	6	1032203	1032208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184642
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