MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_007513	C	6	6	811167	811172	0 %	0 %	0 %	100 %	78184378
15003	NC_007513	AGA	3	9	811198	811206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184378
15004	NC_007513	AAT	2	6	811212	811217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184378
15005	NC_007513	TAA	2	6	811251	811256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184378
15006	NC_007513	A	6	6	811255	811260	100 %	0 %	0 %	0 %	78184378
15007	NC_007513	T	8	8	811280	811287	0 %	100 %	0 %	0 %	78184378
15008	NC_007513	T	7	7	811304	811310	0 %	100 %	0 %	0 %	78184378
15009	NC_007513	TCC	2	6	811344	811349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184378
15010	NC_007513	AAG	2	6	811359	811364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184378
15011	NC_007513	ATT	2	6	811430	811435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184379
15012	NC_007513	CACG	2	8	811535	811542	25 %	0 %	25 %	50 %	78184379
15013	NC_007513	TCGAA	2	10	811571	811580	40 %	20 %	20 %	20 %	78184379
15014	NC_007513	ATC	2	6	811633	811638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184379
15015	NC_007513	TGC	2	6	811700	811705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184379
15016	NC_007513	ACAA	2	8	811725	811732	75 %	0 %	0 %	25 %	78184379
15017	NC_007513	GACA	2	8	811738	811745	50 %	0 %	25 %	25 %	78184379
15018	NC_007513	GTT	2	6	811775	811780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184379
15019	NC_007513	CTTG	2	8	811879	811886	0 %	50 %	25 %	25 %	78184379
15020	NC_007513	CAG	2	6	812434	812439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
15021	NC_007513	CAG	2	6	812473	812478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
15022	NC_007513	CTC	2	6	812534	812539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184380
15023	NC_007513	AG	3	6	812583	812588	50 %	0 %	50 %	0 %	78184380
15024	NC_007513	TTC	2	6	812614	812619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184380
15025	NC_007513	TTGT	2	8	812662	812669	0 %	75 %	25 %	0 %	78184380
15026	NC_007513	GCA	2	6	812700	812705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
15027	NC_007513	TGA	2	6	812745	812750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184380
15028	NC_007513	ATT	2	6	812756	812761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184380
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15032	NC_007513	GTG	2	6	812995	813000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184381
15033	NC_007513	GCT	2	6	813036	813041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184381
15034	NC_007513	CAG	2	6	813128	813133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184381
15035	NC_007513	TCT	2	6	813381	813386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184382
15036	NC_007513	TGG	2	6	813402	813407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184382
15037	NC_007513	GAT	2	6	813432	813437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
15038	NC_007513	TTGA	2	8	813457	813464	25 %	50 %	25 %	0 %	78184382
15039	NC_007513	TATTT	2	10	813468	813477	20 %	80 %	0 %	0 %	78184382
15040	NC_007513	TAG	2	6	813500	813505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
15041	NC_007513	AGT	2	6	813574	813579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
15042	NC_007513	TGC	2	6	813582	813587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184382
15043	NC_007513	AATT	2	8	813588	813595	50 %	50 %	0 %	0 %	78184382
15044	NC_007513	TTTA	2	8	813651	813658	25 %	75 %	0 %	0 %	78184382
15045	NC_007513	TTGC	2	8	813682	813689	0 %	50 %	25 %	25 %	78184382
15046	NC_007513	CCA	2	6	813708	813713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184382
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15048	NC_007513	GGC	2	6	813841	813846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184382
15049	NC_007513	TGA	2	6	813851	813856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
15050	NC_007513	CTG	2	6	813878	813883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184382
15051	NC_007513	TCTG	2	8	813909	813916	0 %	50 %	25 %	25 %	78184382
15052	NC_007513	AAT	2	6	814188	814193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184383
15053	NC_007513	GAT	2	6	814194	814199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184383
15054	NC_007513	CCA	2	6	814304	814309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184383
15055	NC_007513	A	7	7	814309	814315	100 %	0 %	0 %	0 %	78184383
15056	NC_007513	CGCAT	2	10	814328	814337	20 %	20 %	20 %	40 %	78184383
15057	NC_007513	T	6	6	814721	814726	0 %	100 %	0 %	0 %	78184384
15058	NC_007513	GTTC	2	8	814776	814783	0 %	50 %	25 %	25 %	78184384
15059	NC_007513	A	9	9	814807	814815	100 %	0 %	0 %	0 %	78184384
15060	NC_007513	CTG	2	6	814826	814831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184384
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15063	NC_007513	TGT	2	6	815201	815206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184385
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15065	NC_007513	GCT	2	6	815258	815263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184385
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15070	NC_007513	CCAT	2	8	815630	815637	25 %	25 %	0 %	50 %	78184386
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15101	NC_007513	T	7	7	817405	817411	0 %	100 %	0 %	0 %	78184389
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15105	NC_007513	CGT	2	6	817799	817804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184391
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15109	NC_007513	TTG	2	6	818002	818007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184391
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15112	NC_007513	CGC	2	6	818123	818128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184391
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15122	NC_007513	CTG	2	6	818841	818846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184393
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15242	NC_007513	AGC	2	6	826094	826099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184402
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15244	NC_007513	AGG	2	6	826213	826218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184402
15245	NC_007513	GGA	2	6	826221	826226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184402
15246	NC_007513	GCT	2	6	826253	826258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184402
15247	NC_007513	AC	3	6	826261	826266	50 %	0 %	0 %	50 %	78184402
15248	NC_007513	GC	3	6	826311	826316	0 %	0 %	50 %	50 %	78184402
15249	NC_007513	GGA	2	6	826347	826352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184402
15250	NC_007513	CTG	2	6	826377	826382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184402
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15252	NC_007513	GAG	2	6	826422	826427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184402
15253	NC_007513	TCTG	2	8	826550	826557	0 %	50 %	25 %	25 %	78184402
15254	NC_007513	GAC	2	6	826620	826625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184402
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15257	NC_007513	AGC	2	6	826750	826755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184402
15258	NC_007513	TGG	2	6	826759	826764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184402
15259	NC_007513	G	6	6	826799	826804	0 %	0 %	100 %	0 %	78184402
15260	NC_007513	GAA	2	6	826844	826849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184402
15261	NC_007513	GTTGC	2	10	826869	826878	0 %	40 %	40 %	20 %	78184402
15262	NC_007513	ACC	2	6	826893	826898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184402
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15264	NC_007513	ATCGA	2	10	827041	827050	40 %	20 %	20 %	20 %	78184402
15265	NC_007513	CTG	2	6	827164	827169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184402
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15274	NC_007513	A	6	6	827575	827580	100 %	0 %	0 %	0 %	78184402
15275	NC_007513	TAC	2	6	827709	827714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184402
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15282	NC_007513	ACCT	2	8	827941	827948	25 %	25 %	0 %	50 %	78184402
15283	NC_007513	GAT	2	6	827952	827957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184402
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15320	NC_007513	CATA	2	8	829987	829994	50 %	25 %	0 %	25 %	78184403
15321	NC_007513	GCT	2	6	830021	830026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184403
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15332	NC_007513	CTTG	2	8	830373	830380	0 %	50 %	25 %	25 %	78184403
15333	NC_007513	ATTG	3	12	830385	830396	25 %	50 %	25 %	0 %	78184403
15334	NC_007513	GTC	2	6	830414	830419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184403
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15352	NC_007513	CCAC	2	8	831695	831702	25 %	0 %	0 %	75 %	78184405
15353	NC_007513	CCG	2	6	831764	831769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184405
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15355	NC_007513	CCA	2	6	831885	831890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184405
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15357	NC_007513	CGTC	2	8	831975	831982	0 %	25 %	25 %	50 %	78184405
15358	NC_007513	TGAT	2	8	832037	832044	25 %	50 %	25 %	0 %	78184405
15359	NC_007513	TCG	2	6	832049	832054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184405
15360	NC_007513	ATGG	2	8	832124	832131	25 %	25 %	50 %	0 %	78184405
15361	NC_007513	TCCC	2	8	832159	832166	0 %	25 %	0 %	75 %	78184405
15362	NC_007513	GGA	2	6	832241	832246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184405
15363	NC_007513	CCTGG	2	10	832312	832321	0 %	20 %	40 %	40 %	78184405
15364	NC_007513	CTC	2	6	832440	832445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184406
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15488	NC_007513	GGC	2	6	839657	839662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184411
15489	NC_007513	TCC	2	6	839667	839672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184411
15490	NC_007513	CCA	3	9	839688	839696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
15491	NC_007513	ATG	2	6	839724	839729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184411
15492	NC_007513	GCT	2	6	839738	839743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
15493	NC_007513	TCC	2	6	839769	839774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184411
15494	NC_007513	CA	3	6	839799	839804	50 %	0 %	0 %	50 %	78184411
15495	NC_007513	GCTT	2	8	839826	839833	0 %	50 %	25 %	25 %	78184411
15496	NC_007513	CAG	2	6	839837	839842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
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15498	NC_007513	TTCT	2	8	839987	839994	0 %	75 %	0 %	25 %	78184411
15499	NC_007513	CAC	2	6	840008	840013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
15500	NC_007513	GGTC	2	8	840058	840065	0 %	25 %	50 %	25 %	78184411

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