MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 34557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	71902668
2	NC_007296	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	71902668
3	NC_007296	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
4	NC_007296	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
5	NC_007296	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
6	NC_007296	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
7	NC_007296	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	71902668
8	NC_007296	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902668
9	NC_007296	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
10	NC_007296	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
11	NC_007296	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	71902668
12	NC_007296	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
13	NC_007296	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	71902668
14	NC_007296	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
15	NC_007296	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
16	NC_007296	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	71902668
17	NC_007296	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
18	NC_007296	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
19	NC_007296	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
20	NC_007296	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
21	NC_007296	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
22	NC_007296	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71902668
23	NC_007296	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
24	NC_007296	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
25	NC_007296	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
26	NC_007296	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
27	NC_007296	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902668
28	NC_007296	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
29	NC_007296	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
30	NC_007296	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
31	NC_007296	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902669
32	NC_007296	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
33	NC_007296	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
34	NC_007296	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	71902669
35	NC_007296	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
36	NC_007296	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902669
37	NC_007296	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
38	NC_007296	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
39	NC_007296	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
40	NC_007296	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
41	NC_007296	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902669
42	NC_007296	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
43	NC_007296	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
44	NC_007296	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	71902669
45	NC_007296	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
46	NC_007296	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902669
47	NC_007296	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
48	NC_007296	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
49	NC_007296	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902669
50	NC_007296	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	71902669
51	NC_007296	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
52	NC_007296	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
53	NC_007296	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	71902669
54	NC_007296	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
55	NC_007296	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	71902670
56	NC_007296	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	71902670
57	NC_007296	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902670
58	NC_007296	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	71902670
59	NC_007296	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
60	NC_007296	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
61	NC_007296	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	71902671
62	NC_007296	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	71902671
63	NC_007296	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	71902671
64	NC_007296	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
65	NC_007296	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	71902671
66	NC_007296	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	71902671
67	NC_007296	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
68	NC_007296	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
69	NC_007296	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902671
70	NC_007296	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	71902671
71	NC_007296	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
72	NC_007296	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
73	NC_007296	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
74	NC_007296	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
75	NC_007296	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
76	NC_007296	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
77	NC_007296	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
78	NC_007296	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902671
79	NC_007296	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
80	NC_007296	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
81	NC_007296	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
82	NC_007296	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
83	NC_007296	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
84	NC_007296	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902672
85	NC_007296	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902672
86	NC_007296	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	71902672
87	NC_007296	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
88	NC_007296	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
89	NC_007296	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
90	NC_007296	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
91	NC_007296	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
92	NC_007296	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
93	NC_007296	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902672
94	NC_007296	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
95	NC_007296	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
96	NC_007296	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
97	NC_007296	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
98	NC_007296	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	71902672
99	NC_007296	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	71902672
100	NC_007296	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
101	NC_007296	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71902673
102	NC_007296	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
103	NC_007296	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
104	NC_007296	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
105	NC_007296	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
106	NC_007296	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
107	NC_007296	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
108	NC_007296	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
109	NC_007296	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
110	NC_007296	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
111	NC_007296	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
112	NC_007296	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
113	NC_007296	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
114	NC_007296	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
115	NC_007296	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
116	NC_007296	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
117	NC_007296	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
118	NC_007296	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
119	NC_007296	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	71902673
120	NC_007296	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
121	NC_007296	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902673
122	NC_007296	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902673
123	NC_007296	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
124	NC_007296	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	71902673
125	NC_007296	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
126	NC_007296	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
127	NC_007296	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	71902673
128	NC_007296	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	71902673
129	NC_007296	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
130	NC_007296	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902673
131	NC_007296	GATTCA	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902673
132	NC_007296	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902673
133	NC_007296	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902673
134	NC_007296	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
135	NC_007296	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
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137	NC_007296	ATTTTC	2	12	6979	6990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71902673
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