MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 34557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007296	GCC	2	6	176782	176787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71902822
3002	NC_007296	A	6	6	176788	176793	100 %	0 %	0 %	0 %	71902822
3003	NC_007296	T	6	6	177026	177031	0 %	100 %	0 %	0 %	71902823
3004	NC_007296	ATG	2	6	177119	177124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902823
3005	NC_007296	TGG	2	6	177150	177155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902823
3006	NC_007296	ACC	2	6	177173	177178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71902823
3007	NC_007296	TTA	2	6	177289	177294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902823
3008	NC_007296	GTG	2	6	177387	177392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902823
3009	NC_007296	A	6	6	177443	177448	100 %	0 %	0 %	0 %	71902823
3010	NC_007296	GAA	2	6	177464	177469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3011	NC_007296	A	6	6	177492	177497	100 %	0 %	0 %	0 %	71902823
3012	NC_007296	ATA	2	6	177555	177560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902823
3013	NC_007296	A	6	6	177585	177590	100 %	0 %	0 %	0 %	71902823
3014	NC_007296	GAAA	2	8	177670	177677	75 %	0 %	25 %	0 %	71902823
3015	NC_007296	GAT	2	6	177761	177766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902823
3016	NC_007296	CT	3	6	177797	177802	0 %	50 %	0 %	50 %	71902823
3017	NC_007296	AAG	2	6	177891	177896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3018	NC_007296	CTG	2	6	177909	177914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3019	NC_007296	AGA	2	6	177928	177933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3020	NC_007296	TCT	2	6	177936	177941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902823
3021	NC_007296	CAT	2	6	177979	177984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902823
3022	NC_007296	TTG	2	6	178112	178117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902823
3023	NC_007296	ATG	2	6	178152	178157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902823
3024	NC_007296	AGA	2	6	178189	178194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3025	NC_007296	GAA	2	6	178241	178246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3026	NC_007296	TAT	2	6	178332	178337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902823
3027	NC_007296	ATT	2	6	178502	178507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902823
3028	NC_007296	TGGC	2	8	178536	178543	0 %	25 %	50 %	25 %	71902823
3029	NC_007296	AAG	2	6	178622	178627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902823
3030	NC_007296	TTG	2	6	178922	178927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902823
3031	NC_007296	TGC	2	6	178993	178998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3032	NC_007296	GT	3	6	179040	179045	0 %	50 %	50 %	0 %	71902823
3033	NC_007296	GCA	2	6	179060	179065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3034	NC_007296	CCG	2	6	179083	179088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71902823
3035	NC_007296	CGT	3	9	179285	179293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3036	NC_007296	GGT	2	6	179432	179437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902823
3037	NC_007296	TGC	2	6	179451	179456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3038	NC_007296	ATG	2	6	179466	179471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902823
3039	NC_007296	ATG	2	6	179493	179498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902823
3040	NC_007296	A	7	7	179512	179518	100 %	0 %	0 %	0 %	71902823
3041	NC_007296	GCT	2	6	179540	179545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902823
3042	NC_007296	GTT	2	6	179870	179875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902824
3043	NC_007296	CAG	2	6	179898	179903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902824
3044	NC_007296	GA	3	6	179988	179993	50 %	0 %	50 %	0 %	71902824
3045	NC_007296	AAG	2	6	180138	180143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902824
3046	NC_007296	GGCA	2	8	180163	180170	25 %	0 %	50 %	25 %	71902824
3047	NC_007296	TGA	2	6	180183	180188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902824
3048	NC_007296	CATT	2	8	180310	180317	25 %	50 %	0 %	25 %	71902825
3049	NC_007296	ATT	2	6	180404	180409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902825
3050	NC_007296	TAA	2	6	180505	180510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902825
3051	NC_007296	TGA	2	6	180526	180531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902825
3052	NC_007296	ACC	2	6	180569	180574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71902825
3053	NC_007296	GATGTT	2	12	180647	180658	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71902825
3054	NC_007296	AAG	2	6	180672	180677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902825
3055	NC_007296	TTTG	2	8	180924	180931	0 %	75 %	25 %	0 %	71902826
3056	NC_007296	TCTT	2	8	180951	180958	0 %	75 %	0 %	25 %	71902826
3057	NC_007296	CGT	2	6	180971	180976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902826
3058	NC_007296	GA	3	6	180998	181003	50 %	0 %	50 %	0 %	71902826
3059	NC_007296	CTT	2	6	181024	181029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902826
3060	NC_007296	GGA	2	6	181043	181048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902826
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3062	NC_007296	TGA	2	6	181069	181074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902826
3063	NC_007296	ATTTT	2	10	181169	181178	20 %	80 %	0 %	0 %	71902826
3064	NC_007296	GTG	2	6	181199	181204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902826
3065	NC_007296	GACA	2	8	181216	181223	50 %	0 %	25 %	25 %	71902826
3066	NC_007296	ATG	2	6	181478	181483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902827
3067	NC_007296	T	6	6	181503	181508	0 %	100 %	0 %	0 %	71902827
3068	NC_007296	CTT	2	6	181567	181572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902827
3069	NC_007296	GT	3	6	181622	181627	0 %	50 %	50 %	0 %	71902827
3070	NC_007296	TCA	2	6	181629	181634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902827
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3072	NC_007296	CTT	2	6	181688	181693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902827
3073	NC_007296	A	7	7	181704	181710	100 %	0 %	0 %	0 %	71902827
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3079	NC_007296	TAC	2	6	181866	181871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902827
3080	NC_007296	AGG	2	6	181892	181897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902827
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3082	NC_007296	A	6	6	181946	181951	100 %	0 %	0 %	0 %	71902827
3083	NC_007296	TCTTAT	2	12	182131	182142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71902827
3084	NC_007296	TCTAT	2	10	182157	182166	20 %	60 %	0 %	20 %	71902827
3085	NC_007296	AAT	2	6	182247	182252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902827
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3088	NC_007296	GGA	2	6	182476	182481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902827
3089	NC_007296	GGA	2	6	182487	182492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902827
3090	NC_007296	T	7	7	182579	182585	0 %	100 %	0 %	0 %	71902827
3091	NC_007296	TGA	2	6	182598	182603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902827
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3093	NC_007296	A	6	6	182667	182672	100 %	0 %	0 %	0 %	71902827
3094	NC_007296	GTTTG	2	10	182697	182706	0 %	60 %	40 %	0 %	71902827
3095	NC_007296	AG	3	6	182710	182715	50 %	0 %	50 %	0 %	71902827
3096	NC_007296	CAA	2	6	182716	182721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902827
3097	NC_007296	A	6	6	182720	182725	100 %	0 %	0 %	0 %	71902827
3098	NC_007296	TAG	2	6	182726	182731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902827
3099	NC_007296	TTA	2	6	182787	182792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902828
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3101	NC_007296	TTG	2	6	182964	182969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902828
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3103	NC_007296	ATA	2	6	183093	183098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902828
3104	NC_007296	ATG	2	6	183114	183119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902828
3105	NC_007296	TTGAT	2	10	183120	183129	20 %	60 %	20 %	0 %	71902828
3106	NC_007296	AATC	2	8	183269	183276	50 %	25 %	0 %	25 %	71902828
3107	NC_007296	AGA	2	6	183286	183291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902828
3108	NC_007296	T	6	6	183650	183655	0 %	100 %	0 %	0 %	71902829
3109	NC_007296	GA	3	6	183670	183675	50 %	0 %	50 %	0 %	71902829
3110	NC_007296	CAT	2	6	183770	183775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902829
3111	NC_007296	CT	3	6	183783	183788	0 %	50 %	0 %	50 %	71902829
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3113	NC_007296	TAT	2	6	183956	183961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902830
3114	NC_007296	TTGA	2	8	183966	183973	25 %	50 %	25 %	0 %	71902830
3115	NC_007296	CAAC	2	8	184018	184025	50 %	0 %	0 %	50 %	71902830
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3120	NC_007296	GAC	2	6	184388	184393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902831
3121	NC_007296	TGA	2	6	184447	184452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902831
3122	NC_007296	T	6	6	184527	184532	0 %	100 %	0 %	0 %	71902832
3123	NC_007296	AGA	2	6	184533	184538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902832
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3253	NC_007296	TAA	2	6	191198	191203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902839
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3498	NC_007296	TGT	2	6	205243	205248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902856
3499	NC_007296	ATG	2	6	205310	205315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902856
3500	NC_007296	ATT	2	6	205331	205336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902856

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