MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_007513	TTGAT	2	10	486409	486418	20 %	60 %	20 %	0 %	78184045
9003	NC_007513	GGAT	2	8	486421	486428	25 %	25 %	50 %	0 %	78184045
9004	NC_007513	CAC	2	6	486440	486445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184045
9005	NC_007513	CAAA	2	8	486449	486456	75 %	0 %	0 %	25 %	78184045
9006	NC_007513	AGC	2	6	486483	486488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184045
9007	NC_007513	CAA	2	6	486491	486496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184045
9008	NC_007513	CCCT	2	8	486497	486504	0 %	25 %	0 %	75 %	78184045
9009	NC_007513	GTG	2	6	486511	486516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184045
9010	NC_007513	TGT	2	6	486518	486523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184045
9011	NC_007513	GGT	2	6	486524	486529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184045
9012	NC_007513	GA	3	6	486729	486734	50 %	0 %	50 %	0 %	78184046
9013	NC_007513	CCTC	2	8	486780	486787	0 %	25 %	0 %	75 %	78184046
9014	NC_007513	GCGTT	2	10	486807	486816	0 %	40 %	40 %	20 %	78184046
9015	NC_007513	CTGA	2	8	486878	486885	25 %	25 %	25 %	25 %	78184046
9016	NC_007513	GCG	2	6	486914	486919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184046
9017	NC_007513	TGT	2	6	486922	486927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184046
9018	NC_007513	CAT	2	6	487007	487012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184046
9019	NC_007513	GGATT	2	10	487126	487135	20 %	40 %	40 %	0 %	78184046
9020	NC_007513	TCC	2	6	487185	487190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184046
9021	NC_007513	TGC	2	6	487250	487255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184046
9022	NC_007513	GA	3	6	487297	487302	50 %	0 %	50 %	0 %	78184046
9023	NC_007513	GCTG	2	8	487313	487320	0 %	25 %	50 %	25 %	78184046
9024	NC_007513	ATC	2	6	487533	487538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184046
9025	NC_007513	GCA	2	6	487603	487608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184046
9026	NC_007513	CGT	2	6	487735	487740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184046
9027	NC_007513	GGC	2	6	487834	487839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184046
9028	NC_007513	ATGAA	2	10	488222	488231	60 %	20 %	20 %	0 %	78184047
9029	NC_007513	TC	3	6	488249	488254	0 %	50 %	0 %	50 %	78184047
9030	NC_007513	ACC	2	6	488284	488289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184047
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9032	NC_007513	AAT	2	6	488481	488486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184047
9033	NC_007513	CAA	2	6	488642	488647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184048
9034	NC_007513	GCTGA	2	10	488690	488699	20 %	20 %	40 %	20 %	78184048
9035	NC_007513	TCC	2	6	488802	488807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184048
9036	NC_007513	GTG	2	6	488834	488839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184048
9037	NC_007513	GATC	3	12	488879	488890	25 %	25 %	25 %	25 %	78184048
9038	NC_007513	GAG	2	6	488897	488902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184048
9039	NC_007513	TGA	2	6	488920	488925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184048
9040	NC_007513	TGG	2	6	488928	488933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184048
9041	NC_007513	CTG	2	6	489031	489036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184048
9042	NC_007513	GAA	2	6	489258	489263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184049
9043	NC_007513	CCG	2	6	489308	489313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184049
9044	NC_007513	AGC	2	6	489320	489325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
9045	NC_007513	GCGA	2	8	489515	489522	25 %	0 %	50 %	25 %	78184049
9046	NC_007513	CGAG	2	8	489588	489595	25 %	0 %	50 %	25 %	78184049
9047	NC_007513	CAG	2	6	489645	489650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
9048	NC_007513	TAG	2	6	489712	489717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184049
9049	NC_007513	CAG	2	6	489793	489798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
9050	NC_007513	AAGG	2	8	489945	489952	50 %	0 %	50 %	0 %	78184049
9051	NC_007513	AATC	2	8	489996	490003	50 %	25 %	0 %	25 %	78184049
9052	NC_007513	GAG	2	6	490078	490083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184049
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9054	NC_007513	CAG	2	6	490252	490257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
9055	NC_007513	TCA	2	6	490302	490307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184049
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9059	NC_007513	GAA	2	6	490523	490528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184050
9060	NC_007513	TGGTG	2	10	490539	490548	0 %	40 %	60 %	0 %	78184050
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9491	NC_007513	CGA	2	6	513970	513975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184077
9492	NC_007513	TGT	2	6	513993	513998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184077
9493	NC_007513	CCAA	2	8	514039	514046	50 %	0 %	0 %	50 %	78184077
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9496	NC_007513	GTC	2	6	514200	514205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184077
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9498	NC_007513	TACG	2	8	514255	514262	25 %	25 %	25 %	25 %	78184077
9499	NC_007513	GCG	2	6	514277	514282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184077
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