MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007385	GCT	2	6	121516	121521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2002	NC_007385	CCAG	2	8	121525	121532	25 %	0 %	25 %	50 %	74314972
2003	NC_007385	CTG	2	6	121550	121555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2004	NC_007385	TCA	2	6	121718	121723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314973
2005	NC_007385	AGA	2	6	121737	121742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314973
2006	NC_007385	T	6	6	121747	121752	0 %	100 %	0 %	0 %	74314973
2007	NC_007385	CTT	3	9	121839	121847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314973
2008	NC_007385	A	7	7	121852	121858	100 %	0 %	0 %	0 %	74314973
2009	NC_007385	GGA	2	6	121887	121892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314973
2010	NC_007385	CTT	2	6	121898	121903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314973
2011	NC_007385	CA	3	6	122694	122699	50 %	0 %	0 %	50 %	74314974
2012	NC_007385	CAG	2	6	122756	122761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314974
2013	NC_007385	ATG	2	6	122863	122868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314974
2014	NC_007385	CAG	2	6	122956	122961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314975
2015	NC_007385	TCA	2	6	123003	123008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314975
2016	NC_007385	CAG	2	6	123158	123163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314976
2017	NC_007385	CAGG	2	8	123175	123182	25 %	0 %	50 %	25 %	74314976
2018	NC_007385	CA	3	6	123291	123296	50 %	0 %	0 %	50 %	74314976
2019	NC_007385	CTG	2	6	123378	123383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314977
2020	NC_007385	GT	3	6	123386	123391	0 %	50 %	50 %	0 %	74314977
2021	NC_007385	CCG	2	6	123402	123407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314977
2022	NC_007385	TGA	2	6	123464	123469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314977
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2024	NC_007385	TGA	2	6	123644	123649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314977
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2033	NC_007385	TGA	2	6	124497	124502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314979
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2057	NC_007385	GTTA	2	8	125514	125521	25 %	50 %	25 %	0 %	74314979
2058	NC_007385	T	7	7	126084	126090	0 %	100 %	0 %	0 %	74314980
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2104	NC_007385	A	7	7	127681	127687	100 %	0 %	0 %	0 %	74314980
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2109	NC_007385	AAT	2	6	127938	127943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314980
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2111	NC_007385	GAGG	2	8	128106	128113	25 %	0 %	75 %	0 %	74314980
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2123	NC_007385	TGG	2	6	128543	128548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314980
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2125	NC_007385	ATG	2	6	128650	128655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314980
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2130	NC_007385	GGTT	2	8	128832	128839	0 %	50 %	50 %	0 %	74314980
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2240	NC_007385	GCC	2	6	136428	136433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986602
2241	NC_007385	CAGTG	2	10	136447	136456	20 %	20 %	40 %	20 %	161986602
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2245	NC_007385	CTTT	2	8	136552	136559	0 %	75 %	0 %	25 %	161986602
2246	NC_007385	CAG	2	6	136601	136606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986602
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2373	NC_007385	TGA	2	6	146592	146597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315004
2374	NC_007385	AAT	2	6	146629	146634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315004
2375	NC_007385	GCT	2	6	146703	146708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315004
2376	NC_007385	TAAC	2	8	146729	146736	50 %	25 %	0 %	25 %	74315004
2377	NC_007385	A	7	7	146760	146766	100 %	0 %	0 %	0 %	74315004
2378	NC_007385	CCT	2	6	146809	146814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315004
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2381	NC_007385	AG	3	6	147013	147018	50 %	0 %	50 %	0 %	74315004
2382	NC_007385	T	7	7	147021	147027	0 %	100 %	0 %	0 %	74315004
2383	NC_007385	GAAT	2	8	147075	147082	50 %	25 %	25 %	0 %	74315004
2384	NC_007385	ATC	2	6	147111	147116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315004
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2390	NC_007385	GCTCT	2	10	147565	147574	0 %	40 %	20 %	40 %	74315004
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2394	NC_007385	GATGCG	2	12	147970	147981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74315004
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2484	NC_007385	CAG	2	6	152663	152668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2485	NC_007385	GCT	2	6	152700	152705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2486	NC_007385	CCTGCT	2	12	153055	153066	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74315013
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2489	NC_007385	CAA	2	6	153199	153204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315013
2490	NC_007385	TG	3	6	153214	153219	0 %	50 %	50 %	0 %	74315013
2491	NC_007385	A	6	6	153254	153259	100 %	0 %	0 %	0 %	74315013
2492	NC_007385	CCTG	2	8	153283	153290	0 %	25 %	25 %	50 %	74315013
2493	NC_007385	ATC	2	6	153353	153358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315013
2494	NC_007385	TGCC	2	8	153362	153369	0 %	25 %	25 %	50 %	74315013
2495	NC_007385	CCT	2	6	153424	153429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315013
2496	NC_007385	GCG	2	6	153445	153450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315013
2497	NC_007385	GTC	2	6	153560	153565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2498	NC_007385	CAGTG	2	10	153674	153683	20 %	20 %	40 %	20 %	74315013
2499	NC_007385	GTG	2	6	153686	153691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315013
2500	NC_007385	TGC	2	6	153744	153749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315013

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