MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_006905	GAA	2	6	844093	844098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15003	NC_006905	GCG	2	6	844099	844104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15004	NC_006905	GCG	3	9	844108	844116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15005	NC_006905	GAA	2	6	844122	844127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15006	NC_006905	A	6	6	844126	844131	100 %	0 %	0 %	0 %	62179321
15007	NC_006905	GGC	2	6	844143	844148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15008	NC_006905	GCG	3	9	844153	844161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15009	NC_006905	GAA	3	9	844167	844175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15010	NC_006905	GAA	3	9	844212	844220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15011	NC_006905	GCG	2	6	844234	844239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15012	NC_006905	GCG	3	9	844243	844251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15013	NC_006905	GAA	3	9	844257	844265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15014	NC_006905	GCG	2	6	844279	844284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15015	NC_006905	GCG	3	9	844288	844296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15016	NC_006905	GAA	3	9	844302	844310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15017	NC_006905	GCG	2	6	844324	844329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15018	NC_006905	GCG	3	9	844333	844341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15019	NC_006905	GAA	3	9	844347	844355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15020	NC_006905	GGC	2	6	844368	844373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15021	NC_006905	GCG	3	9	844378	844386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15022	NC_006905	GAA	3	9	844392	844400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179321
15023	NC_006905	CGG	2	6	844412	844417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
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15025	NC_006905	A	6	6	844441	844446	100 %	0 %	0 %	0 %	62179321
15026	NC_006905	GCC	2	6	844450	844455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179321
15027	NC_006905	CGA	2	6	844467	844472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179321
15028	NC_006905	CGG	3	9	844515	844523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15029	NC_006905	ATG	2	6	844646	844651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179321
15030	NC_006905	GCG	2	6	844733	844738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15031	NC_006905	GGC	2	6	844755	844760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15032	NC_006905	GGC	2	6	844767	844772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179321
15033	NC_006905	ATG	2	6	844975	844980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179322
15034	NC_006905	GCG	2	6	845023	845028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179322
15035	NC_006905	TGC	2	6	845030	845035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179322
15036	NC_006905	GGGCC	2	10	845108	845117	0 %	0 %	60 %	40 %	62179322
15037	NC_006905	CGG	2	6	845139	845144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179322
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15039	NC_006905	GCA	2	6	845208	845213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179322
15040	NC_006905	GCCA	2	8	845214	845221	25 %	0 %	25 %	50 %	62179322
15041	NC_006905	GTT	2	6	845275	845280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179322
15042	NC_006905	GGC	2	6	845341	845346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179322
15043	NC_006905	GC	3	6	845345	845350	0 %	0 %	50 %	50 %	62179322
15044	NC_006905	GT	3	6	845525	845530	0 %	50 %	50 %	0 %	62179322
15045	NC_006905	GC	3	6	845717	845722	0 %	0 %	50 %	50 %	62179322
15046	NC_006905	ACGG	2	8	845827	845834	25 %	0 %	50 %	25 %	62179322
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15049	NC_006905	GCG	2	6	845944	845949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179322
15050	NC_006905	CAG	2	6	845994	845999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179322
15051	NC_006905	ATGGTA	2	12	846013	846024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179322
15052	NC_006905	GCA	3	9	846039	846047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179322
15053	NC_006905	GTC	2	6	846090	846095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179322
15054	NC_006905	GGGAT	2	10	846163	846172	20 %	20 %	60 %	0 %	62179322
15055	NC_006905	GCCT	2	8	846246	846253	0 %	25 %	25 %	50 %	62179322
15056	NC_006905	ATA	2	6	846270	846275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179322
15057	NC_006905	TGA	2	6	846333	846338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179323
15058	NC_006905	CCTG	2	8	846343	846350	0 %	25 %	25 %	50 %	62179323
15059	NC_006905	TTC	2	6	846370	846375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179323
15060	NC_006905	CAA	2	6	846376	846381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179323
15061	NC_006905	AACGGC	2	12	846446	846457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179323
15062	NC_006905	GCA	2	6	846493	846498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179323
15063	NC_006905	GCA	2	6	846502	846507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179323
15064	NC_006905	AAC	2	6	846509	846514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179323
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15066	NC_006905	CGT	2	6	846677	846682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179323
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15073	NC_006905	GCAGC	2	10	847154	847163	20 %	0 %	40 %	40 %	62179324
15074	NC_006905	CAG	2	6	847164	847169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179324
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15085	NC_006905	A	6	6	847456	847461	100 %	0 %	0 %	0 %	62179324
15086	NC_006905	AAAGCG	2	12	847538	847549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	62179324
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15090	NC_006905	TGG	2	6	849008	849013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179325
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15094	NC_006905	CGC	2	6	849111	849116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179325
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15099	NC_006905	GACA	2	8	849409	849416	50 %	0 %	25 %	25 %	62179325
15100	NC_006905	A	8	8	849519	849526	100 %	0 %	0 %	0 %	62179325
15101	NC_006905	CGC	2	6	849563	849568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179325
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15103	NC_006905	TTA	2	6	849614	849619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179325
15104	NC_006905	GGC	2	6	849621	849626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179325
15105	NC_006905	TCT	2	6	849674	849679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179325
15106	NC_006905	GCA	2	6	849687	849692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179325
15107	NC_006905	GC	3	6	849758	849763	0 %	0 %	50 %	50 %	62179325
15108	NC_006905	GGCGC	2	10	849823	849832	0 %	0 %	60 %	40 %	62179325
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15119	NC_006905	ATGGC	2	10	850273	850282	20 %	20 %	40 %	20 %	62179326
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15121	NC_006905	TGA	2	6	850310	850315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179326
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15476	NC_006905	GTACG	2	10	867967	867976	20 %	20 %	40 %	20 %	62179342
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15478	NC_006905	CG	3	6	867982	867987	0 %	0 %	50 %	50 %	62179342
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15481	NC_006905	GC	4	8	868132	868139	0 %	0 %	50 %	50 %	62179342
15482	NC_006905	CG	3	6	868198	868203	0 %	0 %	50 %	50 %	62179343
15483	NC_006905	ACGG	2	8	868279	868286	25 %	0 %	50 %	25 %	62179343
15484	NC_006905	GCA	2	6	868296	868301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179343
15485	NC_006905	GCG	2	6	868302	868307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179343
15486	NC_006905	GTGC	2	8	868317	868324	0 %	25 %	50 %	25 %	62179343
15487	NC_006905	TTC	2	6	868342	868347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179343
15488	NC_006905	GC	3	6	868359	868364	0 %	0 %	50 %	50 %	62179343
15489	NC_006905	GGAA	2	8	868386	868393	50 %	0 %	50 %	0 %	62179343
15490	NC_006905	CGCCAG	2	12	868435	868446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	62179343
15491	NC_006905	AG	3	6	868445	868450	50 %	0 %	50 %	0 %	62179343
15492	NC_006905	GCT	2	6	868455	868460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179343
15493	NC_006905	CGC	2	6	868525	868530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179343
15494	NC_006905	CAC	2	6	868540	868545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179343
15495	NC_006905	GCCA	2	8	868547	868554	25 %	0 %	25 %	50 %	62179343
15496	NC_006905	CCA	2	6	868611	868616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179343
15497	NC_006905	GCT	2	6	868629	868634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179343
15498	NC_006905	ATGCGG	2	12	868711	868722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62179343
15499	NC_006905	CGC	2	6	868738	868743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179343
15500	NC_006905	CGG	2	6	868791	868796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179343

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