MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007384	CG	3	6	719045	719050	0 %	0 %	50 %	50 %	74311248
12502	NC_007384	TGT	2	6	719072	719077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311248
12503	NC_007384	GCG	2	6	719148	719153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311249
12504	NC_007384	AGCGC	2	10	719199	719208	20 %	0 %	40 %	40 %	74311249
12505	NC_007384	GCAC	2	8	719325	719332	25 %	0 %	25 %	50 %	74311249
12506	NC_007384	GTA	2	6	719346	719351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311249
12507	NC_007384	A	6	6	719371	719376	100 %	0 %	0 %	0 %	74311249
12508	NC_007384	CTT	2	6	719429	719434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311250
12509	NC_007384	CT	3	6	719437	719442	0 %	50 %	0 %	50 %	74311250
12510	NC_007384	CTT	2	6	719481	719486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311250
12511	NC_007384	CAG	2	6	719530	719535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12512	NC_007384	CCG	2	6	719592	719597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311250
12513	NC_007384	GCA	2	6	719739	719744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12514	NC_007384	GCT	2	6	719859	719864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12515	NC_007384	GAA	2	6	719929	719934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311250
12516	NC_007384	CG	3	6	719968	719973	0 %	0 %	50 %	50 %	74311250
12517	NC_007384	A	6	6	719992	719997	100 %	0 %	0 %	0 %	74311250
12518	NC_007384	CTT	2	6	720000	720005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311250
12519	NC_007384	CCG	2	6	720017	720022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311250
12520	NC_007384	GAT	2	6	720117	720122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311250
12521	NC_007384	GTC	2	6	720179	720184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12522	NC_007384	A	6	6	720211	720216	100 %	0 %	0 %	0 %	74311250
12523	NC_007384	CGA	2	6	720231	720236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12524	NC_007384	GGC	2	6	720319	720324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311250
12525	NC_007384	CTGGCG	2	12	720334	720345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74311250
12526	NC_007384	TGA	2	6	720417	720422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311250
12527	NC_007384	AGC	2	6	720427	720432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12528	NC_007384	TGC	2	6	720440	720445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12529	NC_007384	CGC	2	6	720465	720470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311250
12530	NC_007384	CGGTA	2	10	720537	720546	20 %	20 %	40 %	20 %	74311250
12531	NC_007384	CAA	2	6	720558	720563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311250
12532	NC_007384	GGTT	2	8	720567	720574	0 %	50 %	50 %	0 %	74311250
12533	NC_007384	CAC	2	6	720576	720581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311250
12534	NC_007384	GTACT	2	10	720612	720621	20 %	40 %	20 %	20 %	74311250
12535	NC_007384	GAT	2	6	720667	720672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311250
12536	NC_007384	CCG	2	6	720759	720764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311250
12537	NC_007384	CGA	2	6	720783	720788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12538	NC_007384	A	6	6	720826	720831	100 %	0 %	0 %	0 %	74311250
12539	NC_007384	CTT	2	6	721260	721265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311250
12540	NC_007384	GAA	2	6	721375	721380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311250
12541	NC_007384	GGT	2	6	721476	721481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311250
12542	NC_007384	TCT	2	6	721498	721503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311250
12543	NC_007384	TG	3	6	721526	721531	0 %	50 %	50 %	0 %	74311250
12544	NC_007384	TGC	2	6	721544	721549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
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12546	NC_007384	CG	3	6	721587	721592	0 %	0 %	50 %	50 %	74311250
12547	NC_007384	TGC	2	6	721673	721678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12548	NC_007384	GTC	2	6	721679	721684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12549	NC_007384	CGT	2	6	721702	721707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12550	NC_007384	CTG	2	6	721735	721740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12551	NC_007384	GAA	2	6	721768	721773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311250
12552	NC_007384	GCCA	2	8	721794	721801	25 %	0 %	25 %	50 %	74311250
12553	NC_007384	CGA	2	6	721812	721817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12554	NC_007384	TTA	2	6	721866	721871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311250
12555	NC_007384	CTG	2	6	721876	721881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12556	NC_007384	CGT	2	6	721888	721893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12557	NC_007384	GCA	2	6	721974	721979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311250
12558	NC_007384	CAGC	2	8	722046	722053	25 %	0 %	25 %	50 %	74311250
12559	NC_007384	CGG	2	6	722123	722128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311250
12560	NC_007384	CAA	2	6	722158	722163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311250
12561	NC_007384	AATA	2	8	722192	722199	75 %	25 %	0 %	0 %	74311250
12562	NC_007384	CCTG	2	8	722240	722247	0 %	25 %	25 %	50 %	74311251
12563	NC_007384	A	6	6	722283	722288	100 %	0 %	0 %	0 %	74311251
12564	NC_007384	TGA	2	6	722309	722314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311251
12565	NC_007384	CAG	2	6	722365	722370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311251
12566	NC_007384	CAG	2	6	722514	722519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311251
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12570	NC_007384	GCT	2	6	722697	722702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311251
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12585	NC_007384	GTA	2	6	723425	723430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311251
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12588	NC_007384	CG	3	6	723604	723609	0 %	0 %	50 %	50 %	74311252
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12591	NC_007384	GCGG	2	8	723690	723697	0 %	0 %	75 %	25 %	74311252
12592	NC_007384	AGA	2	6	723719	723724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311252
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12599	NC_007384	GAACT	2	10	724266	724275	40 %	20 %	20 %	20 %	74311252
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12603	NC_007384	CT	3	6	724437	724442	0 %	50 %	0 %	50 %	74311252
12604	NC_007384	GAC	2	6	724443	724448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311252
12605	NC_007384	CGG	2	6	724478	724483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311252
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12607	NC_007384	ATC	2	6	724515	724520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311252
12608	NC_007384	AAC	2	6	724575	724580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311252
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12610	NC_007384	ATT	2	6	724623	724628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311252
12611	NC_007384	GCA	2	6	724629	724634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311252
12612	NC_007384	CAG	2	6	724656	724661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311252
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12615	NC_007384	GGC	2	6	724796	724801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311253
12616	NC_007384	TAC	2	6	724822	724827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311253
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12618	NC_007384	TGC	2	6	724870	724875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311253
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