MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_007384	TCA	2	6	1246921	1246926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311706
21003	NC_007384	GCG	2	6	1246970	1246975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311706
21004	NC_007384	TG	3	6	1246996	1247001	0 %	50 %	50 %	0 %	74311706
21005	NC_007384	TGA	2	6	1247148	1247153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311706
21006	NC_007384	ATCA	2	8	1247191	1247198	50 %	25 %	0 %	25 %	74311706
21007	NC_007384	ACC	2	6	1247200	1247205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311706
21008	NC_007384	TTAT	2	8	1247215	1247222	25 %	75 %	0 %	0 %	74311706
21009	NC_007384	GTGA	2	8	1247228	1247235	25 %	25 %	50 %	0 %	74311706
21010	NC_007384	T	6	6	1247370	1247375	0 %	100 %	0 %	0 %	74311707
21011	NC_007384	GTTTT	2	10	1247377	1247386	0 %	80 %	20 %	0 %	74311707
21012	NC_007384	CGT	2	6	1247393	1247398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311707
21013	NC_007384	GCA	2	6	1247408	1247413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311707
21014	NC_007384	GAGT	2	8	1247442	1247449	25 %	25 %	50 %	0 %	74311707
21015	NC_007384	ATC	2	6	1247499	1247504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311707
21016	NC_007384	T	6	6	1247571	1247576	0 %	100 %	0 %	0 %	74311707
21017	NC_007384	ATCGTA	2	12	1247595	1247606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	74311707
21018	NC_007384	GCT	2	6	1247634	1247639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311707
21019	NC_007384	GCA	2	6	1247677	1247682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311707
21020	NC_007384	AGC	2	6	1247707	1247712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311707
21021	NC_007384	TG	3	6	1247992	1247997	0 %	50 %	50 %	0 %	74311708
21022	NC_007384	AGC	2	6	1248007	1248012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311708
21023	NC_007384	A	8	8	1248041	1248048	100 %	0 %	0 %	0 %	74311708
21024	NC_007384	TGA	2	6	1248077	1248082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311708
21025	NC_007384	GAT	2	6	1248108	1248113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311708
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21028	NC_007384	GAC	2	6	1248262	1248267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311708
21029	NC_007384	GCT	2	6	1248380	1248385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311709
21030	NC_007384	AGT	2	6	1248404	1248409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311709
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21032	NC_007384	GTTCA	2	10	1248544	1248553	20 %	40 %	20 %	20 %	74311709
21033	NC_007384	GAA	2	6	1248683	1248688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311709
21034	NC_007384	CGG	2	6	1248757	1248762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311709
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21036	NC_007384	T	6	6	1248885	1248890	0 %	100 %	0 %	0 %	74311709
21037	NC_007384	TGA	2	6	1248956	1248961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311709
21038	NC_007384	TGA	2	6	1249100	1249105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986544
21039	NC_007384	TG	3	6	1249169	1249174	0 %	50 %	50 %	0 %	161986544
21040	NC_007384	GATG	2	8	1249206	1249213	25 %	25 %	50 %	0 %	161986544
21041	NC_007384	CGA	2	6	1249221	1249226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986544
21042	NC_007384	CGT	2	6	1249294	1249299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986544
21043	NC_007384	ATTAA	2	10	1249321	1249330	60 %	40 %	0 %	0 %	161986544
21044	NC_007384	TACT	2	8	1249424	1249431	25 %	50 %	0 %	25 %	161986544
21045	NC_007384	TAAA	2	8	1249523	1249530	75 %	25 %	0 %	0 %	161986544
21046	NC_007384	TGC	2	6	1250437	1250442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311711
21047	NC_007384	GCCA	2	8	1250531	1250538	25 %	0 %	25 %	50 %	74311711
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21049	NC_007384	CAG	2	6	1250571	1250576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311711
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21051	NC_007384	CAGC	2	8	1250664	1250671	25 %	0 %	25 %	50 %	74311711
21052	NC_007384	T	6	6	1250778	1250783	0 %	100 %	0 %	0 %	74311711
21053	NC_007384	TGC	2	6	1251487	1251492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311712
21054	NC_007384	GCCA	2	8	1251581	1251588	25 %	0 %	25 %	50 %	74311712
21055	NC_007384	CAC	2	6	1251603	1251608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311712
21056	NC_007384	CAG	2	6	1251621	1251626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311712
21057	NC_007384	CAA	2	6	1251677	1251682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311712
21058	NC_007384	CAGC	2	8	1251714	1251721	25 %	0 %	25 %	50 %	74311712
21059	NC_007384	T	6	6	1251828	1251833	0 %	100 %	0 %	0 %	74311712
21060	NC_007384	TGT	2	6	1252593	1252598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311713
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21064	NC_007384	TGAT	2	8	1252773	1252780	25 %	50 %	25 %	0 %	74311713
21065	NC_007384	GCCA	2	8	1252829	1252836	25 %	0 %	25 %	50 %	74311713
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21068	NC_007384	TGGTG	2	10	1252975	1252984	0 %	40 %	60 %	0 %	74311713
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21089	NC_007384	GCTG	2	8	1254515	1254522	0 %	25 %	50 %	25 %	74311714
21090	NC_007384	CAA	2	6	1254525	1254530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311714
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21094	NC_007384	TCG	2	6	1254587	1254592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311714
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21099	NC_007384	GCA	2	6	1256133	1256138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311715
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21101	NC_007384	AG	3	6	1256583	1256588	50 %	0 %	50 %	0 %	74311716
21102	NC_007384	CAG	2	6	1256616	1256621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311716
21103	NC_007384	CAG	2	6	1256694	1256699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311716
21104	NC_007384	CAG	2	6	1256796	1256801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311716
21105	NC_007384	AT	3	6	1256810	1256815	50 %	50 %	0 %	0 %	74311716
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21118	NC_007384	GAT	2	6	1257312	1257317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311716
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21472	NC_007384	CGCA	2	8	1280846	1280853	25 %	0 %	25 %	50 %	74311738
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21474	NC_007384	TGC	2	6	1280888	1280893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311738
21475	NC_007384	GCA	2	6	1280930	1280935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311738
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