MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_007513	TGA	2	6	447427	447432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184011
8502	NC_007513	TTG	2	6	447450	447455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184011
8503	NC_007513	TCA	2	6	447457	447462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184011
8504	NC_007513	GCT	2	6	447551	447556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184012
8505	NC_007513	GGT	2	6	447559	447564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184012
8506	NC_007513	CAA	2	6	447610	447615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184012
8507	NC_007513	TGT	2	6	447630	447635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184012
8508	NC_007513	TGCA	2	8	447636	447643	25 %	25 %	25 %	25 %	78184012
8509	NC_007513	AGC	2	6	447647	447652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184012
8510	NC_007513	AAC	2	6	452091	452096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184013
8511	NC_007513	ATT	2	6	452145	452150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184013
8512	NC_007513	CTT	2	6	452183	452188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184013
8513	NC_007513	TTG	2	6	452226	452231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184013
8514	NC_007513	TTC	2	6	452268	452273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184013
8515	NC_007513	T	6	6	452348	452353	0 %	100 %	0 %	0 %	78184013
8516	NC_007513	GA	3	6	452436	452441	50 %	0 %	50 %	0 %	78184013
8517	NC_007513	TCG	2	6	452470	452475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184013
8518	NC_007513	GTA	2	6	452692	452697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184013
8519	NC_007513	ACA	2	6	452698	452703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184013
8520	NC_007513	CAG	2	6	452714	452719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184013
8521	NC_007513	AAC	2	6	452721	452726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184013
8522	NC_007513	CTG	2	6	452913	452918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184014
8523	NC_007513	TTC	2	6	452930	452935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184014
8524	NC_007513	A	6	6	452970	452975	100 %	0 %	0 %	0 %	78184014
8525	NC_007513	TGG	2	6	453061	453066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184014
8526	NC_007513	GAG	2	6	453071	453076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184014
8527	NC_007513	AGA	2	6	453108	453113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184014
8528	NC_007513	ACC	2	6	453708	453713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184015
8529	NC_007513	GAAA	2	8	453772	453779	75 %	0 %	25 %	0 %	78184015
8530	NC_007513	AAGG	2	8	454716	454723	50 %	0 %	50 %	0 %	78184016
8531	NC_007513	CA	3	6	454733	454738	50 %	0 %	0 %	50 %	78184016
8532	NC_007513	ATT	2	6	454741	454746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184016
8533	NC_007513	T	6	6	454772	454777	0 %	100 %	0 %	0 %	78184016
8534	NC_007513	TGA	2	6	454788	454793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184016
8535	NC_007513	GCA	2	6	454801	454806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184016
8536	NC_007513	ATC	2	6	454816	454821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184016
8537	NC_007513	AG	3	6	454845	454850	50 %	0 %	50 %	0 %	78184016
8538	NC_007513	AACA	2	8	454940	454947	75 %	0 %	0 %	25 %	78184016
8539	NC_007513	GAA	2	6	454983	454988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184016
8540	NC_007513	ATT	2	6	455026	455031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184016
8541	NC_007513	GCT	2	6	455074	455079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184016
8542	NC_007513	AGG	2	6	455122	455127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184016
8543	NC_007513	GTTG	2	8	455130	455137	0 %	50 %	50 %	0 %	78184016
8544	NC_007513	AACC	2	8	455158	455165	50 %	0 %	0 %	50 %	78184016
8545	NC_007513	CTCA	2	8	455237	455244	25 %	25 %	0 %	50 %	78184016
8546	NC_007513	GTT	2	6	455254	455259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184016
8547	NC_007513	TGC	3	9	455649	455657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184017
8548	NC_007513	TCAT	2	8	455697	455704	25 %	50 %	0 %	25 %	78184017
8549	NC_007513	AGG	2	6	455804	455809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184017
8550	NC_007513	ATG	2	6	455838	455843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184017
8551	NC_007513	ACC	2	6	455847	455852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184017
8552	NC_007513	CAA	2	6	455881	455886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184017
8553	NC_007513	TTC	2	6	455897	455902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184017
8554	NC_007513	AAC	2	6	455909	455914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184017
8555	NC_007513	CCAA	2	8	455930	455937	50 %	0 %	0 %	50 %	78184017
8556	NC_007513	GCG	2	6	455976	455981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184017
8557	NC_007513	ATCG	2	8	456103	456110	25 %	25 %	25 %	25 %	78184017
8558	NC_007513	TGG	2	6	456900	456905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184018
8559	NC_007513	TGCT	2	8	456948	456955	0 %	50 %	25 %	25 %	78184018
8560	NC_007513	TAA	2	6	456957	456962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184018
8561	NC_007513	CTTG	2	8	456964	456971	0 %	50 %	25 %	25 %	78184018
8562	NC_007513	TTAC	2	8	456988	456995	25 %	50 %	0 %	25 %	78184018
8563	NC_007513	TCGA	2	8	457016	457023	25 %	25 %	25 %	25 %	78184018
8564	NC_007513	TAA	2	6	457034	457039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184018
8565	NC_007513	AAC	2	6	457114	457119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184018
8566	NC_007513	GTT	2	6	457125	457130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184018
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8568	NC_007513	CGA	2	6	458177	458182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184019
8569	NC_007513	ATC	2	6	458230	458235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184019
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8571	NC_007513	GAT	2	6	458295	458300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184019
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8573	NC_007513	ATC	2	6	458331	458336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184019
8574	NC_007513	GGAA	2	8	458389	458396	50 %	0 %	50 %	0 %	78184019
8575	NC_007513	GCA	2	6	458406	458411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184019
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8579	NC_007513	CAA	2	6	459294	459299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184020
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8585	NC_007513	A	6	6	461144	461149	100 %	0 %	0 %	0 %	78184021
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8588	NC_007513	CTCAT	2	10	461282	461291	20 %	40 %	0 %	40 %	78184021
8589	NC_007513	AGTTG	2	10	461307	461316	20 %	40 %	40 %	0 %	78184021
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8593	NC_007513	GCT	2	6	461647	461652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184021
8594	NC_007513	TGC	2	6	461691	461696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184021
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8596	NC_007513	ATT	2	6	461737	461742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184021
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8603	NC_007513	CAG	2	6	462312	462317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184022
8604	NC_007513	CT	3	6	462345	462350	0 %	50 %	0 %	50 %	78184022
8605	NC_007513	GTCT	2	8	462357	462364	0 %	50 %	25 %	25 %	78184022
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8608	NC_007513	GATC	2	8	462732	462739	25 %	25 %	25 %	25 %	78184023
8609	NC_007513	TGA	2	6	462750	462755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184023
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8611	NC_007513	CCT	2	6	463023	463028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184024
8612	NC_007513	TGAT	2	8	463034	463041	25 %	50 %	25 %	0 %	78184024
8613	NC_007513	TCT	2	6	463161	463166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184024
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8615	NC_007513	ATTA	2	8	463198	463205	50 %	50 %	0 %	0 %	78184024
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8621	NC_007513	TCGAT	2	10	464825	464834	20 %	40 %	20 %	20 %	78184025
8622	NC_007513	CTT	2	6	464850	464855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184025
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8995	NC_007513	TGC	2	6	486091	486096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184045
8996	NC_007513	CCATC	2	10	486099	486108	20 %	20 %	0 %	60 %	78184045
8997	NC_007513	ACG	2	6	486193	486198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184045
8998	NC_007513	GTT	2	6	486309	486314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184045
8999	NC_007513	TGG	2	6	486325	486330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184045
9000	NC_007513	TTCC	2	8	486334	486341	0 %	50 %	0 %	50 %	78184045

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