MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007513	TGG	2	6	24217	24222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183608
502	NC_007513	CAC	2	6	24232	24237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183608
503	NC_007513	GTT	2	6	24345	24350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183608
504	NC_007513	GGT	2	6	24352	24357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183608
505	NC_007513	TTTC	2	8	24364	24371	0 %	75 %	0 %	25 %	78183608
506	NC_007513	CCGAA	2	10	24530	24539	40 %	0 %	20 %	40 %	78183608
507	NC_007513	CCT	2	6	24561	24566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183608
508	NC_007513	TCA	2	6	24580	24585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183608
509	NC_007513	CAC	2	6	24592	24597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183608
510	NC_007513	GCT	2	6	24651	24656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183608
511	NC_007513	AAGGG	2	10	24665	24674	40 %	0 %	60 %	0 %	78183608
512	NC_007513	CCAG	2	8	24684	24691	25 %	0 %	25 %	50 %	78183608
513	NC_007513	TCG	2	6	24771	24776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183608
514	NC_007513	CCAC	2	8	24841	24848	25 %	0 %	0 %	75 %	78183608
515	NC_007513	TCG	2	6	24865	24870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183608
516	NC_007513	GCCA	2	8	24879	24886	25 %	0 %	25 %	50 %	78183608
517	NC_007513	GGT	2	6	24911	24916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183608
518	NC_007513	G	7	7	24943	24949	0 %	0 %	100 %	0 %	78183608
519	NC_007513	GTC	2	6	24972	24977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
520	NC_007513	TCA	2	6	25022	25027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183609
521	NC_007513	TGC	2	6	25131	25136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
522	NC_007513	TTGT	2	8	25149	25156	0 %	75 %	25 %	0 %	78183609
523	NC_007513	AAG	2	6	25180	25185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183609
524	NC_007513	A	6	6	25225	25230	100 %	0 %	0 %	0 %	78183609
525	NC_007513	TTG	2	6	25231	25236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183609
526	NC_007513	TGG	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183609
527	NC_007513	CG	3	6	25342	25347	0 %	0 %	50 %	50 %	78183609
528	NC_007513	TGG	2	6	25361	25366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183609
529	NC_007513	TCA	2	6	25373	25378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183609
530	NC_007513	GCC	2	6	25386	25391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183609
531	NC_007513	GCG	2	6	25417	25422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183609
532	NC_007513	ATCG	2	8	25590	25597	25 %	25 %	25 %	25 %	78183609
533	NC_007513	ACC	2	6	25653	25658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183609
534	NC_007513	GTC	2	6	25693	25698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
535	NC_007513	CCA	2	6	25727	25732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183609
536	NC_007513	GATCA	2	10	25750	25759	40 %	20 %	20 %	20 %	78183609
537	NC_007513	CGT	2	6	25767	25772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
538	NC_007513	CAA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183609
539	NC_007513	TGC	2	6	25896	25901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
540	NC_007513	AAC	2	6	25912	25917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183609
541	NC_007513	CCA	2	6	25919	25924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183609
542	NC_007513	CGG	2	6	25929	25934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183609
543	NC_007513	GGT	2	6	25963	25968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183609
544	NC_007513	TGG	2	6	25980	25985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183609
545	NC_007513	TTG	2	6	26023	26028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183609
546	NC_007513	CGAT	2	8	26053	26060	25 %	25 %	25 %	25 %	78183609
547	NC_007513	GC	3	6	26079	26084	0 %	0 %	50 %	50 %	78183609
548	NC_007513	TGCTG	2	10	26119	26128	0 %	40 %	40 %	20 %	78183609
549	NC_007513	CAC	3	9	26131	26139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183609
550	NC_007513	GCT	2	6	26145	26150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183609
551	NC_007513	ATGAA	2	10	26327	26336	60 %	20 %	20 %	0 %	78183609
552	NC_007513	TGA	2	6	26725	26730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183610
553	NC_007513	GAT	2	6	26734	26739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183610
554	NC_007513	TGA	2	6	26848	26853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183610
555	NC_007513	GCAT	2	8	26862	26869	25 %	25 %	25 %	25 %	78183610
556	NC_007513	A	6	6	26885	26890	100 %	0 %	0 %	0 %	78183610
557	NC_007513	TGG	2	6	26937	26942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183610
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559	NC_007513	CAC	2	6	27001	27006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183610
560	NC_007513	TGA	2	6	27066	27071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183610
561	NC_007513	CCA	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183610
562	NC_007513	ACA	2	6	27111	27116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183610
563	NC_007513	CGT	2	6	27131	27136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183610
564	NC_007513	TGC	3	9	27142	27150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183610
565	NC_007513	CAC	2	6	27166	27171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183610
566	NC_007513	TGC	2	6	27178	27183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183610
567	NC_007513	TGA	2	6	27324	27329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183610
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571	NC_007513	CCA	2	6	27417	27422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183610
572	NC_007513	CTTGG	2	10	27472	27481	0 %	40 %	40 %	20 %	78183610
573	NC_007513	CAGC	2	8	27502	27509	25 %	0 %	25 %	50 %	78183610
574	NC_007513	GTT	2	6	27512	27517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183610
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578	NC_007513	CGC	2	6	27791	27796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183611
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585	NC_007513	AAGCG	2	10	28171	28180	40 %	0 %	40 %	20 %	78183611
586	NC_007513	GCTG	2	8	28217	28224	0 %	25 %	50 %	25 %	78183611
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598	NC_007513	CGG	2	6	28744	28749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183612
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600	NC_007513	CGT	2	6	28795	28800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183612
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602	NC_007513	AAGGG	2	10	28848	28857	40 %	0 %	60 %	0 %	78183612
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608	NC_007513	GGCT	2	8	29288	29295	0 %	25 %	50 %	25 %	78183612
609	NC_007513	CAG	2	6	29351	29356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183612
610	NC_007513	GAG	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183612
611	NC_007513	GTC	2	6	29480	29485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183612
612	NC_007513	GTC	2	6	29522	29527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183612
613	NC_007513	CAGCC	2	10	29591	29600	20 %	0 %	20 %	60 %	78183612
614	NC_007513	CAGG	2	8	29601	29608	25 %	0 %	50 %	25 %	78183612
615	NC_007513	TCGA	2	8	29776	29783	25 %	25 %	25 %	25 %	78183613
616	NC_007513	GTT	2	6	29887	29892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183613
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618	NC_007513	GAC	2	6	29974	29979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183613
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629	NC_007513	GCCG	2	8	30509	30516	0 %	0 %	50 %	50 %	78183614
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758	NC_007513	CAC	2	6	38432	38437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183624
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761	NC_007513	CGT	2	6	38624	38629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183624
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885	NC_007513	TCAA	2	8	46266	46273	50 %	25 %	0 %	25 %	78183632
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