MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_007513	TCT	2	6	997665	997670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184604
18002	NC_007513	ATT	2	6	997704	997709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184604
18003	NC_007513	TGG	2	6	997748	997753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184604
18004	NC_007513	TGT	2	6	997916	997921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184605
18005	NC_007513	AAATCT	2	12	997942	997953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	78184605
18006	NC_007513	CTC	2	6	997986	997991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184605
18007	NC_007513	ATCG	2	8	998005	998012	25 %	25 %	25 %	25 %	78184605
18008	NC_007513	TGC	2	6	998031	998036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184605
18009	NC_007513	CAA	2	6	998053	998058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184605
18010	NC_007513	CTG	2	6	998084	998089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184605
18011	NC_007513	TTG	2	6	998090	998095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184605
18012	NC_007513	GA	3	6	998138	998143	50 %	0 %	50 %	0 %	78184605
18013	NC_007513	GAT	2	6	999063	999068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184606
18014	NC_007513	TGG	2	6	999166	999171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184606
18015	NC_007513	GTT	2	6	999195	999200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184606
18016	NC_007513	TGG	2	6	999251	999256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184606
18017	NC_007513	TGT	2	6	999293	999298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184606
18018	NC_007513	GCT	2	6	999325	999330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184606
18019	NC_007513	GGC	2	6	999352	999357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184606
18020	NC_007513	CCT	2	6	999369	999374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184606
18021	NC_007513	CCA	2	6	999416	999421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184606
18022	NC_007513	GC	3	6	999470	999475	0 %	0 %	50 %	50 %	78184606
18023	NC_007513	ATCC	2	8	999824	999831	25 %	25 %	0 %	50 %	78184607
18024	NC_007513	CTGG	2	8	999846	999853	0 %	25 %	50 %	25 %	78184607
18025	NC_007513	AAC	2	6	999856	999861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184607
18026	NC_007513	TTA	2	6	999935	999940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184607
18027	NC_007513	CCAG	2	8	999958	999965	25 %	0 %	25 %	50 %	78184607
18028	NC_007513	CT	3	6	999980	999985	0 %	50 %	0 %	50 %	78184607
18029	NC_007513	ATG	2	6	1000038	1000043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184607
18030	NC_007513	GAT	2	6	1000110	1000115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184607
18031	NC_007513	AT	3	6	1000133	1000138	50 %	50 %	0 %	0 %	78184607
18032	NC_007513	GAT	2	6	1000153	1000158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184607
18033	NC_007513	TGG	2	6	1000207	1000212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184607
18034	NC_007513	ATG	2	6	1000241	1000246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184607
18035	NC_007513	GAT	2	6	1000444	1000449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184608
18036	NC_007513	GGATG	2	10	1000456	1000465	20 %	20 %	60 %	0 %	78184608
18037	NC_007513	ATTT	2	8	1000476	1000483	25 %	75 %	0 %	0 %	78184608
18038	NC_007513	TCT	2	6	1000537	1000542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184608
18039	NC_007513	AGC	2	6	1000637	1000642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184608
18040	NC_007513	AATT	2	8	1000662	1000669	50 %	50 %	0 %	0 %	78184608
18041	NC_007513	CAC	2	6	1000674	1000679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184608
18042	NC_007513	AGC	2	6	1001025	1001030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184609
18043	NC_007513	GGGT	2	8	1001042	1001049	0 %	25 %	75 %	0 %	78184609
18044	NC_007513	ACC	2	6	1001061	1001066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184609
18045	NC_007513	GGAG	2	8	1001119	1001126	25 %	0 %	75 %	0 %	78184609
18046	NC_007513	GGT	2	6	1001216	1001221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184609
18047	NC_007513	CAT	2	6	1001253	1001258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184609
18048	NC_007513	GAT	2	6	1001282	1001287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184609
18049	NC_007513	GCT	2	6	1001343	1001348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184609
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18051	NC_007513	T	8	8	1001813	1001820	0 %	100 %	0 %	0 %	78184610
18052	NC_007513	AAT	2	6	1001920	1001925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184610
18053	NC_007513	TTTG	2	8	1001932	1001939	0 %	75 %	25 %	0 %	78184610
18054	NC_007513	TGT	2	6	1002382	1002387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184611
18055	NC_007513	ATC	2	6	1002439	1002444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184611
18056	NC_007513	CAA	3	9	1002552	1002560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184611
18057	NC_007513	TCC	2	6	1002601	1002606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184611
18058	NC_007513	TCA	2	6	1002632	1002637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184611
18059	NC_007513	TTCA	2	8	1002643	1002650	25 %	50 %	0 %	25 %	78184611
18060	NC_007513	TGAA	2	8	1002658	1002665	50 %	25 %	25 %	0 %	78184611
18061	NC_007513	T	6	6	1002727	1002732	0 %	100 %	0 %	0 %	78184611
18062	NC_007513	CAC	2	6	1002787	1002792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184611
18063	NC_007513	C	7	7	1002835	1002841	0 %	0 %	0 %	100 %	78184611
18064	NC_007513	TTCG	2	8	1002988	1002995	0 %	50 %	25 %	25 %	78184612
18065	NC_007513	CAA	2	6	1003037	1003042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184612
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18069	NC_007513	CGT	3	9	1003311	1003319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184612
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18076	NC_007513	TCT	2	6	1003683	1003688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184612
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18087	NC_007513	TGC	2	6	1003946	1003951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184612
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18089	NC_007513	GATAT	2	10	1004003	1004012	40 %	40 %	20 %	0 %	78184612
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18092	NC_007513	TGG	2	6	1004234	1004239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184612
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18102	NC_007513	TGAT	2	8	1004603	1004610	25 %	50 %	25 %	0 %	78184612
18103	NC_007513	CAG	2	6	1004627	1004632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184612
18104	NC_007513	GTGC	2	8	1004797	1004804	0 %	25 %	50 %	25 %	78184612
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18117	NC_007513	TAAA	2	8	1005756	1005763	75 %	25 %	0 %	0 %	78184613
18118	NC_007513	CG	3	6	1005766	1005771	0 %	0 %	50 %	50 %	78184613
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18236	NC_007513	TC	3	6	1012557	1012562	0 %	50 %	0 %	50 %	78184620
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18239	NC_007513	GGC	2	6	1012629	1012634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184620
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18351	NC_007513	CGG	2	6	1018611	1018616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184627
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18353	NC_007513	GCG	2	6	1018748	1018753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184627
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18473	NC_007513	ATG	2	6	1024795	1024800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184635
18474	NC_007513	ATG	2	6	1024804	1024809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184635
18475	NC_007513	CCT	2	6	1024816	1024821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184635
18476	NC_007513	CCA	2	6	1024867	1024872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184635
18477	NC_007513	GTC	3	9	1024923	1024931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184635
18478	NC_007513	CCGG	2	8	1025052	1025059	0 %	0 %	50 %	50 %	78184635
18479	NC_007513	CCA	2	6	1025240	1025245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184635
18480	NC_007513	TGG	2	6	1025348	1025353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184635
18481	NC_007513	GCT	2	6	1025382	1025387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184635
18482	NC_007513	GCT	2	6	1025543	1025548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184635
18483	NC_007513	CCA	2	6	1025582	1025587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184635
18484	NC_007513	TGA	2	6	1025591	1025596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184635
18485	NC_007513	CCA	2	6	1025621	1025626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184635
18486	NC_007513	CGT	2	6	1025661	1025666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184635
18487	NC_007513	AGA	2	6	1025727	1025732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184636
18488	NC_007513	GTC	2	6	1025740	1025745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184636
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18494	NC_007513	TGC	2	6	1025986	1025991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184636
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18496	NC_007513	TGG	2	6	1026171	1026176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184636
18497	NC_007513	CCG	2	6	1026213	1026218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184636
18498	NC_007513	TGA	2	6	1026336	1026341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184636
18499	NC_007513	CTT	2	6	1026396	1026401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184636
18500	NC_007513	CCA	2	6	1026435	1026440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184636

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