MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007513	CCT	2	6	782833	782838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184345
14502	NC_007513	CCG	2	6	782839	782844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184345
14503	NC_007513	TCC	2	6	782850	782855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184345
14504	NC_007513	GTT	2	6	782904	782909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184346
14505	NC_007513	CG	3	6	782985	782990	0 %	0 %	50 %	50 %	78184346
14506	NC_007513	AGC	2	6	783010	783015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184346
14507	NC_007513	TGAG	2	8	783166	783173	25 %	25 %	50 %	0 %	78184346
14508	NC_007513	TCG	2	6	783206	783211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184346
14509	NC_007513	GTT	2	6	783230	783235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184346
14510	NC_007513	GCG	2	6	783239	783244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184346
14511	NC_007513	AGG	2	6	783316	783321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184346
14512	NC_007513	CTGG	2	8	783348	783355	0 %	25 %	50 %	25 %	78184346
14513	NC_007513	CAG	2	6	783394	783399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184346
14514	NC_007513	GCA	2	6	783440	783445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184346
14515	NC_007513	TGGAT	2	10	783514	783523	20 %	40 %	40 %	0 %	78184347
14516	NC_007513	CTG	2	6	783541	783546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184347
14517	NC_007513	AGAAA	2	10	783548	783557	80 %	0 %	20 %	0 %	78184347
14518	NC_007513	CGT	2	6	783614	783619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184347
14519	NC_007513	TGC	2	6	783688	783693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184347
14520	NC_007513	GAC	2	6	783714	783719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184347
14521	NC_007513	GGCT	2	8	784465	784472	0 %	25 %	50 %	25 %	78184348
14522	NC_007513	TTCA	2	8	784618	784625	25 %	50 %	0 %	25 %	78184348
14523	NC_007513	GATG	2	8	784651	784658	25 %	25 %	50 %	0 %	78184348
14524	NC_007513	GCA	2	6	784673	784678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184348
14525	NC_007513	AATC	2	8	784687	784694	50 %	25 %	0 %	25 %	78184348
14526	NC_007513	AATT	2	8	784720	784727	50 %	50 %	0 %	0 %	78184349
14527	NC_007513	GAC	2	6	784734	784739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184349
14528	NC_007513	GTT	2	6	784785	784790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184349
14529	NC_007513	CCTTT	2	10	784940	784949	0 %	60 %	0 %	40 %	78184349
14530	NC_007513	GCA	2	6	784966	784971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184349
14531	NC_007513	AAC	2	6	785065	785070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184349
14532	NC_007513	GAGCGG	2	12	785117	785128	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78184349
14533	NC_007513	TGA	2	6	785130	785135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184349
14534	NC_007513	CAA	2	6	785160	785165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184349
14535	NC_007513	GGAC	3	12	785170	785181	25 %	0 %	50 %	25 %	78184349
14536	NC_007513	CTG	4	12	785307	785318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184350
14537	NC_007513	GGA	2	6	785368	785373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184350
14538	NC_007513	CA	3	6	785392	785397	50 %	0 %	0 %	50 %	78184350
14539	NC_007513	GTG	2	6	785403	785408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184350
14540	NC_007513	GGT	2	6	785446	785451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184350
14541	NC_007513	ATC	2	6	785474	785479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184350
14542	NC_007513	TGG	3	9	785553	785561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184350
14543	NC_007513	GCA	2	6	785571	785576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184350
14544	NC_007513	ACG	2	6	785579	785584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184350
14545	NC_007513	CAT	3	9	785608	785616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184350
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14548	NC_007513	GAC	2	6	785699	785704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184350
14549	NC_007513	GCA	2	6	785706	785711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184350
14550	NC_007513	G	6	6	785731	785736	0 %	0 %	100 %	0 %	78184350
14551	NC_007513	GAT	2	6	785768	785773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184350
14552	NC_007513	GTT	2	6	785785	785790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184350
14553	NC_007513	TCAAA	2	10	785839	785848	60 %	20 %	0 %	20 %	78184350
14554	NC_007513	A	6	6	785846	785851	100 %	0 %	0 %	0 %	78184350
14555	NC_007513	CCAAT	2	10	785874	785883	40 %	20 %	0 %	40 %	78184350
14556	NC_007513	GCT	2	6	785944	785949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184350
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14558	NC_007513	CGA	2	6	786094	786099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184350
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14564	NC_007513	GCAATC	2	12	786407	786418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78184350
14565	NC_007513	AATT	2	8	786428	786435	50 %	50 %	0 %	0 %	78184350
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14567	NC_007513	ACA	2	6	786471	786476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184351
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14569	NC_007513	TTG	2	6	786543	786548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184351
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14571	NC_007513	GTG	2	6	786627	786632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184351
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14577	NC_007513	TCA	2	6	786880	786885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184351
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14580	NC_007513	TGGC	2	8	787034	787041	0 %	25 %	50 %	25 %	78184352
14581	NC_007513	CAG	2	6	787063	787068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184352
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14589	NC_007513	TTG	2	6	787372	787377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184352
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14592	NC_007513	TGG	2	6	787432	787437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184352
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14595	NC_007513	GCCAG	2	10	787600	787609	20 %	0 %	40 %	40 %	78184353
14596	NC_007513	GTCA	2	8	787631	787638	25 %	25 %	25 %	25 %	78184353
14597	NC_007513	GCT	2	6	787749	787754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184353
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14602	NC_007513	GTT	2	6	787912	787917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184353
14603	NC_007513	A	6	6	787934	787939	100 %	0 %	0 %	0 %	78184353
14604	NC_007513	GGTC	2	8	787982	787989	0 %	25 %	50 %	25 %	78184353
14605	NC_007513	GTCG	2	8	788066	788073	0 %	25 %	50 %	25 %	78184353
14606	NC_007513	ACG	2	6	788174	788179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184353
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14609	NC_007513	CG	3	6	788311	788316	0 %	0 %	50 %	50 %	78184353
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14612	NC_007513	ATC	2	6	788731	788736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184354
14613	NC_007513	TG	3	6	788764	788769	0 %	50 %	50 %	0 %	78184354
14614	NC_007513	TGA	2	6	788811	788816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184354
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