MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_007513	TGG	2	6	896837	896842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184481
16503	NC_007513	TC	3	6	896876	896881	0 %	50 %	0 %	50 %	78184481
16504	NC_007513	ATC	2	6	896975	896980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184481
16505	NC_007513	GCCC	2	8	897077	897084	0 %	0 %	25 %	75 %	78184482
16506	NC_007513	CCA	2	6	897181	897186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184482
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16508	NC_007513	ATC	2	6	897224	897229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184482
16509	NC_007513	CGAT	2	8	897237	897244	25 %	25 %	25 %	25 %	78184482
16510	NC_007513	CCCTTG	2	12	897260	897271	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78184482
16511	NC_007513	GAG	2	6	897292	897297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184482
16512	NC_007513	GTC	2	6	897410	897415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184482
16513	NC_007513	TC	3	6	897479	897484	0 %	50 %	0 %	50 %	78184482
16514	NC_007513	TGA	2	6	897570	897575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184482
16515	NC_007513	AGCG	2	8	897619	897626	25 %	0 %	50 %	25 %	78184482
16516	NC_007513	AATT	2	8	897677	897684	50 %	50 %	0 %	0 %	78184482
16517	NC_007513	GCT	2	6	897804	897809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184483
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16519	NC_007513	C	6	6	897976	897981	0 %	0 %	0 %	100 %	78184483
16520	NC_007513	AGGA	2	8	898039	898046	50 %	0 %	50 %	0 %	78184483
16521	NC_007513	CGC	2	6	898051	898056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184483
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16523	NC_007513	CGTTT	2	10	898264	898273	0 %	60 %	20 %	20 %	78184483
16524	NC_007513	ACG	2	6	898282	898287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184483
16525	NC_007513	ACG	2	6	898327	898332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184483
16526	NC_007513	CGA	2	6	898421	898426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184483
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16529	NC_007513	GTC	2	6	898595	898600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184484
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16532	NC_007513	TTG	2	6	898677	898682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184484
16533	NC_007513	CTGC	2	8	898689	898696	0 %	25 %	25 %	50 %	78184484
16534	NC_007513	CGG	2	6	898754	898759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184484
16535	NC_007513	TGC	2	6	898783	898788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184484
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16537	NC_007513	AGC	2	6	898863	898868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184484
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16539	NC_007513	GT	3	6	898992	898997	0 %	50 %	50 %	0 %	78184484
16540	NC_007513	CCA	2	6	899023	899028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184484
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16542	NC_007513	C	6	6	899210	899215	0 %	0 %	0 %	100 %	78184485
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16545	NC_007513	TTTGG	2	10	899325	899334	0 %	60 %	40 %	0 %	78184485
16546	NC_007513	TGT	2	6	899362	899367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184485
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16553	NC_007513	TTG	2	6	899913	899918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184486
16554	NC_007513	GAT	2	6	899979	899984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184486
16555	NC_007513	TCG	2	6	899989	899994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184486
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16557	NC_007513	CGTC	2	8	900175	900182	0 %	25 %	25 %	50 %	78184486
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16609	NC_007513	GGCAT	2	10	903331	903340	20 %	20 %	40 %	20 %	78184490
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16987	NC_007513	C	7	7	922716	922722	0 %	0 %	0 %	100 %	78184506
16988	NC_007513	CCA	2	6	922832	922837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184506
16989	NC_007513	GATCAG	2	12	922947	922958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78184506
16990	NC_007513	CGG	2	6	922970	922975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184506
16991	NC_007513	CCAGTT	2	12	923051	923062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78184506
16992	NC_007513	CCAAG	2	10	923064	923073	40 %	0 %	20 %	40 %	78184506
16993	NC_007513	GAAG	2	8	923081	923088	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
16994	NC_007513	GA	3	6	923095	923100	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
16995	NC_007513	AGC	2	6	923191	923196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184506
16996	NC_007513	CAAC	2	8	923216	923223	50 %	0 %	0 %	50 %	78184506
16997	NC_007513	AG	3	6	923229	923234	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
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16999	NC_007513	AGCA	2	8	923361	923368	50 %	0 %	25 %	25 %	78184506
17000	NC_007513	GTC	2	6	923409	923414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184506

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