MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_006905	CGC	2	6	949742	949747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179416
17003	NC_006905	CGG	2	6	949763	949768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179416
17004	NC_006905	AGCC	2	8	949851	949858	25 %	0 %	25 %	50 %	62179416
17005	NC_006905	TCG	2	6	949970	949975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17006	NC_006905	CTT	2	6	950088	950093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179417
17007	NC_006905	CGA	2	6	950106	950111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17008	NC_006905	GTTGCA	2	12	950166	950177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62179417
17009	NC_006905	CTT	2	6	950196	950201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179417
17010	NC_006905	AGC	2	6	950268	950273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17011	NC_006905	GC	3	6	950287	950292	0 %	0 %	50 %	50 %	62179417
17012	NC_006905	AGC	2	6	950309	950314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17013	NC_006905	TCT	2	6	950324	950329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179417
17014	NC_006905	GC	3	6	950407	950412	0 %	0 %	50 %	50 %	62179417
17015	NC_006905	TCA	2	6	950442	950447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179417
17016	NC_006905	CAT	2	6	950529	950534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179417
17017	NC_006905	GGGTAG	2	12	950543	950554	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	62179417
17018	NC_006905	CGGTG	2	10	950646	950655	0 %	20 %	60 %	20 %	62179417
17019	NC_006905	TCGCT	2	10	950733	950742	0 %	40 %	20 %	40 %	62179417
17020	NC_006905	GGC	2	6	950760	950765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179417
17021	NC_006905	GAT	2	6	950791	950796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179417
17022	NC_006905	GCG	2	6	950853	950858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179417
17023	NC_006905	GCTTCG	2	12	950904	950915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17024	NC_006905	ATG	2	6	950923	950928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179417
17025	NC_006905	TGC	2	6	950933	950938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179417
17026	NC_006905	GATCT	2	10	950998	951007	20 %	40 %	20 %	20 %	62179417
17027	NC_006905	TTACC	2	10	951036	951045	20 %	40 %	0 %	40 %	62179417
17028	NC_006905	TCAG	2	8	951179	951186	25 %	25 %	25 %	25 %	62179417
17029	NC_006905	TGG	2	6	951248	951253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179417
17030	NC_006905	TGG	2	6	953048	953053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179418
17031	NC_006905	AT	3	6	953107	953112	50 %	50 %	0 %	0 %	62179418
17032	NC_006905	TTAGAA	2	12	953169	953180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	62179418
17033	NC_006905	TGA	2	6	953239	953244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179418
17034	NC_006905	GAA	2	6	953255	953260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179418
17035	NC_006905	GTT	2	6	953297	953302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179418
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17038	NC_006905	CT	3	6	953395	953400	0 %	50 %	0 %	50 %	62179418
17039	NC_006905	ATATT	2	10	953457	953466	40 %	60 %	0 %	0 %	62179418
17040	NC_006905	GCAA	2	8	953472	953479	50 %	0 %	25 %	25 %	62179418
17041	NC_006905	GAT	2	6	953489	953494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179418
17042	NC_006905	GCA	2	6	953519	953524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179418
17043	NC_006905	CTG	2	6	953586	953591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179418
17044	NC_006905	GGA	2	6	953606	953611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179418
17045	NC_006905	CTGC	2	8	953633	953640	0 %	25 %	25 %	50 %	62179418
17046	NC_006905	TTA	2	6	953697	953702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179418
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17050	NC_006905	GCT	2	6	953836	953841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179418
17051	NC_006905	A	6	6	953851	953856	100 %	0 %	0 %	0 %	62179418
17052	NC_006905	GAA	2	6	953858	953863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179418
17053	NC_006905	AGG	2	6	953875	953880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179418
17054	NC_006905	CTT	2	6	953890	953895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179419
17055	NC_006905	GATATA	2	12	953976	953987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	62179419
17056	NC_006905	TATT	2	8	954055	954062	25 %	75 %	0 %	0 %	62179419
17057	NC_006905	T	6	6	954122	954127	0 %	100 %	0 %	0 %	62179419
17058	NC_006905	A	6	6	954182	954187	100 %	0 %	0 %	0 %	62179419
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17075	NC_006905	TGA	2	6	955196	955201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179421
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17101	NC_006905	TGAA	2	8	956954	956961	50 %	25 %	25 %	0 %	62179422
17102	NC_006905	TTACTG	2	12	957022	957033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	62179422
17103	NC_006905	GTA	2	6	957226	957231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179422
17104	NC_006905	GCA	2	6	957260	957265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179422
17105	NC_006905	A	6	6	957358	957363	100 %	0 %	0 %	0 %	62179422
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17107	NC_006905	GGGT	2	8	957501	957508	0 %	25 %	75 %	0 %	62179422
17108	NC_006905	ATC	2	6	957515	957520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179422
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17111	NC_006905	AC	3	6	957613	957618	50 %	0 %	0 %	50 %	62179422
17112	NC_006905	CAAT	2	8	957674	957681	50 %	25 %	0 %	25 %	62179422
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17489	NC_006905	CAT	2	6	979167	979172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179442
17490	NC_006905	ATC	2	6	979195	979200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179442
17491	NC_006905	CGG	2	6	979226	979231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179442
17492	NC_006905	ATT	2	6	979348	979353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179442
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