MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_007384	CTGA	2	8	938428	938435	25 %	25 %	25 %	25 %	74311441
16003	NC_007384	CGGT	2	8	938480	938487	0 %	25 %	50 %	25 %	74311441
16004	NC_007384	TGC	3	9	938699	938707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311441
16005	NC_007384	AAC	2	6	938785	938790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311441
16006	NC_007384	GTG	2	6	938815	938820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311441
16007	NC_007384	TGA	2	6	938825	938830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311441
16008	NC_007384	CCA	2	6	938831	938836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311441
16009	NC_007384	CCA	2	6	938880	938885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311441
16010	NC_007384	CGATG	2	10	938898	938907	20 %	20 %	40 %	20 %	74311441
16011	NC_007384	AAG	2	6	938917	938922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311441
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16013	NC_007384	ATC	2	6	938972	938977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311441
16014	NC_007384	GGT	2	6	939000	939005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311441
16015	NC_007384	TCG	2	6	939017	939022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311441
16016	NC_007384	CTGG	2	8	939084	939091	0 %	25 %	50 %	25 %	74311441
16017	NC_007384	A	6	6	939157	939162	100 %	0 %	0 %	0 %	74311441
16018	NC_007384	CTG	2	6	939178	939183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311441
16019	NC_007384	TGG	2	6	939194	939199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311441
16020	NC_007384	CGG	2	6	939201	939206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311441
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16022	NC_007384	TG	3	6	940157	940162	0 %	50 %	50 %	0 %	74311442
16023	NC_007384	TCT	2	6	940249	940254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311442
16024	NC_007384	CATT	2	8	940544	940551	25 %	50 %	0 %	25 %	74311443
16025	NC_007384	ATT	2	6	940586	940591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311443
16026	NC_007384	TTGA	2	8	940613	940620	25 %	50 %	25 %	0 %	74311443
16027	NC_007384	TG	3	6	940670	940675	0 %	50 %	50 %	0 %	74311443
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16030	NC_007384	CTT	2	6	940927	940932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311443
16031	NC_007384	TGACC	2	10	940957	940966	20 %	20 %	20 %	40 %	74311443
16032	NC_007384	TAC	2	6	941020	941025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311443
16033	NC_007384	CG	3	6	941057	941062	0 %	0 %	50 %	50 %	74311443
16034	NC_007384	ACC	2	6	941074	941079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311443
16035	NC_007384	GC	3	6	941141	941146	0 %	0 %	50 %	50 %	74311443
16036	NC_007384	C	6	6	941160	941165	0 %	0 %	0 %	100 %	74311443
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16041	NC_007384	TAT	2	6	941386	941391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311444
16042	NC_007384	TTG	2	6	941392	941397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311444
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16046	NC_007384	CAT	2	6	941538	941543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311444
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16050	NC_007384	AGGCG	2	10	941698	941707	20 %	0 %	60 %	20 %	74311444
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16053	NC_007384	GGCT	2	8	941796	941803	0 %	25 %	50 %	25 %	74311444
16054	NC_007384	CAG	2	6	941857	941862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311444
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16061	NC_007384	TCAGC	2	10	942375	942384	20 %	20 %	20 %	40 %	74311444
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16103	NC_007384	GC	3	6	944552	944557	0 %	0 %	50 %	50 %	74311445
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16114	NC_007384	CG	3	6	945321	945326	0 %	0 %	50 %	50 %	74311446
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16120	NC_007384	ACGGA	2	10	945582	945591	40 %	0 %	40 %	20 %	74311446
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16354	NC_007384	T	6	6	957325	957330	0 %	100 %	0 %	0 %	74311453
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16483	NC_007384	GCT	2	6	967544	967549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311459
16484	NC_007384	CGT	2	6	967565	967570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311459
16485	NC_007384	TGG	2	6	967580	967585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311459
16486	NC_007384	GTG	2	6	967666	967671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311459
16487	NC_007384	GCCA	2	8	967686	967693	25 %	0 %	25 %	50 %	74311459
16488	NC_007384	TGAA	2	8	967732	967739	50 %	25 %	25 %	0 %	74311459
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16491	NC_007384	ACC	3	9	967935	967943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311460
16492	NC_007384	TGA	2	6	967982	967987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311460
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16496	NC_007384	AGAC	2	8	968236	968243	50 %	0 %	25 %	25 %	74311460
16497	NC_007384	CGG	2	6	968276	968281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311460
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16499	NC_007384	CAA	3	9	968441	968449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311460
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