MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_007513	ACC	2	6	840096	840101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
15502	NC_007513	AGG	2	6	840195	840200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184411
15503	NC_007513	CCG	2	6	840218	840223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184411
15504	NC_007513	TGAG	2	8	840347	840354	25 %	25 %	50 %	0 %	78184412
15505	NC_007513	GCT	2	6	840372	840377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184412
15506	NC_007513	CGG	2	6	840413	840418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184412
15507	NC_007513	CGTC	2	8	840419	840426	0 %	25 %	25 %	50 %	78184412
15508	NC_007513	GAA	2	6	840448	840453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184412
15509	NC_007513	TTCTG	2	10	840527	840536	0 %	60 %	20 %	20 %	78184412
15510	NC_007513	GGC	2	6	840591	840596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184412
15511	NC_007513	TGG	2	6	840612	840617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184412
15512	NC_007513	CTT	2	6	840649	840654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184412
15513	NC_007513	ATG	2	6	840658	840663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184412
15514	NC_007513	AAC	2	6	840709	840714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184412
15515	NC_007513	GCA	2	6	840930	840935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184412
15516	NC_007513	ATGC	2	8	841008	841015	25 %	25 %	25 %	25 %	78184413
15517	NC_007513	TGG	2	6	841093	841098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184413
15518	NC_007513	AAGG	2	8	841181	841188	50 %	0 %	50 %	0 %	78184413
15519	NC_007513	AGC	2	6	841254	841259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184413
15520	NC_007513	CTA	2	6	841264	841269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184413
15521	NC_007513	TCC	2	6	841370	841375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184414
15522	NC_007513	AGC	2	6	841378	841383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184414
15523	NC_007513	CAG	2	6	841401	841406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184414
15524	NC_007513	CGA	2	6	841442	841447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184414
15525	NC_007513	TTC	2	6	841489	841494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184414
15526	NC_007513	GTTT	2	8	841497	841504	0 %	75 %	25 %	0 %	78184414
15527	NC_007513	TGG	2	6	841507	841512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184414
15528	NC_007513	GTT	2	6	841554	841559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184414
15529	NC_007513	TGA	2	6	841630	841635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184414
15530	NC_007513	GAA	2	6	841665	841670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184414
15531	NC_007513	ACG	2	6	841681	841686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184414
15532	NC_007513	TGG	2	6	841732	841737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184414
15533	NC_007513	TGAAC	2	10	841836	841845	40 %	20 %	20 %	20 %	78184414
15534	NC_007513	TCG	2	6	841927	841932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184415
15535	NC_007513	GTT	2	6	841970	841975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184415
15536	NC_007513	AGC	2	6	842075	842080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184415
15537	NC_007513	GATG	2	8	842095	842102	25 %	25 %	50 %	0 %	78184415
15538	NC_007513	GCT	2	6	842176	842181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184415
15539	NC_007513	CCCA	2	8	842225	842232	25 %	0 %	0 %	75 %	78184415
15540	NC_007513	GCA	2	6	842248	842253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184415
15541	NC_007513	TGGCC	2	10	842301	842310	0 %	20 %	40 %	40 %	78184415
15542	NC_007513	CGG	2	6	842388	842393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184415
15543	NC_007513	GAT	2	6	842414	842419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184415
15544	NC_007513	CAG	2	6	842512	842517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184415
15545	NC_007513	TTG	2	6	842541	842546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184415
15546	NC_007513	GGGA	2	8	842550	842557	25 %	0 %	75 %	0 %	78184415
15547	NC_007513	G	6	6	842608	842613	0 %	0 %	100 %	0 %	78184415
15548	NC_007513	GGA	2	6	842764	842769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184415
15549	NC_007513	TTCAG	2	10	842820	842829	20 %	40 %	20 %	20 %	78184415
15550	NC_007513	TGA	2	6	843033	843038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184416
15551	NC_007513	CCAG	2	8	843045	843052	25 %	0 %	25 %	50 %	78184416
15552	NC_007513	GTT	2	6	843080	843085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184416
15553	NC_007513	GGC	2	6	843101	843106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184416
15554	NC_007513	CGC	2	6	843109	843114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184416
15555	NC_007513	G	7	7	843131	843137	0 %	0 %	100 %	0 %	78184416
15556	NC_007513	CAG	3	9	843172	843180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184416
15557	NC_007513	CGT	2	6	843215	843220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184416
15558	NC_007513	TGA	2	6	843231	843236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184416
15559	NC_007513	ACC	2	6	843321	843326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184416
15560	NC_007513	GGC	2	6	843392	843397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184416
15561	NC_007513	TGG	2	6	843526	843531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184416
15562	NC_007513	ACC	2	6	843537	843542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184416
15563	NC_007513	CGGA	2	8	843555	843562	25 %	0 %	50 %	25 %	78184416
15564	NC_007513	AAC	2	6	843597	843602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184416
15565	NC_007513	CAG	2	6	843703	843708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184416
15566	NC_007513	GCA	2	6	843714	843719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184416
15567	NC_007513	GCT	2	6	843754	843759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184416
15568	NC_007513	TCG	2	6	843771	843776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184416
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15573	NC_007513	T	6	6	844067	844072	0 %	100 %	0 %	0 %	78184416
15574	NC_007513	G	8	8	844140	844147	0 %	0 %	100 %	0 %	78184416
15575	NC_007513	CCG	2	6	844163	844168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184416
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15579	NC_007513	CTG	2	6	844371	844376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184416
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15581	NC_007513	CTC	2	6	844470	844475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184416
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15583	NC_007513	TGA	2	6	844519	844524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184416
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15587	NC_007513	GAT	2	6	844633	844638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184416
15588	NC_007513	CCT	2	6	844660	844665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184416
15589	NC_007513	TCG	2	6	844696	844701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184417
15590	NC_007513	GCTC	2	8	844709	844716	0 %	25 %	25 %	50 %	78184417
15591	NC_007513	AAAG	2	8	844745	844752	75 %	0 %	25 %	0 %	78184417
15592	NC_007513	TCA	2	6	844769	844774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184417
15593	NC_007513	TGA	2	6	844892	844897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184417
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15597	NC_007513	CCT	2	6	845699	845704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184418
15598	NC_007513	CT	3	6	845712	845717	0 %	50 %	0 %	50 %	78184418
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15601	NC_007513	GCC	2	6	845788	845793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184418
15602	NC_007513	A	6	6	845842	845847	100 %	0 %	0 %	0 %	78184418
15603	NC_007513	GCG	2	6	845865	845870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184418
15604	NC_007513	CAC	2	6	845883	845888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184418
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15606	NC_007513	CCA	2	6	845966	845971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184418
15607	NC_007513	GGA	2	6	846015	846020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184418
15608	NC_007513	CGA	3	9	846029	846037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184418
15609	NC_007513	CGGAGA	2	12	846050	846061	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78184418
15610	NC_007513	GC	3	6	846073	846078	0 %	0 %	50 %	50 %	78184418
15611	NC_007513	CTT	2	6	846086	846091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184418
15612	NC_007513	CTG	2	6	846104	846109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184418
15613	NC_007513	CCA	2	6	846113	846118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184418
15614	NC_007513	ATCG	2	8	846122	846129	25 %	25 %	25 %	25 %	78184418
15615	NC_007513	CCG	2	6	846170	846175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184418
15616	NC_007513	CTG	2	6	846218	846223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184418
15617	NC_007513	ACA	2	6	846227	846232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184418
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15619	NC_007513	CT	3	6	846570	846575	0 %	50 %	0 %	50 %	78184419
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15991	NC_007513	GA	3	6	866626	866631	50 %	0 %	50 %	0 %	78184440
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