MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_007513	TTGC	2	8	955469	955476	0 %	50 %	25 %	25 %	78184548
17502	NC_007513	TCG	2	6	955502	955507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184548
17503	NC_007513	CGA	2	6	955518	955523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184548
17504	NC_007513	TCG	2	6	955526	955531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184548
17505	NC_007513	CGC	2	6	955558	955563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184548
17506	NC_007513	GGC	2	6	955570	955575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184548
17507	NC_007513	AGC	2	6	955643	955648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184548
17508	NC_007513	ATCG	2	8	955717	955724	25 %	25 %	25 %	25 %	78184548
17509	NC_007513	TTC	2	6	956429	956434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184549
17510	NC_007513	TTG	2	6	956548	956553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184549
17511	NC_007513	CGAG	2	8	956586	956593	25 %	0 %	50 %	25 %	78184549
17512	NC_007513	TTA	2	6	956622	956627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184549
17513	NC_007513	ATTGG	2	10	957254	957263	20 %	40 %	40 %	0 %	78184550
17514	NC_007513	GCT	2	6	957281	957286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184550
17515	NC_007513	ACTCG	2	10	957331	957340	20 %	20 %	20 %	40 %	78184550
17516	NC_007513	CGAT	2	8	957387	957394	25 %	25 %	25 %	25 %	78184550
17517	NC_007513	GTCTC	2	10	957403	957412	0 %	40 %	20 %	40 %	78184550
17518	NC_007513	ATC	2	6	957414	957419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184550
17519	NC_007513	CAG	2	6	957500	957505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184550
17520	NC_007513	CGAT	2	8	957687	957694	25 %	25 %	25 %	25 %	78184550
17521	NC_007513	TTC	2	6	957723	957728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184550
17522	NC_007513	TGG	2	6	957738	957743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184550
17523	NC_007513	GAT	2	6	957751	957756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184550
17524	NC_007513	TGC	2	6	957804	957809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184550
17525	NC_007513	GTC	2	6	957952	957957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184551
17526	NC_007513	GCCAAC	2	12	957972	957983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78184551
17527	NC_007513	AAG	2	6	958035	958040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184551
17528	NC_007513	ACA	2	6	958090	958095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184551
17529	NC_007513	TCA	2	6	958106	958111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184551
17530	NC_007513	TGA	2	6	958120	958125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184551
17531	NC_007513	TGGG	2	8	958195	958202	0 %	25 %	75 %	0 %	78184551
17532	NC_007513	G	6	6	958200	958205	0 %	0 %	100 %	0 %	78184551
17533	NC_007513	TCTTCG	2	12	958207	958218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78184551
17534	NC_007513	AGT	2	6	958253	958258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184551
17535	NC_007513	CTA	2	6	958322	958327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184551
17536	NC_007513	GCC	2	6	958328	958333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184551
17537	NC_007513	GCT	2	6	958373	958378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184551
17538	NC_007513	CGAG	2	8	958469	958476	25 %	0 %	50 %	25 %	78184551
17539	NC_007513	GAG	2	6	958486	958491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184551
17540	NC_007513	TCC	2	6	958502	958507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184551
17541	NC_007513	CGAT	2	8	958538	958545	25 %	25 %	25 %	25 %	78184551
17542	NC_007513	CGT	2	6	958607	958612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184551
17543	NC_007513	AGC	2	6	958620	958625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184551
17544	NC_007513	CATGAG	2	12	959449	959460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78184552
17545	NC_007513	GTC	2	6	959471	959476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184552
17546	NC_007513	GC	3	6	959477	959482	0 %	0 %	50 %	50 %	78184552
17547	NC_007513	TTG	2	6	959591	959596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184552
17548	NC_007513	T	6	6	960321	960326	0 %	100 %	0 %	0 %	78184553
17549	NC_007513	AATT	2	8	960329	960336	50 %	50 %	0 %	0 %	78184553
17550	NC_007513	AGTG	2	8	960388	960395	25 %	25 %	50 %	0 %	78184553
17551	NC_007513	TCA	2	6	960994	960999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184554
17552	NC_007513	TGA	2	6	961005	961010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184554
17553	NC_007513	CTG	2	6	961015	961020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184554
17554	NC_007513	T	7	7	961065	961071	0 %	100 %	0 %	0 %	78184554
17555	NC_007513	TGA	2	6	961161	961166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184554
17556	NC_007513	TTG	2	6	961174	961179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184554
17557	NC_007513	GAG	2	6	961224	961229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184554
17558	NC_007513	AAC	2	6	961238	961243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184554
17559	NC_007513	GTT	3	9	961258	961266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184554
17560	NC_007513	TGT	2	6	961323	961328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184554
17561	NC_007513	TTG	2	6	961343	961348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184554
17562	NC_007513	TCGCC	2	10	961485	961494	0 %	20 %	20 %	60 %	78184554
17563	NC_007513	TGG	2	6	961529	961534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184554
17564	NC_007513	ATGCG	2	10	961621	961630	20 %	20 %	40 %	20 %	78184554
17565	NC_007513	T	6	6	961973	961978	0 %	100 %	0 %	0 %	78184555
17566	NC_007513	TC	3	6	961997	962002	0 %	50 %	0 %	50 %	78184555
17567	NC_007513	AG	4	8	962012	962019	50 %	0 %	50 %	0 %	78184555
17568	NC_007513	GAA	2	6	962136	962141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184555
17569	NC_007513	A	8	8	962140	962147	100 %	0 %	0 %	0 %	78184555
17570	NC_007513	CGA	2	6	962153	962158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184555
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17574	NC_007513	GCA	2	6	962550	962555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184556
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17588	NC_007513	ATGA	2	8	963789	963796	50 %	25 %	25 %	0 %	78184558
17589	NC_007513	GCA	2	6	963803	963808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184558
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17591	NC_007513	GAT	2	6	964076	964081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184559
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17593	NC_007513	TGT	2	6	964145	964150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184559
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17610	NC_007513	TGA	2	6	965299	965304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184560
17611	NC_007513	GGGTTT	2	12	965392	965403	0 %	50 %	50 %	0 %	78184560
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17619	NC_007513	TGGTC	2	10	966511	966520	0 %	40 %	40 %	20 %	78184562
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