MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007513	CAA	2	6	680613	680618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184245
12502	NC_007513	GCC	2	6	680629	680634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184245
12503	NC_007513	AGC	3	9	680681	680689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
12504	NC_007513	CAG	2	6	680724	680729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
12505	NC_007513	ACG	3	9	680757	680765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
12506	NC_007513	AGG	2	6	680784	680789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184245
12507	NC_007513	CAGC	2	8	680809	680816	25 %	0 %	25 %	50 %	78184245
12508	NC_007513	GC	3	6	680928	680933	0 %	0 %	50 %	50 %	78184245
12509	NC_007513	GCA	2	6	681149	681154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184246
12510	NC_007513	T	6	6	681196	681201	0 %	100 %	0 %	0 %	78184246
12511	NC_007513	CTT	2	6	681235	681240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184246
12512	NC_007513	CGC	2	6	681346	681351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184246
12513	NC_007513	CCT	2	6	681363	681368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184246
12514	NC_007513	CGC	3	9	681539	681547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184246
12515	NC_007513	GGGT	2	8	681591	681598	0 %	25 %	75 %	0 %	78184246
12516	NC_007513	AGGA	2	8	681627	681634	50 %	0 %	50 %	0 %	78184246
12517	NC_007513	TCG	2	6	681699	681704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
12518	NC_007513	TGT	2	6	681705	681710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
12519	NC_007513	TGC	2	6	681719	681724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
12520	NC_007513	TGC	2	6	681876	681881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
12521	NC_007513	CGT	2	6	681916	681921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
12522	NC_007513	ACG	2	6	681929	681934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184247
12523	NC_007513	GTG	2	6	681952	681957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184247
12524	NC_007513	GTT	2	6	681976	681981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
12525	NC_007513	CGTTC	2	10	682009	682018	0 %	40 %	20 %	40 %	78184247
12526	NC_007513	TTG	2	6	682046	682051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
12527	NC_007513	GAGAA	2	10	682103	682112	60 %	0 %	40 %	0 %	78184247
12528	NC_007513	GTT	2	6	682309	682314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
12529	NC_007513	GGATC	2	10	682332	682341	20 %	20 %	40 %	20 %	78184247
12530	NC_007513	AGCC	2	8	682347	682354	25 %	0 %	25 %	50 %	78184247
12531	NC_007513	TCA	2	6	682484	682489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184248
12532	NC_007513	CAC	2	6	682524	682529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184248
12533	NC_007513	CTTTCA	2	12	682622	682633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	78184248
12534	NC_007513	CCA	3	9	682748	682756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184248
12535	NC_007513	CGG	2	6	682822	682827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184248
12536	NC_007513	TCC	2	6	682867	682872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184248
12537	NC_007513	CTG	2	6	682901	682906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12538	NC_007513	CTG	2	6	682915	682920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12539	NC_007513	CTG	2	6	682923	682928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12540	NC_007513	CCAG	2	8	682945	682952	25 %	0 %	25 %	50 %	78184249
12541	NC_007513	GCA	2	6	682954	682959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12542	NC_007513	GTTGT	2	10	683116	683125	0 %	60 %	40 %	0 %	78184249
12543	NC_007513	CGGT	2	8	683212	683219	0 %	25 %	50 %	25 %	78184249
12544	NC_007513	CGG	2	6	683220	683225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184249
12545	NC_007513	GAC	2	6	683230	683235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12546	NC_007513	GCT	2	6	683242	683247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12547	NC_007513	TGC	2	6	683311	683316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12548	NC_007513	CGT	2	6	683388	683393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12549	NC_007513	CGT	3	9	683406	683414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12550	NC_007513	TGC	2	6	683450	683455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
12551	NC_007513	ACC	2	6	683510	683515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184249
12552	NC_007513	CGG	2	6	683536	683541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184249
12553	NC_007513	GCC	2	6	683682	683687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184249
12554	NC_007513	GCC	2	6	683704	683709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184249
12555	NC_007513	TTG	2	6	683795	683800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184249
12556	NC_007513	GTG	3	9	683843	683851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184249
12557	NC_007513	ATC	2	6	683935	683940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184250
12558	NC_007513	T	6	6	683982	683987	0 %	100 %	0 %	0 %	78184250
12559	NC_007513	TCA	2	6	684035	684040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184250
12560	NC_007513	CAG	2	6	684042	684047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184250
12561	NC_007513	CCAG	2	8	684129	684136	25 %	0 %	25 %	50 %	78184250
12562	NC_007513	CCTG	2	8	684187	684194	0 %	25 %	25 %	50 %	78184250
12563	NC_007513	GGT	2	6	684251	684256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184250
12564	NC_007513	GATC	2	8	684296	684303	25 %	25 %	25 %	25 %	78184250
12565	NC_007513	GCT	4	12	684368	684379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184250
12566	NC_007513	CCA	2	6	684488	684493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184250
12567	NC_007513	GAAG	2	8	684561	684568	50 %	0 %	50 %	0 %	78184250
12568	NC_007513	GCG	2	6	684593	684598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184250
12569	NC_007513	GAG	2	6	684615	684620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184250
12570	NC_007513	GTG	2	6	684666	684671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184250
12571	NC_007513	GTGG	2	8	684691	684698	0 %	25 %	75 %	0 %	78184250
12572	NC_007513	TGG	2	6	684929	684934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184250
12573	NC_007513	GCC	3	9	684935	684943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184250
12574	NC_007513	GCG	2	6	684968	684973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184250
12575	NC_007513	GCC	2	6	685137	685142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162138555
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12577	NC_007513	GATT	2	8	685206	685213	25 %	50 %	25 %	0 %	162138555
12578	NC_007513	TGG	2	6	685277	685282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184252
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12580	NC_007513	TCG	2	6	685317	685322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184252
12581	NC_007513	GGC	2	6	685374	685379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184252
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12583	NC_007513	GCC	2	6	685477	685482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184252
12584	NC_007513	CTG	2	6	685657	685662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184252
12585	NC_007513	TCC	2	6	685688	685693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184252
12586	NC_007513	GGC	2	6	685827	685832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184252
12587	NC_007513	TGT	2	6	685869	685874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184252
12588	NC_007513	GT	3	6	685943	685948	0 %	50 %	50 %	0 %	78184252
12589	NC_007513	GGT	3	9	686050	686058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184252
12590	NC_007513	TAC	2	6	686149	686154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184252
12591	NC_007513	AAG	2	6	686167	686172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184252
12592	NC_007513	A	6	6	686212	686217	100 %	0 %	0 %	0 %	78184252
12593	NC_007513	GCTCA	2	10	686291	686300	20 %	20 %	20 %	40 %	78184253
12594	NC_007513	CT	3	6	686327	686332	0 %	50 %	0 %	50 %	78184253
12595	NC_007513	CGTG	2	8	686357	686364	0 %	25 %	50 %	25 %	78184253
12596	NC_007513	AGA	2	6	686413	686418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184253
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12601	NC_007513	GGA	2	6	686550	686555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184254
12602	NC_007513	TTGT	2	8	686589	686596	0 %	75 %	25 %	0 %	78184254
12603	NC_007513	TGGCAG	2	12	686718	686729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184254
12604	NC_007513	GTG	2	6	686822	686827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184254
12605	NC_007513	ACA	2	6	686858	686863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184254
12606	NC_007513	TTG	2	6	686873	686878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184254
12607	NC_007513	CGA	2	6	686910	686915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184254
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12609	NC_007513	GGT	2	6	687037	687042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184254
12610	NC_007513	AG	3	6	687141	687146	50 %	0 %	50 %	0 %	78184254
12611	NC_007513	CCG	2	6	687165	687170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184254
12612	NC_007513	TCG	2	6	687257	687262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184254
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12614	NC_007513	TGC	2	6	687286	687291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184254
12615	NC_007513	CTT	2	6	687316	687321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184255
12616	NC_007513	CCT	2	6	687322	687327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184255
12617	NC_007513	CCAT	2	8	687384	687391	25 %	25 %	0 %	50 %	78184255
12618	NC_007513	CCAG	2	8	687490	687497	25 %	0 %	25 %	50 %	78184255
12619	NC_007513	CGG	2	6	687527	687532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184255
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12621	NC_007513	GTT	2	6	687628	687633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184255
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12985	NC_007513	GCT	2	6	705031	705036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184271
12986	NC_007513	TGC	2	6	705050	705055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184271
12987	NC_007513	CGC	2	6	705062	705067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184271
12988	NC_007513	GTC	2	6	705104	705109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184271
12989	NC_007513	TTG	2	6	705138	705143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184271
12990	NC_007513	T	6	6	705161	705166	0 %	100 %	0 %	0 %	78184271
12991	NC_007513	TTG	2	6	705188	705193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184271
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12993	NC_007513	CTG	2	6	705311	705316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184271
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