MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007384	TGG	2	6	845488	845493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311361
14502	NC_007384	GCA	2	6	845539	845544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311361
14503	NC_007384	GCT	2	6	845638	845643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311361
14504	NC_007384	CAGTA	2	10	845654	845663	40 %	20 %	20 %	20 %	74311361
14505	NC_007384	CAT	2	6	845705	845710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311361
14506	NC_007384	ACCA	2	8	845795	845802	50 %	0 %	0 %	50 %	74311361
14507	NC_007384	ACA	2	6	845862	845867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311361
14508	NC_007384	AAT	2	6	845883	845888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311361
14509	NC_007384	GTT	2	6	846171	846176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311362
14510	NC_007384	CGG	3	9	846198	846206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311362
14511	NC_007384	CGG	2	6	846267	846272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311362
14512	NC_007384	TGAG	2	8	846449	846456	25 %	25 %	50 %	0 %	74311362
14513	NC_007384	CTGG	2	8	846599	846606	0 %	25 %	50 %	25 %	74311362
14514	NC_007384	CGA	2	6	846663	846668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14515	NC_007384	CAA	2	6	846675	846680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311362
14516	NC_007384	TCGACA	2	12	846683	846694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	74311362
14517	NC_007384	GCTG	2	8	846701	846708	0 %	25 %	50 %	25 %	74311362
14518	NC_007384	ATC	3	9	846742	846750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311362
14519	NC_007384	CGG	2	6	846851	846856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311362
14520	NC_007384	CTG	2	6	846877	846882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14521	NC_007384	AAG	2	6	846895	846900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311362
14522	NC_007384	CG	5	10	846977	846986	0 %	0 %	50 %	50 %	74311362
14523	NC_007384	TGGAAG	2	12	847085	847096	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	74311362
14524	NC_007384	CTG	3	9	847144	847152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14525	NC_007384	GCT	2	6	847206	847211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14526	NC_007384	TGG	2	6	847220	847225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311362
14527	NC_007384	CG	3	6	847269	847274	0 %	0 %	50 %	50 %	74311362
14528	NC_007384	TAC	2	6	847282	847287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311362
14529	NC_007384	GCA	2	6	847382	847387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14530	NC_007384	GAC	2	6	847414	847419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311362
14531	NC_007384	ATG	2	6	847483	847488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311362
14532	NC_007384	ACCA	2	8	847522	847529	50 %	0 %	0 %	50 %	74311362
14533	NC_007384	CG	3	6	847660	847665	0 %	0 %	50 %	50 %	74311362
14534	NC_007384	GTA	2	6	847700	847705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311362
14535	NC_007384	CAG	2	6	847938	847943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14536	NC_007384	TTC	2	6	847953	847958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311363
14537	NC_007384	CG	4	8	848006	848013	0 %	0 %	50 %	50 %	74311363
14538	NC_007384	CAG	2	6	848115	848120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14539	NC_007384	CCAG	2	8	848319	848326	25 %	0 %	25 %	50 %	74311363
14540	NC_007384	GGCGCT	2	12	848351	848362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74311363
14541	NC_007384	ACG	2	6	848374	848379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14542	NC_007384	TCA	2	6	848413	848418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311363
14543	NC_007384	CGT	2	6	848438	848443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14544	NC_007384	TCA	2	6	848479	848484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311363
14545	NC_007384	TGCC	2	8	848493	848500	0 %	25 %	25 %	50 %	74311363
14546	NC_007384	GCA	2	6	848522	848527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14547	NC_007384	CCG	2	6	848701	848706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311363
14548	NC_007384	CGT	2	6	848708	848713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14549	NC_007384	GCT	2	6	848882	848887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14550	NC_007384	CAT	2	6	848907	848912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311363
14551	NC_007384	CAG	2	6	848913	848918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14552	NC_007384	GTT	2	6	849003	849008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311363
14553	NC_007384	TG	3	6	849046	849051	0 %	50 %	50 %	0 %	74311363
14554	NC_007384	CCA	2	6	849066	849071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311363
14555	NC_007384	GGC	2	6	849231	849236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311363
14556	NC_007384	TCA	2	6	849269	849274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311363
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14558	NC_007384	TTC	2	6	849381	849386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311363
14559	NC_007384	TCA	2	6	849404	849409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311363
14560	NC_007384	GTA	2	6	849552	849557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311363
14561	NC_007384	GCG	2	6	849585	849590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311363
14562	NC_007384	CCAG	2	8	849629	849636	25 %	0 %	25 %	50 %	74311363
14563	NC_007384	GCT	2	6	849639	849644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14564	NC_007384	CGG	2	6	849682	849687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311363
14565	NC_007384	GAATG	2	10	849696	849705	40 %	20 %	40 %	0 %	74311363
14566	NC_007384	CGTTG	2	10	849779	849788	0 %	40 %	40 %	20 %	74311363
14567	NC_007384	ACG	2	6	849834	849839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
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14569	NC_007384	GTT	2	6	849930	849935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311363
14570	NC_007384	GTC	2	6	850008	850013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311363
14571	NC_007384	TTC	2	6	850164	850169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311363
14572	NC_007384	CAG	2	6	850206	850211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311363
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14580	NC_007384	GCG	2	6	850716	850721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311364
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14584	NC_007384	CAC	2	6	851003	851008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311364
14585	NC_007384	GCG	2	6	851133	851138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311364
14586	NC_007384	AAG	2	6	851220	851225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311364
14587	NC_007384	GCAT	2	8	851262	851269	25 %	25 %	25 %	25 %	74311364
14588	NC_007384	GGT	2	6	851408	851413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311364
14589	NC_007384	GCT	2	6	851423	851428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311364
14590	NC_007384	A	7	7	851493	851499	100 %	0 %	0 %	0 %	74311364
14591	NC_007384	CCA	2	6	851510	851515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311364
14592	NC_007384	AAG	2	6	851882	851887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311365
14593	NC_007384	CGC	2	6	851905	851910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311365
14594	NC_007384	GCTG	2	8	851947	851954	0 %	25 %	50 %	25 %	74311365
14595	NC_007384	GC	3	6	852000	852005	0 %	0 %	50 %	50 %	74311365
14596	NC_007384	GATG	2	8	852019	852026	25 %	25 %	50 %	0 %	74311365
14597	NC_007384	GCA	2	6	852032	852037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311365
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14600	NC_007384	CGC	2	6	852072	852077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311365
14601	NC_007384	TTA	2	6	852109	852114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311365
14602	NC_007384	CGC	2	6	852147	852152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311365
14603	NC_007384	GC	3	6	852174	852179	0 %	0 %	50 %	50 %	74311365
14604	NC_007384	GGA	2	6	852181	852186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311365
14605	NC_007384	TC	3	6	852211	852216	0 %	50 %	0 %	50 %	74311365
14606	NC_007384	ATGA	2	8	852221	852228	50 %	25 %	25 %	0 %	74311365
14607	NC_007384	GCAG	2	8	852238	852245	25 %	0 %	50 %	25 %	74311365
14608	NC_007384	CTG	2	6	852251	852256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311365
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14610	NC_007384	TG	3	6	852308	852313	0 %	50 %	50 %	0 %	74311365
14611	NC_007384	TGA	2	6	852328	852333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311365
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14613	NC_007384	CGC	2	6	852385	852390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311365
14614	NC_007384	TGA	2	6	852423	852428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311365
14615	NC_007384	ATGTG	2	10	852429	852438	20 %	40 %	40 %	0 %	74311365
14616	NC_007384	AGC	2	6	852459	852464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311365
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14618	NC_007384	GAA	2	6	852563	852568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311365
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14985	NC_007384	TAA	2	6	877461	877466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311384
14986	NC_007384	CGT	2	6	877525	877530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311384
14987	NC_007384	ATC	2	6	877577	877582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311384
14988	NC_007384	GCT	2	6	877588	877593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311384
14989	NC_007384	A	7	7	877595	877601	100 %	0 %	0 %	0 %	74311384
14990	NC_007384	CAA	2	6	878839	878844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311385
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14992	NC_007384	GC	3	6	878883	878888	0 %	0 %	50 %	50 %	74311385
14993	NC_007384	CGCC	2	8	879014	879021	0 %	0 %	25 %	75 %	74311385
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14999	NC_007384	A	6	6	879246	879251	100 %	0 %	0 %	0 %	74311385
15000	NC_007384	GCC	2	6	879292	879297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311385

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