MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeC

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007171	AGT	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
2	NC_007171	TAA	2	6	637	642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
3	NC_007171	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535051
4	NC_007171	CTTAA	2	10	767	776	40 %	40 %	0 %	20 %	68535051
5	NC_007171	TA	3	6	779	784	50 %	50 %	0 %	0 %	68535051
6	NC_007171	ATTT	2	8	811	818	25 %	75 %	0 %	0 %	68535051
7	NC_007171	GAA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
8	NC_007171	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
9	NC_007171	ATGA	2	8	1067	1074	50 %	25 %	25 %	0 %	68535051
10	NC_007171	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
11	NC_007171	AAT	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
12	NC_007171	A	6	6	1157	1162	100 %	0 %	0 %	0 %	68535051
13	NC_007171	CCCAA	2	10	1248	1257	40 %	0 %	0 %	60 %	68535051
14	NC_007171	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	68535051
15	NC_007171	AGA	3	9	1333	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
16	NC_007171	AAC	3	9	1359	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
17	NC_007171	ACA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
18	NC_007171	T	6	6	1518	1523	0 %	100 %	0 %	0 %	68535052
19	NC_007171	TAA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535052
20	NC_007171	CAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535052
21	NC_007171	AACA	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	68535052
22	NC_007171	CCT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	68535053
23	NC_007171	TATAA	2	10	1657	1666	60 %	40 %	0 %	0 %	68535053
24	NC_007171	TTA	2	6	1993	1998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
25	NC_007171	TAT	3	9	2037	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
26	NC_007171	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
27	NC_007171	AAT	2	6	2083	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
28	NC_007171	CAAT	2	8	2102	2109	50 %	25 %	0 %	25 %	68535054
29	NC_007171	TA	3	6	2130	2135	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
30	NC_007171	AAC	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
31	NC_007171	CAA	2	6	2225	2230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
32	NC_007171	A	7	7	2229	2235	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
33	NC_007171	ATA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
34	NC_007171	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
35	NC_007171	ATA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
36	NC_007171	T	6	6	2355	2360	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
37	NC_007171	T	7	7	2366	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
38	NC_007171	TAC	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
39	NC_007171	ATA	2	6	2417	2422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
40	NC_007171	TTATA	2	10	2441	2450	40 %	60 %	0 %	0 %	68535054
41	NC_007171	GTAG	2	8	2467	2474	25 %	25 %	50 %	0 %	68535054
42	NC_007171	A	6	6	2499	2504	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
43	NC_007171	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
44	NC_007171	TTCA	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	68535054
45	NC_007171	TAA	3	9	2621	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
46	NC_007171	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
47	NC_007171	ATA	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
48	NC_007171	A	6	6	2656	2661	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
49	NC_007171	TA	3	6	2673	2678	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
50	NC_007171	TAC	3	9	2696	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
51	NC_007171	AAT	2	6	2845	2850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
52	NC_007171	CAAA	2	8	2861	2868	75 %	0 %	0 %	25 %	68535054
53	NC_007171	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
54	NC_007171	CA	3	6	2888	2893	50 %	0 %	0 %	50 %	68535054
55	NC_007171	T	7	7	2937	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
56	NC_007171	TATAAA	2	12	2994	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
57	NC_007171	TA	4	8	3077	3084	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
58	NC_007171	A	6	6	3102	3107	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
59	NC_007171	CTT	3	9	3168	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
60	NC_007171	T	7	7	3175	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
61	NC_007171	TCA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
62	NC_007171	CTT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
63	NC_007171	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
64	NC_007171	CTT	2	6	3252	3257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
65	NC_007171	T	7	7	3262	3268	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
66	NC_007171	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
67	NC_007171	ATC	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
68	NC_007171	AAAG	2	8	3299	3306	75 %	0 %	25 %	0 %	68535055
69	NC_007171	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535055
70	NC_007171	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
71	NC_007171	ACT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
72	NC_007171	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535055
73	NC_007171	TTC	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
74	NC_007171	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
75	NC_007171	TATGA	2	10	3487	3496	40 %	40 %	20 %	0 %	68535055
76	NC_007171	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
77	NC_007171	TTG	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535055
78	NC_007171	T	8	8	3601	3608	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
79	NC_007171	A	6	6	3804	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
80	NC_007171	A	7	7	3831	3837	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
81	NC_007171	AAGT	2	8	3867	3874	50 %	25 %	25 %	0 %	68535056
82	NC_007171	AAGA	2	8	3891	3898	75 %	0 %	25 %	0 %	68535056
83	NC_007171	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
84	NC_007171	GAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535056
85	NC_007171	TCT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535056
86	NC_007171	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
87	NC_007171	ATA	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
88	NC_007171	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535056
89	NC_007171	AT	4	8	4133	4140	50 %	50 %	0 %	0 %	68535056
90	NC_007171	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535056
91	NC_007171	CAAAG	2	10	4216	4225	60 %	0 %	20 %	20 %	68535056
92	NC_007171	A	6	6	4227	4232	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
93	NC_007171	TGA	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
94	NC_007171	GCA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535056
95	NC_007171	TAAT	2	8	4328	4335	50 %	50 %	0 %	0 %	68535056
96	NC_007171	ATGA	2	8	4414	4421	50 %	25 %	25 %	0 %	68535056
97	NC_007171	TATAT	2	10	4432	4441	40 %	60 %	0 %	0 %	68535056
98	NC_007171	AAAT	2	8	4503	4510	75 %	25 %	0 %	0 %	68535057
99	NC_007171	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	68535057
100	NC_007171	AAC	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535057
101	NC_007171	ACT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535057
102	NC_007171	AAAG	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	68535057
103	NC_007171	ATA	2	6	4794	4799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
104	NC_007171	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	68535057
105	NC_007171	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
106	NC_007171	A	6	6	4911	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	68535057
107	NC_007171	TGA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535057
108	NC_007171	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
109	NC_007171	AG	3	6	5038	5043	50 %	0 %	50 %	0 %	68535057
110	NC_007171	TAA	2	6	5053	5058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
111	NC_007171	GAC	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535057
112	NC_007171	CTTTAA	2	12	5130	5141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68535057
113	NC_007171	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
114	NC_007171	TTAT	2	8	5185	5192	25 %	75 %	0 %	0 %	68535057
115	NC_007171	CCAA	2	8	5214	5221	50 %	0 %	0 %	50 %	68535057
116	NC_007171	ATT	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
117	NC_007171	TATG	2	8	5370	5377	25 %	50 %	25 %	0 %	68535057
118	NC_007171	TGC	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535057
119	NC_007171	AT	3	6	5421	5426	50 %	50 %	0 %	0 %	68535057
120	NC_007171	CAT	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535057
121	NC_007171	TTA	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
122	NC_007171	A	6	6	5575	5580	100 %	0 %	0 %	0 %	68535057
123	NC_007171	ATTAA	2	10	5582	5591	60 %	40 %	0 %	0 %	68535057
124	NC_007171	GAA	2	6	5606	5611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
125	NC_007171	TA	3	6	5619	5624	50 %	50 %	0 %	0 %	68535057
126	NC_007171	TGA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535058
127	NC_007171	AAAT	2	8	5919	5926	75 %	25 %	0 %	0 %	68535058
128	NC_007171	TTAAAG	2	12	6019	6030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	68535058
129	NC_007171	CAAC	2	8	6192	6199	50 %	0 %	0 %	50 %	68535058
130	NC_007171	AATAT	2	10	6233	6242	60 %	40 %	0 %	0 %	68535058
131	NC_007171	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535059
132	NC_007171	T	7	7	6302	6308	0 %	100 %	0 %	0 %	68535059
133	NC_007171	TTCT	2	8	6340	6347	0 %	75 %	0 %	25 %	68535059
134	NC_007171	GAT	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535059
135	NC_007171	CAA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535059
136	NC_007171	CGA	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535060
137	NC_007171	GAA	2	6	6529	6534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535060
138	NC_007171	A	6	6	6533	6538	100 %	0 %	0 %	0 %	68535060
139	NC_007171	AGT	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535060
140	NC_007171	ATT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535060
141	NC_007171	ATC	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535060
142	NC_007171	CATA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	0 %	25 %	68535060
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.