MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_007384	CGG	3	9	3864370	3864378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314048
63003	NC_007384	AAC	2	6	3864385	3864390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314048
63004	NC_007384	GAGCA	2	10	3864398	3864407	40 %	0 %	40 %	20 %	74314048
63005	NC_007384	ATC	2	6	3864441	3864446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314048
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63010	NC_007384	CCCG	2	8	3864832	3864839	0 %	0 %	25 %	75 %	74314049
63011	NC_007384	GCA	2	6	3864840	3864845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314049
63012	NC_007384	TGC	2	6	3864848	3864853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314049
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63014	NC_007384	CAG	2	6	3864910	3864915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314049
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63017	NC_007384	GCA	2	6	3865060	3865065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314050
63018	NC_007384	CG	3	6	3865073	3865078	0 %	0 %	50 %	50 %	74314050
63019	NC_007384	CAGCC	2	10	3865182	3865191	20 %	0 %	20 %	60 %	74314050
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63113	NC_007384	A	6	6	3870372	3870377	100 %	0 %	0 %	0 %	161986423
63114	NC_007384	GCC	2	6	3870378	3870383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986423
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63468	NC_007384	TGA	2	6	3887283	3887288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986422
63469	NC_007384	AAGTT	2	10	3887368	3887377	40 %	40 %	20 %	0 %	161986422
63470	NC_007384	GACC	2	8	3887397	3887404	25 %	0 %	25 %	50 %	161986422
63471	NC_007384	CATG	2	8	3887436	3887443	25 %	25 %	25 %	25 %	161986422
63472	NC_007384	GTCATC	2	12	3887473	3887484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161986422
63473	NC_007384	GAT	2	6	3887491	3887496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986422
63474	NC_007384	AGA	2	6	3887502	3887507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986422
63475	NC_007384	CAA	2	6	3887577	3887582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986422
63476	NC_007384	GCA	2	6	3887610	3887615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986422
63477	NC_007384	TAT	2	6	3887625	3887630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986422
63478	NC_007384	CTG	2	6	3887689	3887694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986422
63479	NC_007384	ACC	2	6	3887740	3887745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986422
63480	NC_007384	CAT	2	6	3887754	3887759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986422
63481	NC_007384	GAT	2	6	3887789	3887794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986421
63482	NC_007384	GGC	2	6	3887797	3887802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986421
63483	NC_007384	T	7	7	3887827	3887833	0 %	100 %	0 %	0 %	161986421
63484	NC_007384	TAA	2	6	3887848	3887853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986421
63485	NC_007384	CGC	3	9	3887872	3887880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986421
63486	NC_007384	CGCC	2	8	3887898	3887905	0 %	0 %	25 %	75 %	161986421
63487	NC_007384	TCA	2	6	3887910	3887915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986421
63488	NC_007384	CCAGC	2	10	3887916	3887925	20 %	0 %	20 %	60 %	161986421
63489	NC_007384	GCC	2	6	3887981	3887986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986421
63490	NC_007384	TGC	2	6	3887996	3888001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986421
63491	NC_007384	CGCCA	2	10	3888100	3888109	20 %	0 %	20 %	60 %	161986421
63492	NC_007384	ATC	2	6	3888146	3888151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986421
63493	NC_007384	GCC	2	6	3888163	3888168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986421
63494	NC_007384	GCCAGT	2	12	3888314	3888325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161986421
63495	NC_007384	CG	3	6	3888358	3888363	0 %	0 %	50 %	50 %	161986421
63496	NC_007384	CAA	2	6	3888415	3888420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986421
63497	NC_007384	CCA	2	6	3888426	3888431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986421
63498	NC_007384	TAACGC	2	12	3888451	3888462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161986421
63499	NC_007384	GCC	2	6	3888469	3888474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986421
63500	NC_007384	ACG	2	6	3888488	3888493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986421

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