MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007384	T	6	6	663464	663469	0 %	100 %	0 %	0 %	74311204
11502	NC_007384	GAC	2	6	663515	663520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11503	NC_007384	GTC	2	6	663594	663599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11504	NC_007384	GTT	2	6	663647	663652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311204
11505	NC_007384	GGC	2	6	663666	663671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311204
11506	NC_007384	AGT	2	6	663860	663865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311204
11507	NC_007384	CGCCAG	2	12	663870	663881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74311204
11508	NC_007384	TTC	2	6	663924	663929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
11509	NC_007384	CAA	2	6	664001	664006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311204
11510	NC_007384	TTC	2	6	664137	664142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
11511	NC_007384	TGC	2	6	664154	664159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11512	NC_007384	TGG	2	6	664178	664183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311204
11513	NC_007384	CGT	2	6	664184	664189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11514	NC_007384	GAC	2	6	664190	664195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11515	NC_007384	GCG	2	6	664251	664256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311204
11516	NC_007384	CTG	2	6	664272	664277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
11517	NC_007384	CTT	2	6	664283	664288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
11518	NC_007384	CCG	2	6	664409	664414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311204
11519	NC_007384	GCG	2	6	664572	664577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311205
11520	NC_007384	GCA	2	6	664636	664641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311205
11521	NC_007384	ACGC	2	8	664679	664686	25 %	0 %	25 %	50 %	74311205
11522	NC_007384	CA	3	6	664733	664738	50 %	0 %	0 %	50 %	74311205
11523	NC_007384	GTA	2	6	664751	664756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311205
11524	NC_007384	CTG	2	6	664798	664803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311205
11525	NC_007384	ATA	2	6	664896	664901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311205
11526	NC_007384	TCG	2	6	664920	664925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311205
11527	NC_007384	CGCC	2	8	664933	664940	0 %	0 %	25 %	75 %	74311205
11528	NC_007384	CG	3	6	665006	665011	0 %	0 %	50 %	50 %	74311205
11529	NC_007384	CTT	2	6	665026	665031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311205
11530	NC_007384	TGA	2	6	665089	665094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311205
11531	NC_007384	CA	3	6	665152	665157	50 %	0 %	0 %	50 %	74311205
11532	NC_007384	T	7	7	665213	665219	0 %	100 %	0 %	0 %	74311205
11533	NC_007384	TCA	2	6	665311	665316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311205
11534	NC_007384	TGG	2	6	665326	665331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311205
11535	NC_007384	TAGT	2	8	665349	665356	25 %	50 %	25 %	0 %	74311205
11536	NC_007384	CGC	3	9	665437	665445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311205
11537	NC_007384	GA	3	6	665478	665483	50 %	0 %	50 %	0 %	74311205
11538	NC_007384	GTT	2	6	665503	665508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311205
11539	NC_007384	GGC	2	6	665517	665522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311205
11540	NC_007384	AAC	2	6	665567	665572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311205
11541	NC_007384	TCA	2	6	665580	665585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311205
11542	NC_007384	TGG	2	6	665760	665765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311206
11543	NC_007384	CAGTGC	2	12	665857	665868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74311206
11544	NC_007384	ATC	2	6	665891	665896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311206
11545	NC_007384	CTT	2	6	665898	665903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311206
11546	NC_007384	CGCGA	2	10	665986	665995	20 %	0 %	40 %	40 %	74311206
11547	NC_007384	TACGAG	2	12	666018	666029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	74311206
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11549	NC_007384	CGT	2	6	666069	666074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311206
11550	NC_007384	T	6	6	666120	666125	0 %	100 %	0 %	0 %	74311206
11551	NC_007384	GGC	2	6	666135	666140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311206
11552	NC_007384	CTG	2	6	666189	666194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311206
11553	NC_007384	GAA	2	6	666211	666216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311206
11554	NC_007384	GTA	2	6	666235	666240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311206
11555	NC_007384	GGT	2	6	666349	666354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311206
11556	NC_007384	GCC	2	6	666364	666369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311206
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11559	NC_007384	T	6	6	666839	666844	0 %	100 %	0 %	0 %	74311207
11560	NC_007384	TGC	2	6	666883	666888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11561	NC_007384	GGC	2	6	666893	666898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311207
11562	NC_007384	TGC	2	6	666904	666909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11563	NC_007384	GGCG	2	8	666953	666960	0 %	0 %	75 %	25 %	74311207
11564	NC_007384	GCG	3	9	667035	667043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311207
11565	NC_007384	TGGT	2	8	667141	667148	0 %	50 %	50 %	0 %	74311207
11566	NC_007384	CTT	2	6	667199	667204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311207
11567	NC_007384	CGG	2	6	667205	667210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311207
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11569	NC_007384	GCC	2	6	667280	667285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311207
11570	NC_007384	GGC	2	6	667308	667313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311207
11571	NC_007384	GC	3	6	667333	667338	0 %	0 %	50 %	50 %	74311207
11572	NC_007384	TCA	2	6	667360	667365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311207
11573	NC_007384	CTG	2	6	667371	667376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
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11578	NC_007384	GCA	2	6	667575	667580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311207
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11584	NC_007384	GCT	2	6	667745	667750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11585	NC_007384	TTCTCT	2	12	667767	667778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311207
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11587	NC_007384	CCAG	2	8	667822	667829	25 %	0 %	25 %	50 %	74311207
11588	NC_007384	TGC	2	6	667840	667845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
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11593	NC_007384	CAAC	2	8	668002	668009	50 %	0 %	0 %	50 %	74311207
11594	NC_007384	TGC	2	6	668015	668020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
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11599	NC_007384	GCGAT	2	10	668200	668209	20 %	20 %	40 %	20 %	74311207
11600	NC_007384	GAA	2	6	668210	668215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311207
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11602	NC_007384	TATC	2	8	668311	668318	25 %	50 %	0 %	25 %	74311207
11603	NC_007384	GGTG	2	8	668396	668403	0 %	25 %	75 %	0 %	74311207
11604	NC_007384	TCG	2	6	668434	668439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11605	NC_007384	ACCA	2	8	668478	668485	50 %	0 %	0 %	50 %	74311207
11606	NC_007384	GTC	2	6	668523	668528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11607	NC_007384	TGG	2	6	668578	668583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311207
11608	NC_007384	GC	3	6	668590	668595	0 %	0 %	50 %	50 %	74311207
11609	NC_007384	GAT	2	6	668660	668665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311207
11610	NC_007384	GGT	2	6	668672	668677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311207
11611	NC_007384	GCA	2	6	668680	668685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311207
11612	NC_007384	CGA	2	6	668690	668695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311207
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11615	NC_007384	GCCC	2	8	669045	669052	0 %	0 %	25 %	75 %	74311208
11616	NC_007384	ATC	2	6	669072	669077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311208
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11618	NC_007384	AC	3	6	669113	669118	50 %	0 %	0 %	50 %	74311208
11619	NC_007384	CCG	2	6	669126	669131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311208
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11621	NC_007384	CGA	2	6	669227	669232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311208
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11985	NC_007384	AGAA	2	8	687826	687833	75 %	0 %	25 %	0 %	74311222
11986	NC_007384	GCC	2	6	687841	687846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311222
11987	NC_007384	CGC	2	6	687864	687869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311222
11988	NC_007384	GCC	2	6	687928	687933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311222
11989	NC_007384	ATA	2	6	687959	687964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311222
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11992	NC_007384	CAGC	2	8	688162	688169	25 %	0 %	25 %	50 %	74311222
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