MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 39665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_007181	TAC	3	9	2164710	2164718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608026
38502	NC_007181	CAA	2	6	2164734	2164739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70608026
38503	NC_007181	ACA	2	6	2164793	2164798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70608026
38504	NC_007181	AACCA	2	10	2164816	2164825	60 %	0 %	0 %	40 %	70608026
38505	NC_007181	TGC	2	6	2164869	2164874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70608026
38506	NC_007181	CAGAC	2	10	2165133	2165142	40 %	0 %	20 %	40 %	70608026
38507	NC_007181	TTTAT	2	10	2165200	2165209	20 %	80 %	0 %	0 %	70608026
38508	NC_007181	AT	3	6	2165222	2165227	50 %	50 %	0 %	0 %	70608026
38509	NC_007181	ATAAG	2	10	2165239	2165248	60 %	20 %	20 %	0 %	70608026
38510	NC_007181	G	7	7	2165253	2165259	0 %	0 %	100 %	0 %	70608026
38511	NC_007181	ACA	2	6	2165276	2165281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70608026
38512	NC_007181	ATT	2	6	2165341	2165346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70608026
38513	NC_007181	ATAC	2	8	2165380	2165387	50 %	25 %	0 %	25 %	70608026
38514	NC_007181	CTG	2	6	2165407	2165412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70608026
38515	NC_007181	AT	3	6	2165511	2165516	50 %	50 %	0 %	0 %	70608026
38516	NC_007181	AGG	2	6	2165537	2165542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70608026
38517	NC_007181	CTT	2	6	2165544	2165549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70608026
38518	NC_007181	AT	3	6	2165821	2165826	50 %	50 %	0 %	0 %	70608027
38519	NC_007181	AGA	2	6	2165841	2165846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70608027
38520	NC_007181	TAG	2	6	2165883	2165888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608027
38521	NC_007181	ATA	2	6	2165915	2165920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608027
38522	NC_007181	AGT	2	6	2165929	2165934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608027
38523	NC_007181	TCA	2	6	2166029	2166034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608027
38524	NC_007181	TA	4	8	2166040	2166047	50 %	50 %	0 %	0 %	70608027
38525	NC_007181	TATTAA	2	12	2166100	2166111	50 %	50 %	0 %	0 %	70608027
38526	NC_007181	TC	3	6	2166213	2166218	0 %	50 %	0 %	50 %	70608027
38527	NC_007181	CAT	2	6	2166225	2166230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608027
38528	NC_007181	GATAA	2	10	2166291	2166300	60 %	20 %	20 %	0 %	70608027
38529	NC_007181	TA	3	6	2166891	2166896	50 %	50 %	0 %	0 %	70608028
38530	NC_007181	CAGA	2	8	2166909	2166916	50 %	0 %	25 %	25 %	70608028
38531	NC_007181	ATAGA	2	10	2166937	2166946	60 %	20 %	20 %	0 %	70608028
38532	NC_007181	AC	3	6	2167003	2167008	50 %	0 %	0 %	50 %	70608028
38533	NC_007181	ATAGCA	2	12	2167164	2167175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70608028
38534	NC_007181	G	6	6	2167218	2167223	0 %	0 %	100 %	0 %	70608028
38535	NC_007181	TAA	2	6	2167324	2167329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608028
38536	NC_007181	AGG	2	6	2167358	2167363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70608028
38537	NC_007181	GTA	2	6	2167375	2167380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608028
38538	NC_007181	TGAC	2	8	2167384	2167391	25 %	25 %	25 %	25 %	70608028
38539	NC_007181	TCTAT	2	10	2167459	2167468	20 %	60 %	0 %	20 %	70608028
38540	NC_007181	AGA	2	6	2167469	2167474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70608028
38541	NC_007181	ATT	2	6	2167599	2167604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70608028
38542	NC_007181	AGGA	2	8	2167745	2167752	50 %	0 %	50 %	0 %	70608028
38543	NC_007181	GT	3	6	2167838	2167843	0 %	50 %	50 %	0 %	70608028
38544	NC_007181	AGAT	2	8	2167894	2167901	50 %	25 %	25 %	0 %	70608028
38545	NC_007181	TC	3	6	2167963	2167968	0 %	50 %	0 %	50 %	70608028
38546	NC_007181	AGGA	2	8	2168028	2168035	50 %	0 %	50 %	0 %	70608028
38547	NC_007181	GAGGAA	2	12	2168094	2168105	50 %	0 %	50 %	0 %	70608028
38548	NC_007181	TAA	2	6	2168164	2168169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608028
38549	NC_007181	TAA	2	6	2168185	2168190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608028
38550	NC_007181	CAC	2	6	2168209	2168214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70608028
38551	NC_007181	TGA	2	6	2168381	2168386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608028
38552	NC_007181	TGA	2	6	2168513	2168518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608028
38553	NC_007181	GTT	2	6	2168574	2168579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70608028
38554	NC_007181	TGA	2	6	2168609	2168614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608028
38555	NC_007181	GAA	2	6	2168686	2168691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70608028
38556	NC_007181	TCC	2	6	2168712	2168717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70608028
38557	NC_007181	GCA	2	6	2168892	2168897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70608028
38558	NC_007181	GTA	2	6	2169083	2169088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608029
38559	NC_007181	AAG	2	6	2169158	2169163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70608029
38560	NC_007181	ACT	2	6	2169217	2169222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608029
38561	NC_007181	TAAAA	2	10	2169238	2169247	80 %	20 %	0 %	0 %	70608029
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38563	NC_007181	TGA	2	6	2169307	2169312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608029
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38566	NC_007181	ATG	2	6	2169459	2169464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70608029
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38568	NC_007181	GTT	2	6	2169688	2169693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70608029
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38571	NC_007181	AATTGC	2	12	2169856	2169867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70608029
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38574	NC_007181	AG	3	6	2169947	2169952	50 %	0 %	50 %	0 %	70608029
38575	NC_007181	GAG	2	6	2170043	2170048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70608029
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38577	NC_007181	TC	3	6	2170062	2170067	0 %	50 %	0 %	50 %	70608029
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38582	NC_007181	CGG	2	6	2170501	2170506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	70608029
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38587	NC_007181	AT	3	6	2170720	2170725	50 %	50 %	0 %	0 %	70608029
38588	NC_007181	CAAAG	2	10	2170792	2170801	60 %	0 %	20 %	20 %	70608029
38589	NC_007181	ATT	2	6	2170816	2170821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70608029
38590	NC_007181	GA	3	6	2170924	2170929	50 %	0 %	50 %	0 %	70608029
38591	NC_007181	A	6	6	2170979	2170984	100 %	0 %	0 %	0 %	70608029
38592	NC_007181	TAA	2	6	2171048	2171053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608030
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38595	NC_007181	GAG	2	6	2171247	2171252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70608030
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38601	NC_007181	CTA	2	6	2171587	2171592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608030
38602	NC_007181	TC	3	6	2171674	2171679	0 %	50 %	0 %	50 %	70608030
38603	NC_007181	CAT	2	6	2171696	2171701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608030
38604	NC_007181	AT	3	6	2171704	2171709	50 %	50 %	0 %	0 %	70608030
38605	NC_007181	TTA	2	6	2171715	2171720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70608030
38606	NC_007181	CTC	2	6	2171766	2171771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70608030
38607	NC_007181	TTGGA	2	10	2171815	2171824	20 %	40 %	40 %	0 %	70608030
38608	NC_007181	CT	3	6	2171884	2171889	0 %	50 %	0 %	50 %	70608031
38609	NC_007181	AAT	2	6	2171910	2171915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608031
38610	NC_007181	AAAG	2	8	2172014	2172021	75 %	0 %	25 %	0 %	70608031
38611	NC_007181	AAT	2	6	2172190	2172195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70608031
38612	NC_007181	GA	3	6	2172237	2172242	50 %	0 %	50 %	0 %	70608031
38613	NC_007181	ACT	2	6	2172255	2172260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70608031
38614	NC_007181	AGA	2	6	2172280	2172285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70608031
38615	NC_007181	AT	3	6	2172307	2172312	50 %	50 %	0 %	0 %	70608031
38616	NC_007181	AGG	2	6	2172327	2172332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70608031
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