MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_007384	GAA	2	6	635647	635652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311178
11003	NC_007384	GTA	2	6	635668	635673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311178
11004	NC_007384	TGT	2	6	635754	635759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311178
11005	NC_007384	GTT	2	6	635785	635790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311178
11006	NC_007384	CCG	2	6	635796	635801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311178
11007	NC_007384	GCAG	2	8	635810	635817	25 %	0 %	50 %	25 %	74311178
11008	NC_007384	TACG	2	8	635904	635911	25 %	25 %	25 %	25 %	74311178
11009	NC_007384	TGG	2	6	636386	636391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311179
11010	NC_007384	GC	3	6	636397	636402	0 %	0 %	50 %	50 %	74311179
11011	NC_007384	TAA	2	6	636410	636415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311179
11012	NC_007384	AG	3	6	636501	636506	50 %	0 %	50 %	0 %	74311179
11013	NC_007384	AGA	2	6	636513	636518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311179
11014	NC_007384	AAAG	2	8	636547	636554	75 %	0 %	25 %	0 %	74311179
11015	NC_007384	ATC	2	6	636626	636631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311179
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11017	NC_007384	CTGA	2	8	636883	636890	25 %	25 %	25 %	25 %	74311180
11018	NC_007384	CTTC	2	8	636956	636963	0 %	50 %	0 %	50 %	74311180
11019	NC_007384	GCTT	2	8	637151	637158	0 %	50 %	25 %	25 %	74311180
11020	NC_007384	CTG	2	6	637228	637233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311180
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11022	NC_007384	TTGT	2	8	637348	637355	0 %	75 %	25 %	0 %	74311180
11023	NC_007384	ATT	2	6	637420	637425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311180
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11025	NC_007384	T	6	6	637558	637563	0 %	100 %	0 %	0 %	74311180
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11030	NC_007384	GCA	2	6	637807	637812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311180
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11032	NC_007384	AATG	2	8	638051	638058	50 %	25 %	25 %	0 %	74311181
11033	NC_007384	T	6	6	638105	638110	0 %	100 %	0 %	0 %	74311181
11034	NC_007384	TTC	2	6	638116	638121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311181
11035	NC_007384	TGA	2	6	638134	638139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311181
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11037	NC_007384	CTG	2	6	638150	638155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311181
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11053	NC_007384	CG	3	6	638929	638934	0 %	0 %	50 %	50 %	74311182
11054	NC_007384	ATTC	2	8	638982	638989	25 %	50 %	0 %	25 %	74311182
11055	NC_007384	AATTA	2	10	638993	639002	60 %	40 %	0 %	0 %	74311182
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11059	NC_007384	GGT	2	6	639110	639115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311182
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11067	NC_007384	GTG	2	6	639610	639615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311182
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11071	NC_007384	GCCA	2	8	639859	639866	25 %	0 %	25 %	50 %	74311182
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11093	NC_007384	T	6	6	640678	640683	0 %	100 %	0 %	0 %	74311183
11094	NC_007384	TG	3	6	640689	640694	0 %	50 %	50 %	0 %	74311183
11095	NC_007384	A	6	6	640786	640791	100 %	0 %	0 %	0 %	74311184
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11104	NC_007384	TGG	2	6	641057	641062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311184
11105	NC_007384	GA	3	6	641067	641072	50 %	0 %	50 %	0 %	74311184
11106	NC_007384	CAA	2	6	641183	641188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311184
11107	NC_007384	GAA	2	6	641199	641204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311184
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11109	NC_007384	TCT	2	6	641310	641315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311184
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11242	NC_007384	TTCA	2	8	648520	648527	25 %	50 %	0 %	25 %	74311191
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11485	NC_007384	GCA	2	6	662148	662153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311202
11486	NC_007384	TCG	2	6	662522	662527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311203
11487	NC_007384	CCTG	2	8	662567	662574	0 %	25 %	25 %	50 %	74311203
11488	NC_007384	TTC	2	6	662623	662628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311203
11489	NC_007384	TGC	2	6	662653	662658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311203
11490	NC_007384	GAT	2	6	662662	662667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311203
11491	NC_007384	GGGCT	2	10	662672	662681	0 %	20 %	60 %	20 %	74311203
11492	NC_007384	CA	3	6	662727	662732	50 %	0 %	0 %	50 %	74311203
11493	NC_007384	TGG	2	6	662778	662783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311203
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