MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 34557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007296	TTG	2	6	318222	318227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902964
5502	NC_007296	GAA	2	6	318233	318238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902964
5503	NC_007296	CT	3	6	318311	318316	0 %	50 %	0 %	50 %	71902964
5504	NC_007296	TTTG	2	8	318348	318355	0 %	75 %	25 %	0 %	71902964
5505	NC_007296	AAG	2	6	318390	318395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902964
5506	NC_007296	TTG	2	6	318477	318482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902964
5507	NC_007296	ACAA	2	8	318486	318493	75 %	0 %	0 %	25 %	71902964
5508	NC_007296	TGA	2	6	318514	318519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902964
5509	NC_007296	ATT	2	6	318556	318561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902964
5510	NC_007296	A	6	6	318590	318595	100 %	0 %	0 %	0 %	71902964
5511	NC_007296	ACA	2	6	318626	318631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902964
5512	NC_007296	ATT	2	6	318633	318638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902964
5513	NC_007296	ATTG	2	8	318673	318680	25 %	50 %	25 %	0 %	71902964
5514	NC_007296	CAG	2	6	318699	318704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902964
5515	NC_007296	AGAA	2	8	318846	318853	75 %	0 %	25 %	0 %	71902965
5516	NC_007296	GAA	2	6	318915	318920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902965
5517	NC_007296	TTA	2	6	318958	318963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902965
5518	NC_007296	GAAG	2	8	319008	319015	50 %	0 %	50 %	0 %	71902965
5519	NC_007296	TAA	2	6	319052	319057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902965
5520	NC_007296	GT	3	6	319078	319083	0 %	50 %	50 %	0 %	71902965
5521	NC_007296	GATTG	2	10	319156	319165	20 %	40 %	40 %	0 %	71902965
5522	NC_007296	ATG	2	6	319195	319200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902965
5523	NC_007296	GAAAT	2	10	319231	319240	60 %	20 %	20 %	0 %	71902965
5524	NC_007296	GAAA	2	8	319280	319287	75 %	0 %	25 %	0 %	71902965
5525	NC_007296	ATCG	3	12	319378	319389	25 %	25 %	25 %	25 %	71902965
5526	NC_007296	A	7	7	319428	319434	100 %	0 %	0 %	0 %	71902965
5527	NC_007296	TAAA	2	8	319531	319538	75 %	25 %	0 %	0 %	71902965
5528	NC_007296	A	6	6	319536	319541	100 %	0 %	0 %	0 %	71902965
5529	NC_007296	A	6	6	319575	319580	100 %	0 %	0 %	0 %	71902965
5530	NC_007296	TGA	2	6	319581	319586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902965
5531	NC_007296	A	6	6	319586	319591	100 %	0 %	0 %	0 %	71902966
5532	NC_007296	CCT	2	6	319643	319648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71902966
5533	NC_007296	TGG	2	6	319765	319770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902966
5534	NC_007296	AGA	2	6	319786	319791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902966
5535	NC_007296	T	6	6	319991	319996	0 %	100 %	0 %	0 %	71902967
5536	NC_007296	GAC	2	6	320023	320028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902967
5537	NC_007296	CAA	2	6	320041	320046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902967
5538	NC_007296	A	6	6	320059	320064	100 %	0 %	0 %	0 %	71902967
5539	NC_007296	TGC	2	6	320134	320139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902967
5540	NC_007296	ATT	2	6	320159	320164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902967
5541	NC_007296	TGA	2	6	320185	320190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902967
5542	NC_007296	ATCA	2	8	320267	320274	50 %	25 %	0 %	25 %	71902967
5543	NC_007296	TAA	2	6	320314	320319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902967
5544	NC_007296	ATT	2	6	320355	320360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902967
5545	NC_007296	AGA	2	6	320392	320397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902967
5546	NC_007296	ATGA	2	8	320438	320445	50 %	25 %	25 %	0 %	71902967
5547	NC_007296	ACA	2	6	320509	320514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902967
5548	NC_007296	AAT	2	6	320565	320570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902967
5549	NC_007296	ATGATT	2	12	320899	320910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902968
5550	NC_007296	ATT	2	6	320959	320964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902968
5551	NC_007296	T	6	6	320976	320981	0 %	100 %	0 %	0 %	71902968
5552	NC_007296	TAT	2	6	320997	321002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902968
5553	NC_007296	TATCGC	2	12	321132	321143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71902968
5554	NC_007296	A	6	6	321182	321187	100 %	0 %	0 %	0 %	71902968
5555	NC_007296	TTA	2	6	321229	321234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902968
5556	NC_007296	GTT	2	6	321247	321252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902968
5557	NC_007296	ATG	2	6	321334	321339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902968
5558	NC_007296	TTG	2	6	321362	321367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902968
5559	NC_007296	ATG	2	6	321446	321451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902969
5560	NC_007296	ACAA	3	12	321452	321463	75 %	0 %	0 %	25 %	71902969
5561	NC_007296	CTT	2	6	321480	321485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902969
5562	NC_007296	T	6	6	321527	321532	0 %	100 %	0 %	0 %	71902969
5563	NC_007296	ATA	2	6	321555	321560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902969
5564	NC_007296	GTTA	2	8	321655	321662	25 %	50 %	25 %	0 %	71902969
5565	NC_007296	GCA	2	6	321737	321742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902969
5566	NC_007296	AAGACC	2	12	321775	321786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902969
5567	NC_007296	TGG	2	6	321811	321816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902969
5568	NC_007296	ATT	2	6	321875	321880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902969
5569	NC_007296	TTA	2	6	321947	321952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902969
5570	NC_007296	TTTA	2	8	322037	322044	25 %	75 %	0 %	0 %	71902969
5571	NC_007296	A	7	7	322395	322401	100 %	0 %	0 %	0 %	71902970
5572	NC_007296	GGA	2	6	322512	322517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902970
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5576	NC_007296	GCAT	2	8	322807	322814	25 %	25 %	25 %	25 %	71902970
5577	NC_007296	GAA	2	6	322848	322853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902970
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5579	NC_007296	TGC	2	6	323047	323052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902970
5580	NC_007296	TGA	2	6	323056	323061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902970
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5582	NC_007296	ATT	2	6	323133	323138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902970
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5584	NC_007296	T	6	6	323383	323388	0 %	100 %	0 %	0 %	71902971
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5591	NC_007296	TAT	2	6	323737	323742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902971
5592	NC_007296	TAT	2	6	323747	323752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902971
5593	NC_007296	ATG	2	6	323757	323762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902971
5594	NC_007296	TTA	2	6	323786	323791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902971
5595	NC_007296	AAAG	2	8	323814	323821	75 %	0 %	25 %	0 %	71902971
5596	NC_007296	T	6	6	323869	323874	0 %	100 %	0 %	0 %	71902971
5597	NC_007296	TAT	2	6	324011	324016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902972
5598	NC_007296	T	7	7	324016	324022	0 %	100 %	0 %	0 %	71902972
5599	NC_007296	GTT	2	6	324086	324091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902972
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5601	NC_007296	TC	3	6	324140	324145	0 %	50 %	0 %	50 %	71902972
5602	NC_007296	AGC	2	6	324169	324174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902972
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5604	NC_007296	TTG	2	6	324200	324205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902972
5605	NC_007296	T	6	6	324229	324234	0 %	100 %	0 %	0 %	71902972
5606	NC_007296	TTA	2	6	324261	324266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902972
5607	NC_007296	CTT	2	6	324294	324299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902972
5608	NC_007296	ATC	2	6	324359	324364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902972
5609	NC_007296	TAT	2	6	324466	324471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902972
5610	NC_007296	CTA	2	6	324522	324527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902972
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5612	NC_007296	TGA	2	6	324586	324591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902972
5613	NC_007296	GAA	2	6	324635	324640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902972
5614	NC_007296	TGA	2	6	324670	324675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902972
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5619	NC_007296	GAT	2	6	324935	324940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902972
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