MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_007384	ACC	2	6	815068	815073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311336
14003	NC_007384	CAC	2	6	815076	815081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311336
14004	NC_007384	AAT	2	6	815139	815144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311336
14005	NC_007384	CG	3	6	815154	815159	0 %	0 %	50 %	50 %	74311336
14006	NC_007384	CAG	2	6	815280	815285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311336
14007	NC_007384	A	6	6	815325	815330	100 %	0 %	0 %	0 %	74311336
14008	NC_007384	AGC	2	6	815338	815343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311336
14009	NC_007384	CAG	2	6	815391	815396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311336
14010	NC_007384	TAA	2	6	815419	815424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311336
14011	NC_007384	CAG	3	9	815439	815447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311336
14012	NC_007384	AG	3	6	815469	815474	50 %	0 %	50 %	0 %	74311336
14013	NC_007384	CCA	3	9	815510	815518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311336
14014	NC_007384	ATG	3	9	815548	815556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311336
14015	NC_007384	CGC	2	6	815592	815597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311336
14016	NC_007384	TCC	2	6	815656	815661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74311336
14017	NC_007384	CGGTG	2	10	815757	815766	0 %	20 %	60 %	20 %	74311336
14018	NC_007384	GC	3	6	815773	815778	0 %	0 %	50 %	50 %	74311336
14019	NC_007384	ACC	2	6	815809	815814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311336
14020	NC_007384	TGG	2	6	815873	815878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311336
14021	NC_007384	CAG	2	6	816003	816008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311336
14022	NC_007384	CAGC	2	8	816033	816040	25 %	0 %	25 %	50 %	74311336
14023	NC_007384	TGG	2	6	816174	816179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311337
14024	NC_007384	GTGG	2	8	816298	816305	0 %	25 %	75 %	0 %	74311337
14025	NC_007384	CGG	2	6	816362	816367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311337
14026	NC_007384	TCG	2	6	816395	816400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311337
14027	NC_007384	GCCAGC	2	12	816437	816448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74311337
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14030	NC_007384	GC	3	6	816649	816654	0 %	0 %	50 %	50 %	74311337
14031	NC_007384	CT	3	6	816665	816670	0 %	50 %	0 %	50 %	74311337
14032	NC_007384	ATCC	2	8	816676	816683	25 %	25 %	0 %	50 %	74311337
14033	NC_007384	CAT	2	6	816727	816732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311337
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14041	NC_007384	TCG	2	6	817253	817258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311337
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14046	NC_007384	CAG	2	6	817483	817488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311337
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14053	NC_007384	CAT	2	6	817903	817908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311338
14054	NC_007384	CAC	2	6	817919	817924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311338
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14057	NC_007384	AGC	2	6	818055	818060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311338
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14060	NC_007384	CG	4	8	818186	818193	0 %	0 %	50 %	50 %	74311338
14061	NC_007384	TGCGCC	2	12	818262	818273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	74311338
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14063	NC_007384	CG	3	6	818377	818382	0 %	0 %	50 %	50 %	74311338
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14105	NC_007384	TGG	2	6	820637	820642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311340
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14114	NC_007384	TCAA	2	8	820882	820889	50 %	25 %	0 %	25 %	74311340
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14119	NC_007384	CGC	2	6	821071	821076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311340
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14122	NC_007384	GAA	2	6	821612	821617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311341
14123	NC_007384	TCA	2	6	821645	821650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311341
14124	NC_007384	GGC	2	6	821719	821724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311341
14125	NC_007384	ATG	2	6	821771	821776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311341
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14127	NC_007384	GCC	2	6	821973	821978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311342
14128	NC_007384	GAT	2	6	822038	822043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311342
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14133	NC_007384	GCT	2	6	822233	822238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311342
14134	NC_007384	CTG	2	6	822348	822353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311342
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14142	NC_007384	TCG	2	6	822569	822574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311342
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14234	NC_007384	TGC	2	6	827927	827932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986565
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14237	NC_007384	GTT	2	6	828017	828022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986565
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14239	NC_007384	CAGT	2	8	830115	830122	25 %	25 %	25 %	25 %	74311348
14240	NC_007384	ACTG	2	8	830129	830136	25 %	25 %	25 %	25 %	74311348
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14242	NC_007384	TCA	2	6	830292	830297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
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14356	NC_007384	CACG	2	8	836309	836316	25 %	0 %	25 %	50 %	74311352
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14368	NC_007384	GCA	2	6	836839	836844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311353
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14400	NC_007384	T	6	6	838995	839000	0 %	100 %	0 %	0 %	74311355
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14402	NC_007384	CT	3	6	839402	839407	0 %	50 %	0 %	50 %	74311356
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14474	NC_007384	GCTG	2	8	844305	844312	0 %	25 %	50 %	25 %	74311360
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