MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_006905	TGC	2	6	1058510	1058515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179513
19003	NC_006905	GCC	2	6	1058568	1058573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179513
19004	NC_006905	TGC	2	6	1058590	1058595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179513
19005	NC_006905	TGT	2	6	1058612	1058617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179513
19006	NC_006905	CTGG	2	8	1058672	1058679	0 %	25 %	50 %	25 %	62179513
19007	NC_006905	CGC	2	6	1058742	1058747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179513
19008	NC_006905	CG	3	6	1058805	1058810	0 %	0 %	50 %	50 %	62179513
19009	NC_006905	GGA	2	6	1058831	1058836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179513
19010	NC_006905	TGG	2	6	1058922	1058927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179513
19011	NC_006905	TTTA	2	8	1058960	1058967	25 %	75 %	0 %	0 %	62179513
19012	NC_006905	CCG	2	6	1058968	1058973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179513
19013	NC_006905	GTT	2	6	1058985	1058990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179513
19014	NC_006905	GCG	2	6	1058993	1058998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179513
19015	NC_006905	GAT	2	6	1059048	1059053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179513
19016	NC_006905	ATA	2	6	1059100	1059105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179513
19017	NC_006905	GC	4	8	1059106	1059113	0 %	0 %	50 %	50 %	62179513
19018	NC_006905	TGGC	2	8	1059138	1059145	0 %	25 %	50 %	25 %	62179513
19019	NC_006905	TAC	2	6	1059150	1059155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179513
19020	NC_006905	CCTGA	2	10	1059168	1059177	20 %	20 %	20 %	40 %	62179513
19021	NC_006905	CAG	3	9	1059204	1059212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179513
19022	NC_006905	ATT	2	6	1059213	1059218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179513
19023	NC_006905	TCT	2	6	1059263	1059268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179513
19024	NC_006905	GCG	2	6	1059411	1059416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179513
19025	NC_006905	TGC	2	6	1059439	1059444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179513
19026	NC_006905	TAT	2	6	1059448	1059453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179513
19027	NC_006905	GGA	2	6	1059533	1059538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179513
19028	NC_006905	TGC	2	6	1059596	1059601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179513
19029	NC_006905	CG	3	6	1059616	1059621	0 %	0 %	50 %	50 %	62179513
19030	NC_006905	GGA	2	6	1059738	1059743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179514
19031	NC_006905	ATC	2	6	1059751	1059756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179514
19032	NC_006905	ATC	2	6	1059768	1059773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179514
19033	NC_006905	AATT	2	8	1059823	1059830	50 %	50 %	0 %	0 %	62179514
19034	NC_006905	TGA	2	6	1059911	1059916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179514
19035	NC_006905	TCG	2	6	1059933	1059938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179515
19036	NC_006905	TCA	2	6	1059939	1059944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179515
19037	NC_006905	GC	3	6	1060034	1060039	0 %	0 %	50 %	50 %	62179515
19038	NC_006905	ATT	2	6	1060058	1060063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179515
19039	NC_006905	GGC	2	6	1060109	1060114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179515
19040	NC_006905	CG	3	6	1060128	1060133	0 %	0 %	50 %	50 %	62179515
19041	NC_006905	CGA	2	6	1060192	1060197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179515
19042	NC_006905	GAT	2	6	1060231	1060236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179515
19043	NC_006905	CGG	2	6	1060239	1060244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179515
19044	NC_006905	TTA	2	6	1060245	1060250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179515
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19046	NC_006905	CGA	2	6	1060398	1060403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179515
19047	NC_006905	GATCGC	2	12	1060412	1060423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	62179515
19048	NC_006905	CG	3	6	1060487	1060492	0 %	0 %	50 %	50 %	62179515
19049	NC_006905	CCG	2	6	1060501	1060506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179515
19050	NC_006905	A	6	6	1060581	1060586	100 %	0 %	0 %	0 %	62179515
19051	NC_006905	GTCGCC	2	12	1060592	1060603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	62179515
19052	NC_006905	CCG	2	6	1060632	1060637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179515
19053	NC_006905	TGGAA	2	10	1060879	1060888	40 %	20 %	40 %	0 %	62179517
19054	NC_006905	TTG	2	6	1060913	1060918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179517
19055	NC_006905	GCA	2	6	1061044	1061049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179517
19056	NC_006905	TGC	2	6	1061148	1061153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179517
19057	NC_006905	GC	3	6	1061192	1061197	0 %	0 %	50 %	50 %	62179517
19058	NC_006905	GAC	2	6	1061350	1061355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179517
19059	NC_006905	CTTC	2	8	1061426	1061433	0 %	50 %	0 %	50 %	62179517
19060	NC_006905	CTGC	2	8	1061482	1061489	0 %	25 %	25 %	50 %	62179517
19061	NC_006905	GA	3	6	1061563	1061568	50 %	0 %	50 %	0 %	62179517
19062	NC_006905	CG	3	6	1061633	1061638	0 %	0 %	50 %	50 %	62179517
19063	NC_006905	GGC	2	6	1061661	1061666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179517
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19066	NC_006905	ATCG	2	8	1061888	1061895	25 %	25 %	25 %	25 %	62179518
19067	NC_006905	GAAA	2	8	1061941	1061948	75 %	0 %	25 %	0 %	62179518
19068	NC_006905	ATC	2	6	1061949	1061954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179518
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19070	NC_006905	CGG	3	9	1062019	1062027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179518
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19085	NC_006905	CTTT	2	8	1062511	1062518	0 %	75 %	0 %	25 %	62179518
19086	NC_006905	TGA	2	6	1062685	1062690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179519
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19088	NC_006905	GGCG	2	8	1062791	1062798	0 %	0 %	75 %	25 %	62179519
19089	NC_006905	CGG	3	9	1062820	1062828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179519
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19091	NC_006905	TCTG	2	8	1062886	1062893	0 %	50 %	25 %	25 %	62179519
19092	NC_006905	CG	4	8	1062908	1062915	0 %	0 %	50 %	50 %	62179519
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19100	NC_006905	GCGT	2	8	1063287	1063294	0 %	25 %	50 %	25 %	62179519
19101	NC_006905	GT	3	6	1063293	1063298	0 %	50 %	50 %	0 %	62179519
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19474	NC_006905	TCG	2	6	1092353	1092358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179543
19475	NC_006905	CTG	2	6	1092397	1092402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179543
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19483	NC_006905	TCA	2	6	1092684	1092689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179543
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