MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_007384	GAC	2	6	353814	353819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6003	NC_007384	GCG	2	6	353837	353842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986582
6004	NC_007384	GCC	2	6	353888	353893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986582
6005	NC_007384	CAGTG	2	10	353907	353916	20 %	20 %	40 %	20 %	161986582
6006	NC_007384	CAG	2	6	353928	353933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6007	NC_007384	TC	4	8	353957	353964	0 %	50 %	0 %	50 %	161986582
6008	NC_007384	CAG	2	6	353973	353978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6009	NC_007384	CTTT	2	8	354012	354019	0 %	75 %	0 %	25 %	161986582
6010	NC_007384	CAG	2	6	354061	354066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6011	NC_007384	AGC	2	6	354162	354167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6012	NC_007384	CGA	2	6	354177	354182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6013	NC_007384	ATC	2	6	354239	354244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986582
6014	NC_007384	GAC	2	6	354250	354255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986582
6015	NC_007384	GCG	2	6	354257	354262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986582
6016	NC_007384	CCAT	2	8	354264	354271	25 %	25 %	0 %	50 %	161986582
6017	NC_007384	T	6	6	354386	354391	0 %	100 %	0 %	0 %	161986581
6018	NC_007384	CTT	2	6	354411	354416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986581
6019	NC_007384	GAG	2	6	354418	354423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986581
6020	NC_007384	GGC	2	6	354481	354486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986581
6021	NC_007384	AAC	2	6	354505	354510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986581
6022	NC_007384	CGG	2	6	354519	354524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986581
6023	NC_007384	CAG	2	6	354528	354533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986581
6024	NC_007384	CTTC	2	8	354539	354546	0 %	50 %	0 %	50 %	161986581
6025	NC_007384	CTGG	2	8	354574	354581	0 %	25 %	50 %	25 %	161986581
6026	NC_007384	CTG	2	6	354637	354642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986581
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6029	NC_007384	T	7	7	354748	354754	0 %	100 %	0 %	0 %	74310920
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6032	NC_007384	GAC	2	6	354818	354823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310920
6033	NC_007384	TTA	2	6	354883	354888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310920
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6042	NC_007384	GGC	2	6	355766	355771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310921
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6052	NC_007384	GCC	2	6	357110	357115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986580
6053	NC_007384	CTGG	2	8	357118	357125	0 %	25 %	50 %	25 %	161986580
6054	NC_007384	GC	3	6	357157	357162	0 %	0 %	50 %	50 %	161986580
6055	NC_007384	TGG	2	6	357198	357203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986580
6056	NC_007384	TGC	2	6	357256	357261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986580
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6059	NC_007384	TGA	2	6	357482	357487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310923
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6122	NC_007384	GCT	2	6	360423	360428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986579
6123	NC_007384	GTC	2	6	360444	360449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986579
6124	NC_007384	GTT	2	6	360486	360491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986579
6125	NC_007384	TGT	2	6	360530	360535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986579
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6231	NC_007384	CAGTG	2	10	368295	368304	20 %	20 %	40 %	20 %	161986577
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6233	NC_007384	TC	4	8	368345	368352	0 %	50 %	0 %	50 %	161986577
6234	NC_007384	CAG	2	6	368361	368366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986577
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6236	NC_007384	CAG	2	6	368449	368454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986577
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6242	NC_007384	CCAT	2	8	368652	368659	25 %	25 %	0 %	50 %	161986577
6243	NC_007384	T	6	6	368774	368779	0 %	100 %	0 %	0 %	74310934
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