MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007513	CT	3	6	542289	542294	0 %	50 %	0 %	50 %	78184109
10002	NC_007513	GGGA	2	8	542381	542388	25 %	0 %	75 %	0 %	78184109
10003	NC_007513	TCG	2	6	542502	542507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184109
10004	NC_007513	GGC	2	6	542957	542962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184110
10005	NC_007513	GCT	3	9	543112	543120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
10006	NC_007513	CGC	2	6	543242	543247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184110
10007	NC_007513	GTG	2	6	543401	543406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184110
10008	NC_007513	CCA	2	6	543421	543426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184110
10009	NC_007513	TGC	2	6	543460	543465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
10010	NC_007513	GGATG	2	10	543503	543512	20 %	20 %	60 %	0 %	78184110
10011	NC_007513	CGTT	2	8	543593	543600	0 %	50 %	25 %	25 %	78184110
10012	NC_007513	CAG	2	6	543643	543648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184110
10013	NC_007513	TGG	2	6	543652	543657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184110
10014	NC_007513	CTT	2	6	543765	543770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184110
10015	NC_007513	GGC	2	6	543800	543805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184110
10016	NC_007513	CAGGC	2	10	543854	543863	20 %	0 %	40 %	40 %	78184110
10017	NC_007513	CTG	2	6	543957	543962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
10018	NC_007513	CGT	2	6	544001	544006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
10019	NC_007513	ACA	2	6	544070	544075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184110
10020	NC_007513	GCC	3	9	544111	544119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184110
10021	NC_007513	GCC	2	6	544123	544128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184110
10022	NC_007513	GGTG	2	8	544204	544211	0 %	25 %	75 %	0 %	78184110
10023	NC_007513	TAC	2	6	544325	544330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184110
10024	NC_007513	GAG	2	6	544332	544337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184110
10025	NC_007513	TGG	2	6	544406	544411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184110
10026	NC_007513	TTG	2	6	544480	544485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184111
10027	NC_007513	CCG	2	6	544711	544716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184111
10028	NC_007513	GCC	2	6	544762	544767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184111
10029	NC_007513	TGC	2	6	544813	544818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184111
10030	NC_007513	ATGC	2	8	544842	544849	25 %	25 %	25 %	25 %	78184111
10031	NC_007513	AAC	2	6	544883	544888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184111
10032	NC_007513	C	6	6	544910	544915	0 %	0 %	0 %	100 %	78184111
10033	NC_007513	ACG	2	6	544916	544921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184111
10034	NC_007513	GTG	2	6	544940	544945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184111
10035	NC_007513	GGA	2	6	544988	544993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184111
10036	NC_007513	GCG	2	6	545000	545005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184111
10037	NC_007513	GGC	2	6	545047	545052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184111
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10041	NC_007513	TGT	2	6	545599	545604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184113
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10045	NC_007513	AGA	2	6	546137	546142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184115
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10047	NC_007513	CGA	2	6	547068	547073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184116
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10051	NC_007513	CAAG	2	8	547221	547228	50 %	0 %	25 %	25 %	78184116
10052	NC_007513	AGGA	2	8	548129	548136	50 %	0 %	50 %	0 %	78184117
10053	NC_007513	CAG	2	6	548339	548344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184117
10054	NC_007513	TTG	2	6	548345	548350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184117
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10057	NC_007513	TTGC	2	8	548670	548677	0 %	50 %	25 %	25 %	78184118
10058	NC_007513	CTT	2	6	548703	548708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184118
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10060	NC_007513	TAG	2	6	548828	548833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184118
10061	NC_007513	GTT	2	6	548834	548839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184118
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10063	NC_007513	CAT	2	6	549536	549541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184119
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10065	NC_007513	TGG	4	12	549611	549622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184119
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10092	NC_007513	GGA	2	6	551365	551370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184121
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10105	NC_007513	TTA	2	6	551981	551986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184121
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10116	NC_007513	TG	3	6	552717	552722	0 %	50 %	50 %	0 %	78184123
10117	NC_007513	CGGC	2	8	552934	552941	0 %	0 %	50 %	50 %	78184124
10118	NC_007513	CT	3	6	552953	552958	0 %	50 %	0 %	50 %	78184124
10119	NC_007513	TCC	2	6	552967	552972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184124
10120	NC_007513	TGG	2	6	552977	552982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184124
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10122	NC_007513	GCCA	2	8	553002	553009	25 %	0 %	25 %	50 %	78184124
10123	NC_007513	GGT	2	6	553023	553028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184124
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10133	NC_007513	ATCC	2	8	553400	553407	25 %	25 %	0 %	50 %	78184124
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10141	NC_007513	CCT	2	6	553720	553725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184124
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10235	NC_007513	CAC	2	6	558965	558970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184128
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10237	NC_007513	ACC	2	6	559055	559060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184128
10238	NC_007513	TCGTT	2	10	559090	559099	0 %	60 %	20 %	20 %	78184128
10239	NC_007513	CCAGG	2	10	559112	559121	20 %	0 %	40 %	40 %	78184128
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10243	NC_007513	GGC	2	6	559411	559416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184129
10244	NC_007513	CTG	2	6	559454	559459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184129
10245	NC_007513	CGA	2	6	559579	559584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184129
10246	NC_007513	CGT	2	6	559586	559591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184129
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10248	NC_007513	ATC	2	6	559635	559640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184129
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10250	NC_007513	CGA	2	6	559693	559698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184129
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10255	NC_007513	TGA	2	6	559900	559905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184129
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10273	NC_007513	GAT	2	6	560527	560532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184130
10274	NC_007513	CTG	2	6	560548	560553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184130
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10281	NC_007513	GCTG	2	8	560724	560731	0 %	25 %	50 %	25 %	78184130
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10332	NC_007513	TGG	2	6	564218	564223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184133
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10350	NC_007513	AAC	2	6	565104	565109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184134
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10353	NC_007513	GACC	2	8	565251	565258	25 %	0 %	25 %	50 %	78184134
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10361	NC_007513	CTG	2	6	565730	565735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184135
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10485	NC_007513	TGC	2	6	573226	573231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184144
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