MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 33186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007297	CAA	2	6	233720	233725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910043
4002	NC_007297	GAT	2	6	233773	233778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
4003	NC_007297	ACG	2	6	233813	233818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4004	NC_007297	AGGCAA	2	12	233849	233860	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71910043
4005	NC_007297	A	6	6	233876	233881	100 %	0 %	0 %	0 %	71910043
4006	NC_007297	CAA	2	6	233890	233895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910043
4007	NC_007297	ACT	2	6	233935	233940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
4008	NC_007297	AGC	2	6	233963	233968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4009	NC_007297	AGT	2	6	234028	234033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
4010	NC_007297	GAG	2	6	234034	234039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71910043
4011	NC_007297	AG	3	6	234070	234075	50 %	0 %	50 %	0 %	71910043
4012	NC_007297	CAG	2	6	234164	234169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4013	NC_007297	ACT	2	6	234172	234177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
4014	NC_007297	AGC	2	6	234270	234275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4015	NC_007297	ATA	2	6	234290	234295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
4016	NC_007297	GCT	2	6	234397	234402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4017	NC_007297	GTC	2	6	234428	234433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4018	NC_007297	TAA	2	6	234474	234479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
4019	NC_007297	GAA	2	6	234511	234516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910043
4020	NC_007297	A	6	6	234520	234525	100 %	0 %	0 %	0 %	71910043
4021	NC_007297	AAT	2	6	234562	234567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
4022	NC_007297	ATT	2	6	234592	234597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910043
4023	NC_007297	CAG	2	6	234644	234649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4024	NC_007297	TTG	2	6	234662	234667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910043
4025	NC_007297	AAG	2	6	234738	234743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910043
4026	NC_007297	ACC	2	6	234756	234761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71910043
4027	NC_007297	CAG	2	6	234773	234778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4028	NC_007297	CAT	2	6	234842	234847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
4029	NC_007297	TAT	2	6	234906	234911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910043
4030	NC_007297	ATG	2	6	234947	234952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
4031	NC_007297	ATAC	2	8	235067	235074	50 %	25 %	0 %	25 %	71910043
4032	NC_007297	TGAA	2	8	235163	235170	50 %	25 %	25 %	0 %	71910043
4033	NC_007297	TAA	2	6	235218	235223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
4034	NC_007297	TCA	2	6	235344	235349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
4035	NC_007297	AAGT	2	8	235379	235386	50 %	25 %	25 %	0 %	71910043
4036	NC_007297	AGCA	2	8	235404	235411	50 %	0 %	25 %	25 %	71910043
4037	NC_007297	AGC	2	6	235491	235496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4038	NC_007297	ATCA	2	8	235532	235539	50 %	25 %	0 %	25 %	71910043
4039	NC_007297	AGCTA	2	10	235542	235551	40 %	20 %	20 %	20 %	71910043
4040	NC_007297	CAGA	2	8	235576	235583	50 %	0 %	25 %	25 %	71910043
4041	NC_007297	TGG	2	6	235622	235627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910043
4042	NC_007297	A	6	6	235630	235635	100 %	0 %	0 %	0 %	71910043
4043	NC_007297	ATA	2	6	235706	235711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
4044	NC_007297	AAG	2	6	235757	235762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910043
4045	NC_007297	AGC	2	6	235767	235772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
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4048	NC_007297	ACT	2	6	235960	235965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
4049	NC_007297	GAAAC	2	10	235990	235999	60 %	0 %	20 %	20 %	71910043
4050	NC_007297	GCT	2	6	236026	236031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4051	NC_007297	TTG	2	6	236060	236065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910043
4052	NC_007297	TCT	2	6	236161	236166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910043
4053	NC_007297	TGA	2	6	236193	236198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
4054	NC_007297	GTC	2	6	236227	236232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
4055	NC_007297	ACA	2	6	236576	236581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910044
4056	NC_007297	A	6	6	236587	236592	100 %	0 %	0 %	0 %	71910044
4057	NC_007297	A	6	6	236659	236664	100 %	0 %	0 %	0 %	71910044
4058	NC_007297	GTT	2	6	236767	236772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910044
4059	NC_007297	TCGT	2	8	236822	236829	0 %	50 %	25 %	25 %	71910044
4060	NC_007297	ATA	2	6	236904	236909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910044
4061	NC_007297	TA	3	6	236977	236982	50 %	50 %	0 %	0 %	71910045
4062	NC_007297	GCT	2	6	237042	237047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910045
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4064	NC_007297	ACA	2	6	237127	237132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910045
4065	NC_007297	GGT	2	6	237168	237173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910045
4066	NC_007297	CGT	2	6	237210	237215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910045
4067	NC_007297	ACA	2	6	237216	237221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910045
4068	NC_007297	GTTG	2	8	237232	237239	0 %	50 %	50 %	0 %	71910045
4069	NC_007297	GTG	2	6	237259	237264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910045
4070	NC_007297	AC	3	6	237266	237271	50 %	0 %	0 %	50 %	71910045
4071	NC_007297	TGC	2	6	237305	237310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910045
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4073	NC_007297	ACA	2	6	237840	237845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
4074	NC_007297	TAC	2	6	237858	237863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910046
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4077	NC_007297	GCAAGA	2	12	237926	237937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71910046
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4079	NC_007297	CAT	2	6	237998	238003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910046
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4081	NC_007297	TC	3	6	238047	238052	0 %	50 %	0 %	50 %	71910046
4082	NC_007297	CAA	2	6	238166	238171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
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4087	NC_007297	TGA	2	6	238427	238432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910046
4088	NC_007297	TGA	3	9	238438	238446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910046
4089	NC_007297	GAA	2	6	238461	238466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
4090	NC_007297	ACG	2	6	238474	238479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910046
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4092	NC_007297	CAA	2	6	238504	238509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
4093	NC_007297	TTC	2	6	238521	238526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910046
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4095	NC_007297	TGA	2	6	238673	238678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910046
4096	NC_007297	TGAC	2	8	238711	238718	25 %	25 %	25 %	25 %	71910046
4097	NC_007297	TTC	2	6	238740	238745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910046
4098	NC_007297	ACA	2	6	238908	238913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
4099	NC_007297	TGA	2	6	238931	238936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910046
4100	NC_007297	CAAGA	2	10	239019	239028	60 %	0 %	20 %	20 %	71910046
4101	NC_007297	GAA	2	6	239055	239060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
4102	NC_007297	AAAC	2	8	239080	239087	75 %	0 %	0 %	25 %	71910046
4103	NC_007297	TTG	2	6	239143	239148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910046
4104	NC_007297	CTC	2	6	239191	239196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71910046
4105	NC_007297	TTC	2	6	239244	239249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910046
4106	NC_007297	TGG	2	6	239261	239266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910046
4107	NC_007297	GAA	2	6	239310	239315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
4108	NC_007297	TTCGAA	2	12	239325	239336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71910046
4109	NC_007297	TGG	2	6	239348	239353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910046
4110	NC_007297	GCA	2	6	239511	239516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910046
4111	NC_007297	AGC	2	6	239534	239539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910046
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4113	NC_007297	AGA	2	6	239597	239602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
4114	NC_007297	TCG	2	6	239636	239641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910046
4115	NC_007297	TCGT	2	8	239683	239690	0 %	50 %	25 %	25 %	71910046
4116	NC_007297	TTC	2	6	239731	239736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910046
4117	NC_007297	ATG	2	6	239766	239771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910046
4118	NC_007297	AAG	2	6	239809	239814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
4119	NC_007297	ACC	2	6	239843	239848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71910046
4120	NC_007297	CCG	2	6	240244	240249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71910047
4121	NC_007297	TTG	2	6	240320	240325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910047
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4123	NC_007297	TCA	2	6	240402	240407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910047
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