MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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20119	NC_007384	GGCGCA	2	12	1194058	1194069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74311656
20120	NC_007384	GT	3	6	1194215	1194220	0 %	50 %	50 %	0 %	74311656
20121	NC_007384	GCG	2	6	1194262	1194267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311656
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20469	NC_007384	GCG	2	6	1214461	1214466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311675
20470	NC_007384	GAA	2	6	1214480	1214485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311675
20471	NC_007384	TCGG	2	8	1214616	1214623	0 %	25 %	50 %	25 %	74311675
20472	NC_007384	GCA	2	6	1214638	1214643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311675
20473	NC_007384	TCC	2	6	1214661	1214666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74311675
20474	NC_007384	GCTG	2	8	1214674	1214681	0 %	25 %	50 %	25 %	74311675
20475	NC_007384	TCA	3	9	1214712	1214720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311675
20476	NC_007384	CGCGC	2	10	1214774	1214783	0 %	0 %	40 %	60 %	74311675
20477	NC_007384	T	6	6	1214879	1214884	0 %	100 %	0 %	0 %	74311675
20478	NC_007384	TG	3	6	1214914	1214919	0 %	50 %	50 %	0 %	74311675
20479	NC_007384	TCG	2	6	1214974	1214979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311675
20480	NC_007384	GAG	2	6	1215006	1215011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311675
20481	NC_007384	TGA	2	6	1215021	1215026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311675
20482	NC_007384	TCA	2	6	1215070	1215075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311675
20483	NC_007384	TCA	2	6	1215102	1215107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311675
20484	NC_007384	ACC	2	6	1215147	1215152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311675
20485	NC_007384	CAG	2	6	1215218	1215223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311675
20486	NC_007384	GCT	2	6	1215226	1215231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311675
20487	NC_007384	AAC	2	6	1215445	1215450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311676
20488	NC_007384	CAG	2	6	1215534	1215539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311676
20489	NC_007384	GCG	2	6	1215557	1215562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311676
20490	NC_007384	TGC	2	6	1215570	1215575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311676
20491	NC_007384	GTG	2	6	1215628	1215633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311676
20492	NC_007384	CAG	2	6	1215666	1215671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311676
20493	NC_007384	TGG	2	6	1215674	1215679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311676
20494	NC_007384	CAC	2	6	1215726	1215731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311676
20495	NC_007384	ACA	2	6	1215746	1215751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311676
20496	NC_007384	AAC	2	6	1215766	1215771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311676
20497	NC_007384	ACCG	2	8	1215777	1215784	25 %	0 %	25 %	50 %	74311676
20498	NC_007384	AAG	2	6	1215800	1215805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311676
20499	NC_007384	CAG	2	6	1215810	1215815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311676
20500	NC_007384	GGC	2	6	1215818	1215823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311676

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