MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007513	ACG	2	6	600925	600930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184170
11002	NC_007513	CTCA	2	8	600960	600967	25 %	25 %	0 %	50 %	78184171
11003	NC_007513	TTC	2	6	601074	601079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11004	NC_007513	TCT	2	6	601114	601119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11005	NC_007513	TCT	3	9	601150	601158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11006	NC_007513	CTC	2	6	601188	601193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184171
11007	NC_007513	CTT	2	6	601196	601201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11008	NC_007513	CTT	2	6	601217	601222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11009	NC_007513	CT	3	6	601223	601228	0 %	50 %	0 %	50 %	78184171
11010	NC_007513	CAA	2	6	601244	601249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184171
11011	NC_007513	T	6	6	601285	601290	0 %	100 %	0 %	0 %	78184171
11012	NC_007513	GCC	2	6	601318	601323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184171
11013	NC_007513	GGT	2	6	601372	601377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184171
11014	NC_007513	TGT	2	6	601393	601398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184171
11015	NC_007513	T	6	6	601496	601501	0 %	100 %	0 %	0 %	78184171
11016	NC_007513	ACC	2	6	601519	601524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184171
11017	NC_007513	TGG	2	6	601629	601634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184171
11018	NC_007513	CGGA	2	8	601663	601670	25 %	0 %	50 %	25 %	78184171
11019	NC_007513	CTT	2	6	601673	601678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11020	NC_007513	AAC	2	6	601710	601715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184171
11021	NC_007513	CCGCG	2	10	601753	601762	0 %	0 %	40 %	60 %	78184171
11022	NC_007513	GCCT	2	8	601865	601872	0 %	25 %	25 %	50 %	78184171
11023	NC_007513	ATG	2	6	601891	601896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184171
11024	NC_007513	GCT	2	6	601979	601984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184171
11025	NC_007513	CTTC	2	8	602045	602052	0 %	50 %	0 %	50 %	78184171
11026	NC_007513	TGA	2	6	602131	602136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184171
11027	NC_007513	CAA	2	6	602156	602161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184171
11028	NC_007513	CTC	2	6	602190	602195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184171
11029	NC_007513	TCA	2	6	602236	602241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184171
11030	NC_007513	AG	3	6	602267	602272	50 %	0 %	50 %	0 %	78184171
11031	NC_007513	CAG	2	6	602298	602303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184171
11032	NC_007513	GCT	2	6	602317	602322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184171
11033	NC_007513	CAA	2	6	602324	602329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184171
11034	NC_007513	TCT	2	6	602345	602350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184171
11035	NC_007513	GTG	2	6	602458	602463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184172
11036	NC_007513	AGA	2	6	602551	602556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184172
11037	NC_007513	GCT	2	6	602667	602672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184172
11038	NC_007513	TCC	2	6	602710	602715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184172
11039	NC_007513	GT	3	6	602779	602784	0 %	50 %	50 %	0 %	78184172
11040	NC_007513	CAG	2	6	602823	602828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184172
11041	NC_007513	CA	3	6	602837	602842	50 %	0 %	0 %	50 %	78184172
11042	NC_007513	GCT	2	6	602879	602884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184172
11043	NC_007513	AGA	2	6	602896	602901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184172
11044	NC_007513	GTTG	2	8	603027	603034	0 %	50 %	50 %	0 %	78184173
11045	NC_007513	CTT	2	6	603172	603177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184173
11046	NC_007513	CTG	2	6	603193	603198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184173
11047	NC_007513	TAC	2	6	603317	603322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184174
11048	NC_007513	GTT	2	6	603341	603346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
11049	NC_007513	TGGG	2	8	603360	603367	0 %	25 %	75 %	0 %	78184174
11050	NC_007513	CT	3	6	603368	603373	0 %	50 %	0 %	50 %	78184174
11051	NC_007513	GGCA	2	8	603420	603427	25 %	0 %	50 %	25 %	78184174
11052	NC_007513	TTG	2	6	603467	603472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
11053	NC_007513	CA	3	6	603489	603494	50 %	0 %	0 %	50 %	78184174
11054	NC_007513	TTC	2	6	603583	603588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184174
11055	NC_007513	GTTC	2	8	603720	603727	0 %	50 %	25 %	25 %	78184174
11056	NC_007513	GAT	2	6	603875	603880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184174
11057	NC_007513	TTCC	2	8	603888	603895	0 %	50 %	0 %	50 %	78184174
11058	NC_007513	CAT	2	6	603918	603923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184174
11059	NC_007513	GTT	2	6	603963	603968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
11060	NC_007513	CATGG	2	10	604048	604057	20 %	20 %	40 %	20 %	78184174
11061	NC_007513	CAT	2	6	604089	604094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184174
11062	NC_007513	GTT	2	6	604165	604170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
11063	NC_007513	GATT	2	8	604238	604245	25 %	50 %	25 %	0 %	78184174
11064	NC_007513	TCG	2	6	604262	604267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184174
11065	NC_007513	TTG	2	6	604275	604280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
11066	NC_007513	TC	3	6	604351	604356	0 %	50 %	0 %	50 %	78184174
11067	NC_007513	T	7	7	604394	604400	0 %	100 %	0 %	0 %	78184174
11068	NC_007513	ACG	2	6	604443	604448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184174
11069	NC_007513	CAC	2	6	604459	604464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184174
11070	NC_007513	ACTG	2	8	604482	604489	25 %	25 %	25 %	25 %	78184174
11071	NC_007513	CCG	3	9	604537	604545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184175
11072	NC_007513	GCC	3	9	604554	604562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184175
11073	NC_007513	CCA	2	6	604588	604593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184175
11074	NC_007513	GCC	3	9	604626	604634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184175
11075	NC_007513	GCT	2	6	604656	604661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184175
11076	NC_007513	TTG	2	6	604681	604686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184175
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11078	NC_007513	GTT	2	6	604800	604805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184175
11079	NC_007513	GCACA	2	10	604851	604860	40 %	0 %	20 %	40 %	78184175
11080	NC_007513	GCA	2	6	605084	605089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184176
11081	NC_007513	GTT	2	6	605128	605133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184176
11082	NC_007513	GTT	2	6	605155	605160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184176
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11084	NC_007513	GAG	2	6	605369	605374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184176
11085	NC_007513	ACG	2	6	605384	605389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184176
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11087	NC_007513	CCA	2	6	605456	605461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184176
11088	NC_007513	AATGG	2	10	605468	605477	40 %	20 %	40 %	0 %	78184176
11089	NC_007513	CGT	2	6	605575	605580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184176
11090	NC_007513	GAAT	2	8	605583	605590	50 %	25 %	25 %	0 %	78184176
11091	NC_007513	CCTG	2	8	605606	605613	0 %	25 %	25 %	50 %	78184176
11092	NC_007513	ACG	2	6	605712	605717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184176
11093	NC_007513	CGG	2	6	605736	605741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184176
11094	NC_007513	GGT	2	6	605752	605757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184176
11095	NC_007513	AAG	2	6	605800	605805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184176
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11098	NC_007513	CTG	2	6	606085	606090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184177
11099	NC_007513	GATC	2	8	606146	606153	25 %	25 %	25 %	25 %	78184177
11100	NC_007513	TTG	2	6	606168	606173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184177
11101	NC_007513	CGAG	2	8	606194	606201	25 %	0 %	50 %	25 %	78184177
11102	NC_007513	TCAG	2	8	606282	606289	25 %	25 %	25 %	25 %	78184177
11103	NC_007513	AGC	2	6	606310	606315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184177
11104	NC_007513	TGG	2	6	606328	606333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184177
11105	NC_007513	CAG	2	6	606494	606499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184177
11106	NC_007513	GTTG	2	8	606755	606762	0 %	50 %	50 %	0 %	78184177
11107	NC_007513	CAA	2	6	606791	606796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184177
11108	NC_007513	CGT	2	6	606888	606893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184177
11109	NC_007513	GGT	2	6	606953	606958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184177
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11111	NC_007513	GCA	2	6	607198	607203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184178
11112	NC_007513	GCC	2	6	607294	607299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184178
11113	NC_007513	GATCG	2	10	607336	607345	20 %	20 %	40 %	20 %	78184178
11114	NC_007513	GTG	3	9	607400	607408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184178
11115	NC_007513	TGG	4	12	607457	607468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184178
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11117	NC_007513	GGT	2	6	607614	607619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184178
11118	NC_007513	CTT	2	6	607679	607684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184178
11119	NC_007513	CAA	2	6	607698	607703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184178
11120	NC_007513	GTT	2	6	607728	607733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184178
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11122	NC_007513	GCG	2	6	607803	607808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184178
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11237	NC_007513	TGG	2	6	614827	614832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184183
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11365	NC_007513	ATC	2	6	621061	621066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184186
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11467	NC_007513	GA	3	6	626229	626234	50 %	0 %	50 %	0 %	78184193
11468	NC_007513	G	6	6	626327	626332	0 %	0 %	100 %	0 %	78184193
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11480	NC_007513	AGT	2	6	627086	627091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184194
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