MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

< Previous12...146147148149150151152153154155156157158Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78501	NC_007384	CAG	2	6	4814461	4814466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78502	NC_007384	AGC	2	6	4814493	4814498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78503	NC_007384	ATG	2	6	4814561	4814566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986377
78504	NC_007384	GAT	2	6	4814621	4814626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986377
78505	NC_007384	TGA	2	6	4814628	4814633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986377
78506	NC_007384	CGG	2	6	4814640	4814645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986377
78507	NC_007384	TCC	2	6	4814683	4814688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986377
78508	NC_007384	GCG	2	6	4814728	4814733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986377
78509	NC_007384	TAC	2	6	4814801	4814806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986377
78510	NC_007384	GAA	2	6	4814834	4814839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986377
78511	NC_007384	AGCC	2	8	4814879	4814886	25 %	0 %	25 %	50 %	161986377
78512	NC_007384	GCGT	2	8	4814917	4814924	0 %	25 %	50 %	25 %	161986377
78513	NC_007384	GGCAG	2	10	4815007	4815016	20 %	0 %	60 %	20 %	161986377
78514	NC_007384	TGCC	2	8	4815018	4815025	0 %	25 %	25 %	50 %	161986377
78515	NC_007384	AAC	2	6	4815065	4815070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986377
78516	NC_007384	CG	3	6	4815091	4815096	0 %	0 %	50 %	50 %	161986377
78517	NC_007384	TGA	2	6	4815183	4815188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986377
78518	NC_007384	GCA	2	6	4815208	4815213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78519	NC_007384	TCG	2	6	4815249	4815254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78520	NC_007384	CGA	2	6	4815283	4815288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78521	NC_007384	CGT	2	6	4815333	4815338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78522	NC_007384	TCG	2	6	4815379	4815384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78523	NC_007384	CTGG	2	8	4815397	4815404	0 %	25 %	50 %	25 %	161986377
78524	NC_007384	TGAAGC	2	12	4815481	4815492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161986377
78525	NC_007384	GCA	2	6	4815545	4815550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78526	NC_007384	GC	3	6	4815635	4815640	0 %	0 %	50 %	50 %	161986377
78527	NC_007384	CG	3	6	4815676	4815681	0 %	0 %	50 %	50 %	161986377
78528	NC_007384	TGG	2	6	4815761	4815766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986377
78529	NC_007384	ATC	2	6	4815807	4815812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986377
78530	NC_007384	AGC	2	6	4816022	4816027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78531	NC_007384	CAG	2	6	4816094	4816099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78532	NC_007384	CAG	2	6	4816125	4816130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78533	NC_007384	CG	3	6	4816230	4816235	0 %	0 %	50 %	50 %	161986377
78534	NC_007384	GAA	2	6	4816243	4816248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986377
78535	NC_007384	TAC	2	6	4816268	4816273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986377
78536	NC_007384	TGA	2	6	4816302	4816307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986377
78537	NC_007384	CGT	2	6	4816325	4816330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986377
78538	NC_007384	CAA	2	6	4816432	4816437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314827
78539	NC_007384	CAG	2	6	4816448	4816453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314827
78540	NC_007384	GTT	2	6	4816536	4816541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314827
78541	NC_007384	A	6	6	4816638	4816643	100 %	0 %	0 %	0 %	74314827
78542	NC_007384	CGA	2	6	4816664	4816669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314827
78543	NC_007384	GATT	2	8	4816747	4816754	25 %	50 %	25 %	0 %	74314827
78544	NC_007384	GAGT	2	8	4816911	4816918	25 %	25 %	50 %	0 %	161986376
78545	NC_007384	CGG	2	6	4816923	4816928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986376
78546	NC_007384	CCTT	2	8	4816946	4816953	0 %	50 %	0 %	50 %	161986376
78547	NC_007384	TCA	2	6	4816964	4816969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986376
78548	NC_007384	CGC	2	6	4817067	4817072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986376
78549	NC_007384	GCTG	2	8	4817073	4817080	0 %	25 %	50 %	25 %	161986376
78550	NC_007384	CAC	2	6	4817092	4817097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986376
78551	NC_007384	CGG	2	6	4817168	4817173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986376
78552	NC_007384	GC	3	6	4817201	4817206	0 %	0 %	50 %	50 %	161986376
78553	NC_007384	TGG	2	6	4817331	4817336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986376
78554	NC_007384	CGG	2	6	4817594	4817599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314829
78555	NC_007384	ATC	2	6	4817602	4817607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314829
78556	NC_007384	CAT	2	6	4817628	4817633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314829
78557	NC_007384	GAA	3	9	4817701	4817709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314829
78558	NC_007384	GCT	2	6	4817844	4817849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314829
78559	NC_007384	CGC	2	6	4817917	4817922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314829
78560	NC_007384	CG	3	6	4817948	4817953	0 %	0 %	50 %	50 %	74314829
78561	NC_007384	TGGC	2	8	4817974	4817981	0 %	25 %	50 %	25 %	74314829
78562	NC_007384	CTGG	2	8	4817984	4817991	0 %	25 %	50 %	25 %	74314829
78563	NC_007384	CGG	2	6	4818058	4818063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314830
78564	NC_007384	CAG	2	6	4818072	4818077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314830
78565	NC_007384	TCT	2	6	4818118	4818123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314830
78566	NC_007384	GTA	2	6	4818129	4818134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314830
78567	NC_007384	CGC	2	6	4818257	4818262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314830
78568	NC_007384	GCA	2	6	4818266	4818271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314830
78569	NC_007384	GGT	2	6	4818324	4818329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314830
78570	NC_007384	TCG	2	6	4818346	4818351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314830
78571	NC_007384	TTCA	2	8	4818375	4818382	25 %	50 %	0 %	25 %	74314830
78572	NC_007384	GCG	2	6	4818512	4818517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314830
78573	NC_007384	GCG	2	6	4818572	4818577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314830
78574	NC_007384	CGG	2	6	4818610	4818615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314830
78575	NC_007384	CTT	2	6	4818642	4818647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314830
78576	NC_007384	CCG	2	6	4818734	4818739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314830
78577	NC_007384	ACG	2	6	4818750	4818755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314830
78578	NC_007384	CGC	2	6	4818837	4818842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314830
78579	NC_007384	CCAG	2	8	4818881	4818888	25 %	0 %	25 %	50 %	74314830
78580	NC_007384	AAT	2	6	4818903	4818908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314830
78581	NC_007384	AGA	2	6	4819196	4819201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314831
78582	NC_007384	TTG	2	6	4819252	4819257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314831
78583	NC_007384	GGT	2	6	4819320	4819325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314831
78584	NC_007384	GTA	2	6	4819440	4819445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314831
78585	NC_007384	A	6	6	4819449	4819454	100 %	0 %	0 %	0 %	74314831
78586	NC_007384	CGCT	2	8	4819516	4819523	0 %	25 %	25 %	50 %	74314831
78587	NC_007384	GGC	2	6	4819597	4819602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314831
78588	NC_007384	GCA	2	6	4819688	4819693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314832
78589	NC_007384	CAG	2	6	4819752	4819757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314832
78590	NC_007384	GCC	2	6	4819816	4819821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314832
78591	NC_007384	GAC	2	6	4819914	4819919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314832
78592	NC_007384	GAA	2	6	4819985	4819990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314832
78593	NC_007384	TCG	2	6	4819995	4820000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314832
78594	NC_007384	TGAAT	2	10	4820030	4820039	40 %	40 %	20 %	0 %	74314832
78595	NC_007384	GC	3	6	4820237	4820242	0 %	0 %	50 %	50 %	74314832
78596	NC_007384	TGC	2	6	4820328	4820333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314833
78597	NC_007384	T	6	6	4820341	4820346	0 %	100 %	0 %	0 %	74314833
78598	NC_007384	TGG	2	6	4820349	4820354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314833
78599	NC_007384	GGC	2	6	4820359	4820364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314833
78600	NC_007384	AAG	2	6	4820391	4820396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314833
78601	NC_007384	CT	3	6	4820480	4820485	0 %	50 %	0 %	50 %	74314833
78602	NC_007384	ACA	2	6	4820530	4820535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314833
78603	NC_007384	ATT	2	6	4820655	4820660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314833
78604	NC_007384	ATGT	2	8	4820750	4820757	25 %	50 %	25 %	0 %	74314833
78605	NC_007384	AGCG	2	8	4820846	4820853	25 %	0 %	50 %	25 %	74314833
78606	NC_007384	TTG	2	6	4820879	4820884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314833
78607	NC_007384	TGG	2	6	4820918	4820923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314833
78608	NC_007384	GTA	2	6	4821003	4821008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314833
78609	NC_007384	GGC	2	6	4821121	4821126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314833
78610	NC_007384	GCG	2	6	4821137	4821142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314833
78611	NC_007384	CCG	2	6	4821161	4821166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314833
78612	NC_007384	AGT	2	6	4821172	4821177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314833
78613	NC_007384	ACA	2	6	4821192	4821197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314833
78614	NC_007384	TGG	2	6	4821228	4821233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314833
78615	NC_007384	TAC	2	6	4821240	4821245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314833
78616	NC_007384	CTG	2	6	4821285	4821290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314833
78617	NC_007384	GGC	2	6	4821298	4821303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314833
78618	NC_007384	ATT	2	6	4821304	4821309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314833
78619	NC_007384	CCG	2	6	4821310	4821315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314833
78620	NC_007384	GC	3	6	4821326	4821331	0 %	0 %	50 %	50 %	74314833
78621	NC_007384	A	7	7	4821348	4821354	100 %	0 %	0 %	0 %	74314833
78622	NC_007384	TGC	2	6	4821391	4821396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314833
78623	NC_007384	A	6	6	4821603	4821608	100 %	0 %	0 %	0 %	74314833
78624	NC_007384	GTTT	2	8	4821648	4821655	0 %	75 %	25 %	0 %	74314833
78625	NC_007384	TCC	2	6	4821800	4821805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314834
78626	NC_007384	ACC	2	6	4821821	4821826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314834
78627	NC_007384	TGT	2	6	4821846	4821851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314834
78628	NC_007384	TTG	2	6	4821954	4821959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314834
78629	NC_007384	GAA	2	6	4822091	4822096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314834
78630	NC_007384	TGGTG	2	10	4822249	4822258	0 %	40 %	60 %	0 %	74314834
78631	NC_007384	AACGG	2	10	4822274	4822283	40 %	0 %	40 %	20 %	74314834
78632	NC_007384	TGCC	2	8	4822425	4822432	0 %	25 %	25 %	50 %	74314834
78633	NC_007384	T	6	6	4822480	4822485	0 %	100 %	0 %	0 %	74314834
78634	NC_007384	T	6	6	4822492	4822497	0 %	100 %	0 %	0 %	74314834
78635	NC_007384	GCCA	2	8	4822498	4822505	25 %	0 %	25 %	50 %	74314834
78636	NC_007384	AGC	2	6	4822547	4822552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314834
78637	NC_007384	TAA	2	6	4822561	4822566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314834
78638	NC_007384	GAC	2	6	4822636	4822641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314834
78639	NC_007384	CTG	2	6	4822691	4822696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314834
78640	NC_007384	TGG	2	6	4822773	4822778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314834
78641	NC_007384	TATT	2	8	4822885	4822892	25 %	75 %	0 %	0 %	74314834
78642	NC_007384	TGT	2	6	4822926	4822931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314834
78643	NC_007384	TGT	2	6	4822944	4822949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314834
78644	NC_007384	TGGA	2	8	4822953	4822960	25 %	25 %	50 %	0 %	74314834
78645	NC_007384	GC	3	6	4822992	4822997	0 %	0 %	50 %	50 %	74314834
78646	NC_007384	TGT	2	6	4822998	4823003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314834
78647	NC_007384	TGG	3	9	4823019	4823027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314834
78648	NC_007384	ATG	2	6	4823039	4823044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314834
78649	NC_007384	AAG	2	6	4823103	4823108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314834
78650	NC_007384	CAC	2	6	4823217	4823222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314835
78651	NC_007384	TGG	2	6	4823247	4823252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314835
78652	NC_007384	GAT	2	6	4823254	4823259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314835
78653	NC_007384	CGG	2	6	4823300	4823305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314835
78654	NC_007384	CAG	2	6	4823362	4823367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314835
78655	NC_007384	AACG	2	8	4823468	4823475	50 %	0 %	25 %	25 %	74314835
78656	NC_007384	ACG	2	6	4823524	4823529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314835
78657	NC_007384	TTC	2	6	4823530	4823535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314835
78658	NC_007384	CAG	2	6	4823566	4823571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314835
78659	NC_007384	AGA	2	6	4823729	4823734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314835
78660	NC_007384	AG	3	6	4823788	4823793	50 %	0 %	50 %	0 %	74314835
78661	NC_007384	CAT	2	6	4823832	4823837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314835
78662	NC_007384	CAA	2	6	4824062	4824067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314836
78663	NC_007384	CAT	2	6	4824068	4824073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314836
78664	NC_007384	GCG	2	6	4824609	4824614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314837
78665	NC_007384	AGCC	2	8	4824676	4824683	25 %	0 %	25 %	50 %	74314837
78666	NC_007384	ATA	2	6	4824721	4824726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314837
78667	NC_007384	CCA	2	6	4824781	4824786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314837
78668	NC_007384	GC	3	6	4824789	4824794	0 %	0 %	50 %	50 %	74314837
78669	NC_007384	TAC	2	6	4824813	4824818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314837
78670	NC_007384	TGG	2	6	4824958	4824963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314837
78671	NC_007384	ACA	2	6	4825031	4825036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314837
78672	NC_007384	GAC	2	6	4825109	4825114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314837
78673	NC_007384	TGGCAG	2	12	4825117	4825128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74314837
78674	NC_007384	TGC	2	6	4825207	4825212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314837
78675	NC_007384	A	7	7	4825222	4825228	100 %	0 %	0 %	0 %	74314837
78676	NC_007384	A	6	6	4825240	4825245	100 %	0 %	0 %	0 %	74314837

< Previous12...146147148149150151152153154155156157158Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.