MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_007384	CCG	2	6	1056863	1056868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311533
18003	NC_007384	TGA	2	6	1056882	1056887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311533
18004	NC_007384	TC	3	6	1056997	1057002	0 %	50 %	0 %	50 %	74311533
18005	NC_007384	GTG	2	6	1057160	1057165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311533
18006	NC_007384	AGA	2	6	1057177	1057182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311533
18007	NC_007384	TGGC	2	8	1057223	1057230	0 %	25 %	50 %	25 %	74311533
18008	NC_007384	T	7	7	1057471	1057477	0 %	100 %	0 %	0 %	74311534
18009	NC_007384	CTT	2	6	1057691	1057696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311534
18010	NC_007384	TCT	2	6	1057723	1057728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311534
18011	NC_007384	AATA	2	8	1057746	1057753	75 %	25 %	0 %	0 %	74311534
18012	NC_007384	CTG	2	6	1057761	1057766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311534
18013	NC_007384	TGG	2	6	1057777	1057782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311534
18014	NC_007384	TC	3	6	1057796	1057801	0 %	50 %	0 %	50 %	74311534
18015	NC_007384	TAT	2	6	1057976	1057981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311534
18016	NC_007384	GGC	2	6	1058141	1058146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311534
18017	NC_007384	CACT	2	8	1058270	1058277	25 %	25 %	0 %	50 %	74311534
18018	NC_007384	GGC	2	6	1058501	1058506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311534
18019	NC_007384	CAT	2	6	1058555	1058560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311534
18020	NC_007384	TGCCGT	2	12	1058671	1058682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311534
18021	NC_007384	GGT	2	6	1058701	1058706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311534
18022	NC_007384	GTC	2	6	1058722	1058727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311534
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18024	NC_007384	GCA	2	6	1058912	1058917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311534
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18026	NC_007384	CTG	2	6	1058975	1058980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311535
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18028	NC_007384	CTG	2	6	1059041	1059046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311535
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18030	NC_007384	ATG	3	9	1059063	1059071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311535
18031	NC_007384	TGG	2	6	1059139	1059144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311535
18032	NC_007384	ATT	2	6	1059148	1059153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311535
18033	NC_007384	GCC	2	6	1059155	1059160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311535
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18035	NC_007384	GAT	2	6	1059205	1059210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311535
18036	NC_007384	GTGCT	2	10	1059215	1059224	0 %	40 %	40 %	20 %	74311535
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18039	NC_007384	TTG	2	6	1059359	1059364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311535
18040	NC_007384	CTG	2	6	1059428	1059433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311535
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18042	NC_007384	TGG	2	6	1059675	1059680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311535
18043	NC_007384	AAT	2	6	1059704	1059709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311535
18044	NC_007384	TCG	2	6	1059711	1059716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311535
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18052	NC_007384	TCG	2	6	1060107	1060112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311536
18053	NC_007384	TTG	2	6	1060118	1060123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311536
18054	NC_007384	AACG	2	8	1060179	1060186	50 %	0 %	25 %	25 %	74311536
18055	NC_007384	TCT	2	6	1060289	1060294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311537
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18057	NC_007384	GTC	2	6	1060369	1060374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311537
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18059	NC_007384	CCAA	2	8	1060389	1060396	50 %	0 %	0 %	50 %	74311537
18060	NC_007384	CG	3	6	1060471	1060476	0 %	0 %	50 %	50 %	74311537
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18087	NC_007384	CAT	2	6	1062273	1062278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311538
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18089	NC_007384	CCG	2	6	1062329	1062334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311538
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18099	NC_007384	GCT	2	6	1062965	1062970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311538
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18102	NC_007384	GCGA	2	8	1063074	1063081	25 %	0 %	50 %	25 %	74311538
18103	NC_007384	GTT	2	6	1063098	1063103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311538
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18105	NC_007384	CTTT	2	8	1063174	1063181	0 %	75 %	0 %	25 %	74311538
18106	NC_007384	ACCAT	2	10	1063327	1063336	40 %	20 %	0 %	40 %	74311538
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18108	NC_007384	GCA	2	6	1063571	1063576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311538
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18110	NC_007384	GATC	2	8	1063796	1063803	25 %	25 %	25 %	25 %	74311538
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18115	NC_007384	GCA	2	6	1064238	1064243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986556
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18117	NC_007384	TCG	2	6	1064366	1064371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311540
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18229	NC_007384	ATG	2	6	1071863	1071868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311549
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18232	NC_007384	TTC	2	6	1073145	1073150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986555
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18352	NC_007384	TCAG	2	8	1082769	1082776	25 %	25 %	25 %	25 %	74311555
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