MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 40228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787564
2	NC_007432	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787564
3	NC_007432	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	76787564
4	NC_007432	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76787564
5	NC_007432	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787564
6	NC_007432	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	76787564
7	NC_007432	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	76787564
8	NC_007432	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	76787564
9	NC_007432	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787564
10	NC_007432	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787564
11	NC_007432	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787564
12	NC_007432	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	76787564
13	NC_007432	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
14	NC_007432	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	76787564
15	NC_007432	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	76787564
16	NC_007432	G	6	6	782	787	0 %	0 %	100 %	0 %	76787564
17	NC_007432	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787564
18	NC_007432	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	76787564
19	NC_007432	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
20	NC_007432	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76787564
21	NC_007432	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	76787564
22	NC_007432	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787564
23	NC_007432	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
24	NC_007432	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787564
25	NC_007432	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	76787564
26	NC_007432	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	76787564
27	NC_007432	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	76787013
28	NC_007432	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787013
29	NC_007432	TTA	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
30	NC_007432	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
31	NC_007432	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
32	NC_007432	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
33	NC_007432	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	76787013
34	NC_007432	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
35	NC_007432	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787013
36	NC_007432	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
37	NC_007432	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	76787013
38	NC_007432	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787013
39	NC_007432	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787013
40	NC_007432	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787013
41	NC_007432	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787013
42	NC_007432	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76787013
43	NC_007432	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	76787013
44	NC_007432	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787013
45	NC_007432	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	76787013
46	NC_007432	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	76787923
47	NC_007432	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787923
48	NC_007432	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787923
49	NC_007432	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	76787923
50	NC_007432	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787923
51	NC_007432	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	76787923
52	NC_007432	AAAG	2	8	2985	2992	75 %	0 %	25 %	0 %	76787923
53	NC_007432	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787923
54	NC_007432	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76787923
55	NC_007432	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
56	NC_007432	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	76787923
57	NC_007432	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	76787923
58	NC_007432	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	76787923
59	NC_007432	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	76787923
60	NC_007432	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
61	NC_007432	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787923
62	NC_007432	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	76787923
63	NC_007432	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787923
64	NC_007432	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	76787923
65	NC_007432	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
66	NC_007432	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787923
67	NC_007432	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	76787923
68	NC_007432	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	76787923
69	NC_007432	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	76787923
70	NC_007432	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788139
71	NC_007432	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	76788139
72	NC_007432	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788139
73	NC_007432	A	6	6	3891	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	76788139
74	NC_007432	A	7	7	4210	4216	100 %	0 %	0 %	0 %	76787006
75	NC_007432	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788043
76	NC_007432	TTTA	2	8	4523	4530	25 %	75 %	0 %	0 %	76788043
77	NC_007432	GCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
78	NC_007432	TGGTA	2	10	4595	4604	20 %	40 %	40 %	0 %	76788043
79	NC_007432	A	7	7	4653	4659	100 %	0 %	0 %	0 %	76788043
80	NC_007432	AAAT	2	8	4733	4740	75 %	25 %	0 %	0 %	76788043
81	NC_007432	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
82	NC_007432	TCAA	2	8	4899	4906	50 %	25 %	0 %	25 %	76788043
83	NC_007432	A	6	6	4927	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	76788043
84	NC_007432	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
85	NC_007432	GTT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788043
86	NC_007432	AAC	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788043
87	NC_007432	TGA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
88	NC_007432	TGA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
89	NC_007432	AG	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	76788043
90	NC_007432	AGT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
91	NC_007432	GAA	3	9	5217	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
92	NC_007432	TGA	3	9	5237	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
93	NC_007432	ATC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788043
94	NC_007432	ACTT	2	8	5337	5344	25 %	50 %	0 %	25 %	76788043
95	NC_007432	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
96	NC_007432	GCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
97	NC_007432	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788043
98	NC_007432	ATG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
99	NC_007432	AAG	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
100	NC_007432	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
101	NC_007432	TAG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
102	NC_007432	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787164
103	NC_007432	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787164
104	NC_007432	A	6	6	5764	5769	100 %	0 %	0 %	0 %	76787164
105	NC_007432	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787164
106	NC_007432	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	76787164
107	NC_007432	TTTAT	2	10	5844	5853	20 %	80 %	0 %	0 %	76787164
108	NC_007432	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787164
109	NC_007432	CTTA	2	8	5903	5910	25 %	50 %	0 %	25 %	76787164
110	NC_007432	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787164
111	NC_007432	AT	3	6	5942	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	76787164
112	NC_007432	GAT	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787164
113	NC_007432	CTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787164
114	NC_007432	TAT	2	6	6025	6030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
115	NC_007432	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
116	NC_007432	ATG	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787164
117	NC_007432	TAT	2	6	6188	6193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
118	NC_007432	A	6	6	6213	6218	100 %	0 %	0 %	0 %	76787164
119	NC_007432	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
120	NC_007432	GTG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788164
121	NC_007432	A	7	7	6388	6394	100 %	0 %	0 %	0 %	76788164
122	NC_007432	AT	3	6	6443	6448	50 %	50 %	0 %	0 %	76788164
123	NC_007432	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	76788164
124	NC_007432	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
125	NC_007432	GCA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
126	NC_007432	A	7	7	6578	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	76788164
127	NC_007432	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788164
128	NC_007432	CAG	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
129	NC_007432	ATT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
130	NC_007432	A	6	6	6961	6966	100 %	0 %	0 %	0 %	76788164
131	NC_007432	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788164
132	NC_007432	TGA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
133	NC_007432	A	6	6	7151	7156	100 %	0 %	0 %	0 %	76788164
134	NC_007432	TAGC	2	8	7190	7197	25 %	25 %	25 %	25 %	76788164
135	NC_007432	ACA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788164
136	NC_007432	ACCA	2	8	7280	7287	50 %	0 %	0 %	50 %	76788164
137	NC_007432	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788164
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139	NC_007432	T	6	6	7375	7380	0 %	100 %	0 %	0 %	76788164
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